23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A9601_17671 on replicon NC_008816
Organism: Prochlorococcus marinus str. AS9601



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007577  PMT9312_1652  hypothetical protein  91.64 
 
 
335 aa  634    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.42119  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17671  Fe-S-cluster-containing hydrogenase components 2  100 
 
 
335 aa  686    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.506517  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17511  Fe-S-cluster-containing hydrogenase components 2  92.54 
 
 
335 aa  637    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17421  Fe-S-cluster-containing hydrogenase components 2  77.81 
 
 
318 aa  517  1.0000000000000001e-145  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1952  putative LdpA protein  44.79 
 
 
343 aa  313  1.9999999999999998e-84  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20051  Fe-S-cluster-containing hydrogenase components 2  45.87 
 
 
340 aa  305  9.000000000000001e-82  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0456807  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1131  hypothetical protein  45.87 
 
 
340 aa  305  1.0000000000000001e-81  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0378  putative LdpA protein  45.06 
 
 
343 aa  299  5e-80  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.955391  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23001  Fe-S-cluster-containing hydrogenase components 2  45.03 
 
 
323 aa  285  1.0000000000000001e-75  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1231  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  38.1 
 
 
365 aa  244  1.9999999999999999e-63  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.520201  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1202  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  37.82 
 
 
365 aa  242  6e-63  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4554  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  37.29 
 
 
373 aa  236  5.0000000000000005e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0624  light dependent period  37.24 
 
 
352 aa  235  7e-61  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.167467 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0125  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  36.94 
 
 
383 aa  231  1e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0599  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  32.96 
 
 
386 aa  209  6e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3014  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  35.88 
 
 
405 aa  202  9e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00920835 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2071  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur-binding domain-containing protein  33.84 
 
 
394 aa  186  5e-46  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12991  ferredoxin  31.08 
 
 
341 aa  91.7  2e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.165246 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0090  ferredoxin hydrogenase  35.71 
 
 
484 aa  49.3  0.00009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1371  hydrogenase large subunit domain protein  28.99 
 
 
508 aa  47.8  0.0003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000870686  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3465  hydrogenase large subunit domain protein  42.37 
 
 
488 aa  44.7  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0725  hydrogenase-like  29.82 
 
 
483 aa  43.1  0.006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000665726  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1179  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  30 
 
 
211 aa  43.1  0.007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>