28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9301_17511 on replicon NC_009091
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9301



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009091  P9301_17511  Fe-S-cluster-containing hydrogenase components 2  100 
 
 
335 aa  681    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1652  hypothetical protein  94.63 
 
 
335 aa  651    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.42119  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17671  Fe-S-cluster-containing hydrogenase components 2  92.54 
 
 
335 aa  637    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.506517  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17421  Fe-S-cluster-containing hydrogenase components 2  78.5 
 
 
318 aa  523  1e-147  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20051  Fe-S-cluster-containing hydrogenase components 2  47.22 
 
 
340 aa  309  2.9999999999999997e-83  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0456807  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1952  putative LdpA protein  43.96 
 
 
343 aa  308  9e-83  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1131  hypothetical protein  46.6 
 
 
340 aa  305  6e-82  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0378  putative LdpA protein  44.44 
 
 
343 aa  302  6.000000000000001e-81  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.955391  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23001  Fe-S-cluster-containing hydrogenase components 2  45.45 
 
 
323 aa  290  2e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1231  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  38.1 
 
 
365 aa  243  3e-63  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.520201  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1202  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  37.82 
 
 
365 aa  242  7e-63  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4554  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  37.57 
 
 
373 aa  238  1e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0624  light dependent period  37.31 
 
 
352 aa  237  2e-61  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.167467 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0125  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  36.44 
 
 
383 aa  227  2e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3014  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  36.83 
 
 
405 aa  210  3e-53  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00920835 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0599  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  32.12 
 
 
386 aa  206  4e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2071  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur-binding domain-containing protein  33.42 
 
 
394 aa  186  3e-46  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12991  ferredoxin  28.79 
 
 
341 aa  82  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.165246 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1112  heterodisulfide reductase, iron-sulfur-binding subunit, putative  30.58 
 
 
756 aa  46.2  0.0009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0184173  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2895  methyl-viologen-reducing hydrogenase delta subunit  31.3 
 
 
754 aa  45.1  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.44384 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0090  ferredoxin hydrogenase  34.67 
 
 
484 aa  44.3  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13680  Fe-S-cluster-containing hydrogenase subunit  32.58 
 
 
235 aa  43.9  0.004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3465  hydrogenase large subunit domain protein  40.68 
 
 
488 aa  43.9  0.004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1371  hydrogenase large subunit domain protein  22.89 
 
 
508 aa  43.1  0.006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000870686  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3200  methyl-viologen-reducing hydrogenase delta subunit  30.3 
 
 
763 aa  43.1  0.006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2126  methyl-viologen-reducing hydrogenase delta subunit  28.89 
 
 
756 aa  43.1  0.007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2134  methyl-viologen-reducing hydrogenase, delta subunit  29.17 
 
 
758 aa  43.1  0.007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.696722  normal 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_1048  phosphatase  33.75 
 
 
623 aa  42.4  0.01  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.495002  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>