209 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_4011 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_4011  ferredoxin-type protein NapF  100 
 
 
188 aa  363  1e-100  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4000  periplasmic nitrate reductase maturation protein NapF  57.52 
 
 
159 aa  174  6e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.692634 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3488  ferredoxin-type protein NapF  54.25 
 
 
165 aa  162  3e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.104519  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2409  ferredoxin-type protein NapF  48.54 
 
 
178 aa  154  7e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2713  ferredoxin-type protein NapF  48.08 
 
 
178 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1442  ferredoxin-type protein  46.5 
 
 
164 aa  144  7.0000000000000006e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2346  ferredoxin-type protein  46.5 
 
 
164 aa  144  7.0000000000000006e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02135  ferredoxin-type protein, predicted role in electron transfer to periplasmic nitrate reductase (NapA)  45.86 
 
 
164 aa  144  1e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02094  hypothetical protein  45.86 
 
 
164 aa  144  1e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2793  ferredoxin-type protein NapF  48.08 
 
 
167 aa  143  1e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.167014 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1385  ferredoxin-type protein NapF  48.08 
 
 
167 aa  143  1e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.570523  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1271  ferredoxin-type protein NapF  48.08 
 
 
167 aa  143  1e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.853171  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1593  periplasmic nitrate reductase maturation protein NapF  46.41 
 
 
187 aa  141  5e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0733  ferredoxin-type protein  46.75 
 
 
164 aa  141  5e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1451  ferredoxin-type protein NapF  46.75 
 
 
164 aa  141  6e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3345  ferredoxin-type protein  46.75 
 
 
164 aa  141  6e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0931001  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2507  ferredoxin-type protein  46.75 
 
 
164 aa  141  6e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2356  ferredoxin-type protein  45.86 
 
 
164 aa  141  6e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000511  nitrate reductase  47.44 
 
 
161 aa  140  9.999999999999999e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2445  ferredoxin-type protein  45.28 
 
 
163 aa  139  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.399328 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2604  ferredoxin-type protein  45.28 
 
 
163 aa  139  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.760741  normal  0.656417 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2396  ferredoxin-type protein  45.28 
 
 
163 aa  139  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2487  ferredoxin-type protein  45.75 
 
 
163 aa  138  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2368  ferredoxin-type protein NapF  43.64 
 
 
172 aa  137  7e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.957681  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05379  ferredoxin-type protein  47.1 
 
 
161 aa  137  7e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2610  ferredoxin-type protein NapF  44.23 
 
 
158 aa  135  5e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.326175  hitchhiker  0.000000545081 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2677  ferredoxin-type protein NapF  44.23 
 
 
158 aa  135  5e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.131835  hitchhiker  0.000399612 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1445  ferredoxin-type protein NapF  43.12 
 
 
159 aa  134  5e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000171683  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1432  ferredoxin-type protein NapF  44.65 
 
 
158 aa  135  5e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00178513  normal  0.390259 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1663  ferredoxin-type protein NapF  41.25 
 
 
161 aa  134  6.0000000000000005e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2784  ferredoxin-type protein NapF  43.59 
 
 
161 aa  132  3.9999999999999996e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.9279  hitchhiker  0.000480705 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1326  ferredoxin-type protein NapF  45.45 
 
 
161 aa  131  5e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1712  ferredoxin-type protein NapF  40.26 
 
 
163 aa  131  6.999999999999999e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00359598  normal  0.496256 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1512  ferredoxin-type protein NapF  43.23 
 
 
160 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0688671  normal  0.812249 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2933  ferredoxin-type protein NapF  40.49 
 
 
162 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000053627  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1476  ferredoxin-type protein NapF  43.23 
 
 
160 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000676016  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1481  ferredoxin-type protein NapF  43.23 
 
 
160 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000195514  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_3988  hypothetical protein  47.2 
 
 
160 aa  128  5.0000000000000004e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0935811  normal  0.360541 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2598  ferredoxin-type protein NapF  46.43 
 
 
161 aa  127  9.000000000000001e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0615  iron-sulfur cluster-binding protein NapF  39.13 
 
 
168 aa  126  2.0000000000000002e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2871  ferredoxin-type protein NapF  41.94 
 
 
160 aa  126  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000173737  hitchhiker  0.000000902156 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2176  ferredoxin-type protein NapF  40.91 
 
 
159 aa  123  2e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.455284  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2225  ferredoxin-type protein NapF  47.1 
 
 
165 aa  122  3e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000128219  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1383  ferredoxin-type protein NapF  40.12 
 
 
168 aa  122  3e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4203  ferredoxin protein NapF  46.75 
 
 
163 aa  122  4e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.197134  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1059  ferredoxin-type protein NapF  36.48 
 
 
182 aa  119  3e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49220  ferredoxin protein NapF  46.5 
 
 
163 aa  119  3e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.36196  hitchhiker  0.00430686 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5178  ferredoxin-type protein NapF  45.86 
 
 
166 aa  114  6e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.818564  normal  0.868281 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4114  periplasmic nitrate reductase maturation protein NapF  45.62 
 
 
160 aa  108  5e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3224  hypothetical protein  41.1 
 
 
163 aa  105  5e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.998418 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3167  ferredoxin-type protein napF  39.61 
 
 
170 aa  96.7  2e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0442  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  36.17 
 
 
179 aa  83.2  0.000000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000111137  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02503  ferredoxin  34.76 
 
 
165 aa  81.6  0.000000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0728  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  33.55 
 
 
171 aa  80.1  0.00000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.00000860866  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2940  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  52.63 
 
 
104 aa  77.8  0.00000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0610  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  37.86 
 
 
209 aa  77.4  0.0000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.260421  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07580  4Fe-4S protein  32.91 
 
 
221 aa  76.6  0.0000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.353777 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1518  periplasmic nitrate reductase maturation protein NapF  32.43 
 
 
160 aa  76.3  0.0000000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000119119  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2764  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  36.99 
 
 
211 aa  72  0.000000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.936882 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0116  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  36.71 
 
 
247 aa  71.6  0.000000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2713  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  38.92 
 
 
656 aa  70.1  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.875426 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0703  quinol dehydrogenase periplasmic component  37.72 
 
 
244 aa  69.3  0.00000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3431  quinol dehydrogenase periplasmic component  37.65 
 
 
244 aa  69.3  0.00000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0847  quinol dehydrogenase periplasmic component  37.13 
 
 
244 aa  68.9  0.00000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0478  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  35.46 
 
 
213 aa  68.9  0.00000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3319  quinol dehydrogenase periplasmic component  37.72 
 
 
244 aa  68.9  0.00000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1738  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  35.57 
 
 
204 aa  68.9  0.00000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.850071  normal  0.0241918 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3028  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  34.27 
 
 
221 aa  68.9  0.00000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2107  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  31.98 
 
 
504 aa  68.2  0.00000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27410  4Fe-4S protein  30.59 
 
 
206 aa  67.4  0.0000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22790  Fe-S-cluster-containing hydrogenase subunit  32.26 
 
 
219 aa  66.2  0.0000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3149  quinol dehydrogenase periplasmic component  36.53 
 
 
244 aa  65.9  0.0000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0861746  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0492  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  30.97 
 
 
213 aa  64.7  0.0000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.363621 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2648  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  30.52 
 
 
538 aa  63.5  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.111219  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1017  quinol dehydrogenase periplasmic component  28.9 
 
 
249 aa  63.5  0.000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.963512  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0622  quinol dehydrogenase periplasmic component  35.26 
 
 
244 aa  62  0.000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0774  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  29.55 
 
 
394 aa  62.4  0.000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.290777  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1290  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  28.86 
 
 
470 aa  61.6  0.000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16850  4Fe-4S protein  28.7 
 
 
242 aa  61.2  0.000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.459268  normal  0.811902 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3839  quinol dehydrogenase periplasmic component  29.19 
 
 
290 aa  61.2  0.000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0554  MauM/NapG family ferredoxin-type protein  36.24 
 
 
234 aa  61.2  0.000000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0557  MauM/NapG family ferredoxin-type protein  34.23 
 
 
220 aa  61.2  0.000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2720  putative ferredoxin-type protein NapF  27.01 
 
 
189 aa  60.5  0.00000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4737  MauM/NapG family ferredoxin-type protein  34.9 
 
 
224 aa  60.5  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.242853  normal  0.472407 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1452  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  27.01 
 
 
189 aa  60.8  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1640  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  36.18 
 
 
524 aa  60.5  0.00000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3958  quinol dehydrogenase periplasmic component  33.55 
 
 
244 aa  60.5  0.00000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0389498 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1340  putative ferredoxin-type protein NapF  27.01 
 
 
189 aa  60.5  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1507  quinol dehydrogenase periplasmic component  33.99 
 
 
250 aa  60.5  0.00000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1160  quinol dehydrogenase periplasmic component  32.18 
 
 
250 aa  60.5  0.00000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0746915  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2984  quinol dehydrogenase periplasmic component  33.55 
 
 
241 aa  60.1  0.00000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3221  hypothetical protein  34.84 
 
 
263 aa  60.1  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1790  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  35.62 
 
 
229 aa  58.9  0.00000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1717  quinol dehydrogenase periplasmic component  31.01 
 
 
251 aa  58.9  0.00000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3207  quinol dehydrogenase periplasmic component  32.9 
 
 
243 aa  58.2  0.00000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1590  periplasmic nitrate reductase subunit NapG  33.84 
 
 
256 aa  57.8  0.00000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1515  quinol dehydrogenase periplasmic component  31.28 
 
 
274 aa  57.8  0.0000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.000000000252998  n/a   
 
 
 
NC_010814  Glov_1057  MauM/NapG family ferredoxin-type protein  31.1 
 
 
222 aa  57.4  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06170  4Fe-4S protein  28.66 
 
 
226 aa  56.6  0.0000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1929  quinol dehydrogenase periplasmic component  32.34 
 
 
255 aa  57  0.0000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.385843  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>