32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_1952 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_1952  putative LdpA protein  100 
 
 		 343 aa  686    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0378  putative LdpA protein  68.51 
 
 		 343 aa  453  1.0000000000000001e-126  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.955391  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1131  hypothetical protein  57.01 
 
 		 340 aa  405  1.0000000000000001e-112  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23001  Fe-S-cluster-containing hydrogenase components 2  65.52 
 
 		 323 aa  400  9.999999999999999e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20051  Fe-S-cluster-containing hydrogenase components 2  57.8 
 
 		 340 aa  399  9.999999999999999e-111  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0456807  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17671  Fe-S-cluster-containing hydrogenase components 2  44.79 
 
 		 335 aa  313  1.9999999999999998e-84  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.506517  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17511  Fe-S-cluster-containing hydrogenase components 2  43.96 
 
 		 335 aa  308  1.0000000000000001e-82  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1652  hypothetical protein  43.34 
 
 		 335 aa  306  3e-82  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.42119  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17421  Fe-S-cluster-containing hydrogenase components 2  44.62 
 
 		 318 aa  300  2e-80  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0624  light dependent period  47.6 
 
 		 352 aa  253  3e-66  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.167467 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1231  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  40.28 
 
 		 365 aa  246  4e-64  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.520201  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1202  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  40 
 
 		 365 aa  244  9.999999999999999e-64  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4554  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  40.49 
 
 		 373 aa  229  7e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0125  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  38.2 
 
 		 383 aa  228  2e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0599  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  40.73 
 
 		 386 aa  211  2e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3014  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  36.39 
 
 		 405 aa  204  2e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00920835 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2071  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur-binding domain-containing protein  36.32 
 
 		 394 aa  181  2e-44  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12991  ferredoxin  26.53 
 
 		 341 aa  78.2  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.165246 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0477  hydrogenase large subunit  28.42 
 
 		 478 aa  48.9  0.0001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2623  NADH ubiquinone oxidoreductase 20 kDa subunit  29.94 
 
 		 263 aa  46.6  0.0006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1687  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  58.33 
 
 		 293 aa  45.1  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2281  ferredoxin hydrogenase  31.46 
 
 		 439 aa  43.9  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2337  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  35.14 
 
 		 251 aa  43.9  0.004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1067  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  28.66 
 
 		 260 aa  43.5  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.6291900000000003e-28 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1371  hydrogenase large subunit domain protein  31.58 
 
 		 508 aa  43.5  0.005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000870686  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0863  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  34.48 
 
 		 261 aa  43.5  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00010196  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0681  Fe-S-cluster-containing hydrogenase components 1-like  47.17 
 
 		 285 aa  43.5  0.006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4011  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  31.25 
 
 		 671 aa  43.1  0.007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3519  twin-arginine translocation pathway signal  35.23 
 
 		 257 aa  43.1  0.007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000081919  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2310  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  37.31 
 
 		 258 aa  43.1  0.008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5827  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  33.82 
 
 		 320 aa  42.7  0.01  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.235411  normal  0.0867479 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3465  hydrogenase large subunit domain protein  30.38 
 
 		 488 aa  42.7  0.01  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>