25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9515_17421 on replicon NC_008817
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9515



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008817  P9515_17421  Fe-S-cluster-containing hydrogenase components 2  100 
 
 
318 aa  652    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1652  hypothetical protein  78.19 
 
 
335 aa  523  1e-147  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.42119  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17511  Fe-S-cluster-containing hydrogenase components 2  78.5 
 
 
335 aa  523  1e-147  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17671  Fe-S-cluster-containing hydrogenase components 2  77.81 
 
 
335 aa  517  1.0000000000000001e-145  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.506517  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20051  Fe-S-cluster-containing hydrogenase components 2  50 
 
 
340 aa  316  4e-85  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0456807  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1131  hypothetical protein  50 
 
 
340 aa  315  8e-85  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1952  putative LdpA protein  44.62 
 
 
343 aa  300  2e-80  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0378  putative LdpA protein  45.57 
 
 
343 aa  294  2e-78  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.955391  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23001  Fe-S-cluster-containing hydrogenase components 2  46.52 
 
 
323 aa  291  7e-78  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0624  light dependent period  37.23 
 
 
352 aa  232  6e-60  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.167467 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1231  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  38.9 
 
 
365 aa  232  7.000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.520201  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1202  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  38.62 
 
 
365 aa  230  2e-59  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4554  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  35.31 
 
 
373 aa  223  3e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0125  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  35.5 
 
 
383 aa  219  3.9999999999999997e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0599  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  33.62 
 
 
386 aa  204  2e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3014  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  36.84 
 
 
405 aa  188  1e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00920835 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2071  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur-binding domain-containing protein  34.64 
 
 
394 aa  186  3e-46  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12991  ferredoxin  28.04 
 
 
341 aa  80.1  0.00000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.165246 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1179  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  35.71 
 
 
211 aa  48.5  0.0001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0090  ferredoxin hydrogenase  36 
 
 
484 aa  45.4  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0498  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  39.29 
 
 
212 aa  43.5  0.004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0839  formate dehydrogenase, alpha subunit  30.38 
 
 
946 aa  43.5  0.005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.331727  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0996  hydrogenase large subunit domain protein  39.66 
 
 
454 aa  43.5  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000195829  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0727  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.65 
 
 
979 aa  42.7  0.008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0216931  normal  0.398444 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0007  putative ATPase RIL  38.46 
 
 
584 aa  42.4  0.01  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>