76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9211_12991 on replicon NC_009976
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9211



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009976  P9211_12991  ferredoxin  100 
 
 
341 aa  707    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.165246 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0599  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  26.06 
 
 
386 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1231  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  27.95 
 
 
365 aa  99  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.520201  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1202  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  27.67 
 
 
365 aa  97.4  3e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4554  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  26.95 
 
 
373 aa  97.8  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0624  light dependent period  29.34 
 
 
352 aa  94  3e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.167467 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0125  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  26.89 
 
 
383 aa  94.4  3e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17671  Fe-S-cluster-containing hydrogenase components 2  31.08 
 
 
335 aa  91.7  2e-17  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.506517  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1652  hypothetical protein  29.81 
 
 
335 aa  86.3  6e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.42119  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20051  Fe-S-cluster-containing hydrogenase components 2  25.86 
 
 
340 aa  84.3  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0456807  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3014  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  30.62 
 
 
405 aa  82.4  0.000000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00920835 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1131  hypothetical protein  25.99 
 
 
340 aa  82.4  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17511  Fe-S-cluster-containing hydrogenase components 2  28.79 
 
 
335 aa  82  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17421  Fe-S-cluster-containing hydrogenase components 2  28.04 
 
 
318 aa  80.1  0.00000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0378  putative LdpA protein  26.01 
 
 
343 aa  79.7  0.00000000000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.955391  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1952  putative LdpA protein  26.53 
 
 
343 aa  78.2  0.0000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23001  Fe-S-cluster-containing hydrogenase components 2  26.1 
 
 
323 aa  68.6  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2071  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur-binding domain-containing protein  30.13 
 
 
394 aa  62  0.00000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3885  sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  49.02 
 
 
759 aa  51.2  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3802  putative sigma54 specific transcriptional regulator  49.02 
 
 
759 aa  50.8  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1529  MinD family protein  38.46 
 
 
288 aa  49.7  0.00007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00592522  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1212  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  35 
 
 
655 aa  48.9  0.0001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1400  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  32.74 
 
 
696 aa  48.1  0.0002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2099  NADH dehydrogenase (quinone)  40 
 
 
634 aa  47.4  0.0003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0860011  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4176  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  38.57 
 
 
755 aa  47.8  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000648689  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1384  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  41.27 
 
 
369 aa  47  0.0005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.794372 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0852  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  48.08 
 
 
280 aa  46.6  0.0006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0830  putative electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  43.94 
 
 
280 aa  46.6  0.0006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.214006  normal  0.116452 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2077  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  40 
 
 
368 aa  46.6  0.0006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.917974 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0881  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  42.86 
 
 
275 aa  46.2  0.0007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00161363  hitchhiker  0.0000224711 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1990  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  45.28 
 
 
129 aa  45.4  0.001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.544476  normal  0.369186 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0886  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  39.68 
 
 
373 aa  45.4  0.001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.38221  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1717  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  41.38 
 
 
369 aa  45.8  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.682287  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0055  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  41.18 
 
 
756 aa  45.4  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.928801 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1334  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  29.35 
 
 
368 aa  45.4  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0262596 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1492  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  46.81 
 
 
247 aa  45.1  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.229965  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2721  hypothetical protein  33.33 
 
 
369 aa  45.1  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.504995  decreased coverage  0.0000694638 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0099  NADH dehydrogenase (quinone)  44 
 
 
597 aa  44.7  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.953797  hitchhiker  0.000000556523 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20700  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  37.5 
 
 
370 aa  45.4  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.921643  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3363  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  44.44 
 
 
763 aa  44.3  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4065  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  33.33 
 
 
713 aa  44.7  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.929518  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1912  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  43.75 
 
 
552 aa  44.3  0.003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0471  NADH dehydrogenase (quinone)  48.98 
 
 
620 aa  44.3  0.003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00000177124  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003497  iron-sulfur cluster-binding protein  33.33 
 
 
553 aa  44.3  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2990  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  46.67 
 
 
179 aa  43.9  0.004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02274  ferredoxin  38.6 
 
 
553 aa  43.9  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0843  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  55 
 
 
206 aa  43.9  0.004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.463441  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0092  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  40.82 
 
 
1013 aa  43.5  0.005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0644  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  36.84 
 
 
68 aa  43.5  0.005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000788909  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2239  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  36.36 
 
 
371 aa  43.5  0.005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000624735 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2345  response regulator receiver protein  39.34 
 
 
1143 aa  43.5  0.005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.932515  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4107  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  40 
 
 
290 aa  43.5  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.975487  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1852  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  34.92 
 
 
368 aa  43.5  0.006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.200113  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3019  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  43.14 
 
 
107 aa  43.1  0.006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000147702 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07910  NADH:ubiquinone oxidoreductase chain I-like protein  30.84 
 
 
447 aa  43.1  0.006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00100576 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1133  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  41.18 
 
 
107 aa  43.1  0.007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.874606  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2759  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase alpha subunit  44 
 
 
589 aa  43.1  0.007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.532665 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1036  pyruvate ferredoxin/flavodoxin oxidoreductase  28.4 
 
 
1218 aa  43.1  0.007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.483594  normal  0.696073 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0046  putative ferredoxin  39.06 
 
 
472 aa  43.1  0.007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.65936  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0697  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  40.82 
 
 
196 aa  43.1  0.007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1607  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  44.64 
 
 
399 aa  42.7  0.008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2100  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  50 
 
 
56 aa  42.7  0.008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000000421595  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1518  ferredoxin I  41.18 
 
 
107 aa  43.1  0.008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0825  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  42.86 
 
 
292 aa  43.1  0.008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17490  ferredoxin I  41.18 
 
 
107 aa  43.1  0.008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.15892  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2088  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  43.14 
 
 
107 aa  43.1  0.008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2245  ferredoxin  42.11 
 
 
341 aa  42.7  0.009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.666336 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1060  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  38.71 
 
 
129 aa  42.7  0.009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.768979  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38650  Ferredoxin I  41.18 
 
 
107 aa  42.7  0.009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0776  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  47.73 
 
 
253 aa  42.7  0.009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2365  ferredoxin  42.11 
 
 
339 aa  42.7  0.009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3735  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  41.18 
 
 
107 aa  42.7  0.01  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000118523 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4051  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  41.18 
 
 
107 aa  42.7  0.01  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.236209  hitchhiker  0.00000000456067 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1874  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  31.75 
 
 
362 aa  42.4  0.01  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1357  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  32.97 
 
 
502 aa  42.7  0.01  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3660.1  ferredoxin  35.38 
 
 
346 aa  42.4  0.01  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>