151 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_1515 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007575  Suden_1515  quinol dehydrogenase periplasmic component  100 
 
 
274 aa  566  1e-160  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.000000000252998  n/a   
 
 
 
NC_013512  Sdel_0725  MauM/NapG family ferredoxin-type protein  65 
 
 
271 aa  355  3.9999999999999996e-97  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0157367  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0439  quinol dehydrogenase periplasmic component  64.5 
 
 
264 aa  352  4e-96  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000708697  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0867  quinol dehydrogenase periplasmic component  55.86 
 
 
255 aa  294  1e-78  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1929  quinol dehydrogenase periplasmic component  53.12 
 
 
255 aa  293  2e-78  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.385843  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1717  quinol dehydrogenase periplasmic component  53.63 
 
 
251 aa  287  1e-76  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1160  quinol dehydrogenase periplasmic component  49.4 
 
 
250 aa  260  1e-68  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0746915  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1017  quinol dehydrogenase periplasmic component  48.43 
 
 
249 aa  254  8e-67  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.963512  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0872  quinol dehydrogenase periplasmic component  47.79 
 
 
246 aa  244  9.999999999999999e-64  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0802  quinol dehydrogenase periplasmic component  47.79 
 
 
246 aa  244  9.999999999999999e-64  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.208725  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3164  ferredoxin-type protein NapG  50.43 
 
 
270 aa  227  2e-58  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02132  quinol dehydrogenase periplasmic component  49.11 
 
 
231 aa  223  2e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.192803  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02091  hypothetical protein  49.11 
 
 
231 aa  223  2e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.181289  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1454  MauM/NapG family ferredoxin-type protein  49.11 
 
 
231 aa  223  2e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2343  quinol dehydrogenase periplasmic component  49.11 
 
 
231 aa  223  2e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2504  quinol dehydrogenase periplasmic component  49.11 
 
 
231 aa  223  2e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1445  quinol dehydrogenase periplasmic component  49.11 
 
 
231 aa  223  2e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2353  quinol dehydrogenase periplasmic component  49.11 
 
 
231 aa  223  2e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0736  quinol dehydrogenase periplasmic component  49.11 
 
 
231 aa  223  4e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2498  quinol dehydrogenase periplasmic component  48.66 
 
 
231 aa  222  4.9999999999999996e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00441878 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3342  quinol dehydrogenase periplasmic component  48.66 
 
 
231 aa  222  6e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.379134  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3839  quinol dehydrogenase periplasmic component  47.86 
 
 
290 aa  221  9e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2393  quinol dehydrogenase periplasmic component  48.21 
 
 
231 aa  221  9.999999999999999e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1590  periplasmic nitrate reductase subunit NapG  49.55 
 
 
256 aa  221  9.999999999999999e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2484  quinol dehydrogenase periplasmic component  48.21 
 
 
231 aa  221  9.999999999999999e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2442  quinol dehydrogenase periplasmic component  47.77 
 
 
231 aa  219  3.9999999999999997e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.426735 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2601  quinol dehydrogenase periplasmic component  48.21 
 
 
231 aa  218  7.999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.334591 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2984  quinol dehydrogenase periplasmic component  46.46 
 
 
241 aa  217  2e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0622  quinol dehydrogenase periplasmic component  47.22 
 
 
244 aa  217  2e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1507  quinol dehydrogenase periplasmic component  49.78 
 
 
250 aa  212  4.9999999999999996e-54  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4008  quinol dehydrogenase periplasmic component  47.33 
 
 
299 aa  210  2e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3207  quinol dehydrogenase periplasmic component  44.3 
 
 
243 aa  209  5e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3958  quinol dehydrogenase periplasmic component  44.59 
 
 
244 aa  208  7e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0389498 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3221  hypothetical protein  46.7 
 
 
263 aa  206  3e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2412  quinol dehydrogenase periplasmic component  45.21 
 
 
230 aa  204  1e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1342  MauM/NapG family ferredoxin-type protein  51.81 
 
 
239 aa  204  1e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.961353 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3319  quinol dehydrogenase periplasmic component  44.26 
 
 
244 aa  201  9e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2716  quinol dehydrogenase periplasmic component  45.21 
 
 
230 aa  201  9.999999999999999e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0847  quinol dehydrogenase periplasmic component  42.61 
 
 
244 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001237  ferredoxin-type protein NapG (periplasmic nitrate reductase)  49.07 
 
 
256 aa  200  1.9999999999999998e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0703  quinol dehydrogenase periplasmic component  43.83 
 
 
244 aa  200  3e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3431  quinol dehydrogenase periplasmic component  43.35 
 
 
244 aa  199  3e-50  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3149  quinol dehydrogenase periplasmic component  43.04 
 
 
244 aa  199  3.9999999999999996e-50  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0861746  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0557  MauM/NapG family ferredoxin-type protein  42.86 
 
 
220 aa  192  3e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4737  MauM/NapG family ferredoxin-type protein  49.51 
 
 
224 aa  187  1e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.242853  normal  0.472407 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0554  MauM/NapG family ferredoxin-type protein  43.95 
 
 
234 aa  187  2e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1057  MauM/NapG family ferredoxin-type protein  45.32 
 
 
222 aa  180  2e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07580  4Fe-4S protein  44.62 
 
 
221 aa  158  1e-37  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.353777 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1738  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  40.86 
 
 
204 aa  148  1.0000000000000001e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.850071  normal  0.0241918 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1290  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  38.62 
 
 
470 aa  133  3e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1287  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  32.77 
 
 
192 aa  102  9e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0618  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  38.18 
 
 
174 aa  101  2e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1566  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  31 
 
 
290 aa  100  3e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00608017  normal  0.574816 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1301  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  31.3 
 
 
246 aa  99  7e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0121453  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0347  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  34.62 
 
 
507 aa  90.1  3e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.326177  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3028  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  32.72 
 
 
221 aa  89  7e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1640  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  34.55 
 
 
524 aa  88.2  1e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0443  iron-sulfur protein  30.04 
 
 
224 aa  84.3  0.000000000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.442554  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0492  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  33.02 
 
 
213 aa  82  0.00000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.363621 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0006  iron-sulfur protein  30.09 
 
 
220 aa  80.9  0.00000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.00000466888  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3963  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  36.11 
 
 
528 aa  80.9  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000774467 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2764  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  34.81 
 
 
211 aa  80.5  0.00000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.936882 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16850  4Fe-4S protein  28.76 
 
 
242 aa  80.5  0.00000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.459268  normal  0.811902 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0561  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  30.28 
 
 
591 aa  79.7  0.00000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.125705 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3875  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  35.56 
 
 
528 aa  79.7  0.00000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1790  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  32.5 
 
 
229 aa  79  0.00000000000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2681  iron-sulfur cluster-binding protein  35.39 
 
 
518 aa  77.4  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27410  4Fe-4S protein  30.8 
 
 
206 aa  75.9  0.0000000000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2107  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  36.84 
 
 
504 aa  74.3  0.000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0116  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  30.86 
 
 
247 aa  73.9  0.000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06170  4Fe-4S protein  27.94 
 
 
226 aa  74.3  0.000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2987  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  36.09 
 
 
510 aa  74.3  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2713  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  28.76 
 
 
656 aa  73.6  0.000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.875426 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0478  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  30.33 
 
 
213 aa  72  0.00000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0610  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  33.54 
 
 
209 aa  70.1  0.00000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.260421  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22790  Fe-S-cluster-containing hydrogenase subunit  31.64 
 
 
219 aa  65.5  0.0000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1161  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  31.05 
 
 
519 aa  65.1  0.000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2648  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  29.94 
 
 
538 aa  60.1  0.00000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.111219  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1329  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  31.91 
 
 
645 aa  57  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.2343  normal  0.019579 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3167  ferredoxin-type protein napF  32.69 
 
 
170 aa  57  0.0000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2610  ferredoxin-type protein NapF  27.27 
 
 
158 aa  54.3  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.326175  hitchhiker  0.000000545081 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2677  ferredoxin-type protein NapF  27.27 
 
 
158 aa  54.3  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.131835  hitchhiker  0.000399612 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1663  ferredoxin-type protein NapF  27.54 
 
 
161 aa  53.9  0.000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1512  ferredoxin-type protein NapF  28.83 
 
 
160 aa  52.8  0.000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0688671  normal  0.812249 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1481  ferredoxin-type protein NapF  28.83 
 
 
160 aa  52.4  0.000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000195514  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0962  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  33.13 
 
 
588 aa  52  0.00001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2713  ferredoxin-type protein NapF  29.49 
 
 
178 aa  50.4  0.00003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1452  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  28.48 
 
 
189 aa  50.4  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1340  putative ferredoxin-type protein NapF  28.48 
 
 
189 aa  49.7  0.00005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2720  putative ferredoxin-type protein NapF  28.48 
 
 
189 aa  49.7  0.00005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1476  ferredoxin-type protein NapF  28.22 
 
 
160 aa  49.3  0.00006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000676016  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0260  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  27.17 
 
 
228 aa  49.3  0.00006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2871  ferredoxin-type protein NapF  28.22 
 
 
160 aa  48.9  0.00008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000173737  hitchhiker  0.000000902156 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3544  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  28.74 
 
 
552 aa  48.9  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.531585  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0774  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  25.27 
 
 
394 aa  48.9  0.0001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.290777  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4011  ferredoxin-type protein NapF  31.67 
 
 
188 aa  48.9  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20870  Fe-S-cluster-containing hydrogenase subunit  32.74 
 
 
204 aa  47.4  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1271  ferredoxin-type protein NapF  24.55 
 
 
167 aa  48.1  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.853171  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2793  ferredoxin-type protein NapF  24.55 
 
 
167 aa  48.1  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.167014 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1385  ferredoxin-type protein NapF  24.55 
 
 
167 aa  48.1  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.570523  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>