27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0624 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_0624  light dependent period  100 
 
 		 352 aa  710    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.167467 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1231  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  52.11 
 
 		 365 aa  360  2e-98  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.520201  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1202  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  51.83 
 
 		 365 aa  358  5e-98  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4554  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  49.44 
 
 		 373 aa  346  3e-94  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0125  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  47.58 
 
 		 383 aa  339  4e-92  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3014  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  42.11 
 
 		 405 aa  313  2.9999999999999996e-84  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00920835 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0599  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  49.86 
 
 		 386 aa  308  9e-83  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2071  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur-binding domain-containing protein  43.37 
 
 		 394 aa  295  1e-78  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1952  putative LdpA protein  47.6 
 
 		 343 aa  256  4e-67  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0378  putative LdpA protein  46.59 
 
 		 343 aa  249  5e-65  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.955391  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20051  Fe-S-cluster-containing hydrogenase components 2  40.96 
 
 		 340 aa  245  9e-64  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0456807  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1131  hypothetical protein  40.36 
 
 		 340 aa  241  1e-62  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17511  Fe-S-cluster-containing hydrogenase components 2  37.31 
 
 		 335 aa  241  1e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17671  Fe-S-cluster-containing hydrogenase components 2  37.24 
 
 		 335 aa  238  1e-61  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.506517  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1652  hypothetical protein  36.72 
 
 		 335 aa  236  3e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.42119  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17421  Fe-S-cluster-containing hydrogenase components 2  37.23 
 
 		 318 aa  236  4e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23001  Fe-S-cluster-containing hydrogenase components 2  45.37 
 
 		 323 aa  225  8e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12991  ferredoxin  29.34 
 
 		 341 aa  105  2e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.165246 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0090  ferredoxin hydrogenase  32.53 
 
 		 484 aa  52  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1334  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  32.18 
 
 		 368 aa  49.7  0.00007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0262596 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0413  hydrogenase large subunit  33.33 
 
 		 485 aa  47.4  0.0003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0146308  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0477  hydrogenase large subunit  29.55 
 
 		 478 aa  47.8  0.0003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5827  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  29.45 
 
 		 320 aa  46.6  0.0006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.235411  normal  0.0867479 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2725  formate dehydrogenase beta subunit  35.79 
 
 		 312 aa  46.2  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00195593  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1259  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  36 
 
 		 92 aa  43.9  0.005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1538  benzoyl-CoA oxygenase/reductase, BoxA protein  38.67 
 
 		 416 aa  42.7  0.009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0110  hypothetical protein  41.67 
 
 		 413 aa  42.7  0.01  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.31254  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>