45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_0125 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_0125  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  100 
 
 
383 aa  791    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2071  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur-binding domain-containing protein  70.63 
 
 
394 aa  561  1e-158  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3014  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  57 
 
 
405 aa  443  1e-123  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00920835 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1231  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  57.07 
 
 
365 aa  436  1e-121  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.520201  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4554  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  58.53 
 
 
373 aa  437  1e-121  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1202  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  56.81 
 
 
365 aa  434  1e-120  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0599  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  58.49 
 
 
386 aa  427  1e-118  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0624  light dependent period  47.58 
 
 
352 aa  313  1.9999999999999998e-84  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.167467 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17671  Fe-S-cluster-containing hydrogenase components 2  36.94 
 
 
335 aa  231  1e-59  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.506517  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1131  hypothetical protein  37.27 
 
 
340 aa  229  9e-59  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1952  putative LdpA protein  38.2 
 
 
343 aa  228  2e-58  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17511  Fe-S-cluster-containing hydrogenase components 2  36.44 
 
 
335 aa  227  2e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0378  putative LdpA protein  38.18 
 
 
343 aa  227  3e-58  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.955391  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1652  hypothetical protein  36.44 
 
 
335 aa  227  3e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.42119  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20051  Fe-S-cluster-containing hydrogenase components 2  37.27 
 
 
340 aa  226  6e-58  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0456807  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17421  Fe-S-cluster-containing hydrogenase components 2  35.5 
 
 
318 aa  219  5e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23001  Fe-S-cluster-containing hydrogenase components 2  36.69 
 
 
323 aa  177  2e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12991  ferredoxin  26.89 
 
 
341 aa  94.4  3e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.165246 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0090  ferredoxin hydrogenase  37.29 
 
 
484 aa  51.2  0.00003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2933  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  34.38 
 
 
505 aa  50.8  0.00004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0411  Ferredoxin hydrogenase  24.34 
 
 
531 aa  50.1  0.00007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0687694  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3465  hydrogenase large subunit domain protein  36.07 
 
 
488 aa  48.1  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1425  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  26.85 
 
 
260 aa  47.8  0.0004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.408101  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0899  tetrathionate reductase, subunit B  26.8 
 
 
245 aa  47.4  0.0004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2422  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  26.85 
 
 
260 aa  47.8  0.0004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0381557  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1179  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  32.39 
 
 
211 aa  45.8  0.001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4244  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  28.57 
 
 
281 aa  45.1  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.700128  normal  0.148707 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1322  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  47.62 
 
 
267 aa  45.4  0.002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000122015  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2894  cyclic nucleotide-binding protein  41.86 
 
 
482 aa  44.3  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00660929  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2172  cyclic nucleotide-binding protein  35.94 
 
 
565 aa  44.7  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.653365  hitchhiker  0.000000233561 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1334  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  47.37 
 
 
368 aa  44.3  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0262596 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3966  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  37.14 
 
 
227 aa  44.3  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0510  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  30.99 
 
 
559 aa  44.3  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0098001  normal  0.0322264 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1792  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  33.82 
 
 
565 aa  43.5  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0346302 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2413  molybdopterin oxidoreductase, iron-sulfur binding subunit  32.14 
 
 
1087 aa  43.5  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.220952  normal  0.47173 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1482  tetrathionate reductase subunit B  30.26 
 
 
244 aa  43.1  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.376515 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1786  tetrathionate reductase subunit B  30.26 
 
 
244 aa  43.1  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1957  tetrathionate reductase subunit B  30.26 
 
 
244 aa  43.1  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000105881 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1519  tetrathionate reductase subunit B  30.26 
 
 
244 aa  43.1  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.607656  hitchhiker  0.0000454632 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1498  tetrathionate reductase subunit B  30.26 
 
 
244 aa  43.1  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000220463 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0440  quinol dehydrogenase membrane component  31.94 
 
 
292 aa  43.1  0.008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000255918  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20700  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  26.19 
 
 
370 aa  42.7  0.009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.921643  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4103  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  27.92 
 
 
367 aa  43.1  0.009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000179459  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3244  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  38.6 
 
 
238 aa  43.1  0.009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0498  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  30.88 
 
 
212 aa  43.1  0.009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>