38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_1131 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007335  PMN2A_1131  hypothetical protein  100 
 
 		 340 aa  694    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20051  Fe-S-cluster-containing hydrogenase components 2  97.94 
 
 		 340 aa  679    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0456807  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23001  Fe-S-cluster-containing hydrogenase components 2  64.17 
 
 		 323 aa  430  1e-119  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1952  putative LdpA protein  57.01 
 
 		 343 aa  405  1.0000000000000001e-112  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0378  putative LdpA protein  55.18 
 
 		 343 aa  376  1e-103  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.955391  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17421  Fe-S-cluster-containing hydrogenase components 2  50 
 
 		 318 aa  315  9e-85  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1652  hypothetical protein  46.3 
 
 		 335 aa  308  1.0000000000000001e-82  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.42119  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17511  Fe-S-cluster-containing hydrogenase components 2  46.6 
 
 		 335 aa  305  6e-82  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17671  Fe-S-cluster-containing hydrogenase components 2  45.87 
 
 		 335 aa  305  1.0000000000000001e-81  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.506517  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0624  light dependent period  40.36 
 
 		 352 aa  236  5.0000000000000005e-61  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.167467 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1231  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  39.09 
 
 		 365 aa  233  3e-60  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.520201  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1202  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  38.81 
 
 		 365 aa  231  1e-59  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0125  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  37.27 
 
 		 383 aa  229  8e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4554  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  37.29 
 
 		 373 aa  213  2.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0599  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  37.5 
 
 		 386 aa  207  2e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2071  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur-binding domain-containing protein  40.69 
 
 		 394 aa  196  5.000000000000001e-49  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3014  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  35.67 
 
 		 405 aa  194  2e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00920835 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12991  ferredoxin  25.99 
 
 		 341 aa  82.4  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.165246 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0090  ferredoxin hydrogenase  34.07 
 
 		 484 aa  46.6  0.0006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2623  NADH ubiquinone oxidoreductase 20 kDa subunit  30.58 
 
 		 263 aa  45.8  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0128  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  40 
 
 		 97 aa  45.8  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0884  hydrogenase large subunit domain protein  28.75 
 
 		 507 aa  44.3  0.003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.139599  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1753  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  41.3 
 
 		 55 aa  44.7  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000316895  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3588  molybdopterin oxidoreductase family protein  22.84 
 
 		 1012 aa  43.9  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3519  twin-arginine translocation pathway signal  40 
 
 		 257 aa  43.9  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000081919  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3598  molybdopterin oxidoreductase family protein  22.84 
 
 		 979 aa  43.5  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3367  molybdopterin oxidoreductase family protein  22.84 
 
 		 979 aa  43.5  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1636  molybdopterin oxidoreductase family protein  22.84 
 
 		 979 aa  43.5  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.632493  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3331  formate dehydrogenase, alpha subunit  22.84 
 
 		 979 aa  43.5  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.291632  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3281  formate dehydrogenase, alpha subunit  22.84 
 
 		 979 aa  43.5  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3681  molybdopterin oxidoreductase family protein  22.84 
 
 		 979 aa  43.5  0.005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.725199  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2712  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  30.61 
 
 		 653 aa  43.5  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3631  molybdopterin oxidoreductase family protein  22.84 
 
 		 979 aa  43.5  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.461158  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0711  response regulator receiver protein  31.18 
 
 		 410 aa  43.1  0.006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.312278  hitchhiker  0.0000873565 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3465  hydrogenase large subunit domain protein  34.62 
 
 		 488 aa  43.5  0.006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3920  periplasmic Fe hydrogenase, large subunit  31.18 
 
 		 410 aa  43.1  0.007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3250  hydrogenases, Fe-only  31.18 
 
 		 410 aa  43.1  0.007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.644479  hitchhiker  0.0000163586 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1067  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  36.92 
 
 		 260 aa  42.7  0.009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.6291900000000003e-28 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>