More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_1259 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009486  Tpet_1259  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  100 
 
 
92 aa  191  3e-48  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1196  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  97.83 
 
 
92 aa  187  4e-47  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1541  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  56.67 
 
 
106 aa  112  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1938  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  55.43 
 
 
106 aa  109  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0061  ferredoxin  55.32 
 
 
92 aa  108  2.0000000000000002e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00664863 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2773  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  53.19 
 
 
92 aa  102  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.200948  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1250  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  48.96 
 
 
95 aa  99.8  1e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1477  ferredoxin-like protein  46.81 
 
 
95 aa  98.6  2e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3599  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  47.31 
 
 
111 aa  99.4  2e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.362888  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1193  putative ferredoxin like protein; FixX  46.81 
 
 
95 aa  98.6  2e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.170567 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2316  putative ferredoxin like protein; FixX  46.81 
 
 
99 aa  98.6  3e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00117269  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1433  putative ferredoxin like protein; FixX  46.81 
 
 
99 aa  97.4  6e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.102242  normal  0.0121231 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0959  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  44.09 
 
 
110 aa  96.7  1e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7736  putative ferredoxin like protein; FixX  46.81 
 
 
99 aa  95.9  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10550  FixX ferredoxin-like protein  49.46 
 
 
94 aa  95.1  3e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0834352  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0637  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  46.39 
 
 
95 aa  94.7  4e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1371  putative ferredoxin like protein; FixX  41.49 
 
 
98 aa  92.4  2e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2264  ferredoxin  51.61 
 
 
96 aa  90.1  8e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0290114  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0139  putative ferredoxin protein, FixX  45.74 
 
 
99 aa  90.1  1e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3926  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  42.55 
 
 
95 aa  89.7  1e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.540804 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5869  putative ferredoxin protein, FixX  44.68 
 
 
98 aa  89.4  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.473497 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2134  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  47.19 
 
 
96 aa  89.4  2e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0490  putative ferredoxin protein, FixX  43.62 
 
 
100 aa  88.6  3e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2370  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  47.19 
 
 
96 aa  87.8  4e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6231  FixX ferredoxin-like protein  45.83 
 
 
98 aa  87.4  7e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4603  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding domain protein  40.22 
 
 
93 aa  87  8e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5083  putative ferredoxin protein, FixX  47.87 
 
 
98 aa  86.7  9e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1552  ferredoxin-like protein  46.24 
 
 
94 aa  86.7  1e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.281745  normal  0.225513 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0647  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  46.07 
 
 
96 aa  86.3  1e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.512756  hitchhiker  0.00122416 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4012  ferredoxin-like protein  48.94 
 
 
94 aa  85.9  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3613  putative ferredoxin protein, FixX  46.88 
 
 
97 aa  85.9  2e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.122758 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1999  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  41.11 
 
 
96 aa  85.5  2e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3574  ferredoxin-like protein  47.87 
 
 
94 aa  84.7  3e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.183526  normal  0.204612 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1091  ferredoxin like protein, fixX  45.74 
 
 
98 aa  85.1  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.992271  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0987  ferredoxin like protein, fixX  45.74 
 
 
98 aa  84.7  4e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0910173 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0478  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  48.35 
 
 
98 aa  83.6  8e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00000449419  decreased coverage  0.000160818 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4445  ferredoxin like protein, fixX  44.68 
 
 
98 aa  82.8  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2197  iron-sulfur cluster-binding protein FixX  46.24 
 
 
105 aa  80.5  0.000000000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0334  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  44.57 
 
 
87 aa  79.7  0.00000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4926  FixX ferredoxin-like protein  41.94 
 
 
98 aa  76.3  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1844  putative ferredoxin  39.36 
 
 
98 aa  72.8  0.000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.148081  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00048  predicted 4Fe-4S ferredoxin-type protein  38.3 
 
 
95 aa  71.6  0.000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3555  putative ferredoxin  38.3 
 
 
95 aa  71.6  0.000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0050  ferredoxin homolog FixX  38.3 
 
 
95 aa  71.6  0.000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00047  hypothetical protein  38.3 
 
 
95 aa  71.6  0.000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0048  ferredoxin homolog FixX  38.3 
 
 
95 aa  71.6  0.000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3611  putative ferredoxin  38.3 
 
 
95 aa  71.6  0.000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0167576 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0128  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  35.9 
 
 
97 aa  72  0.000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0046  ferredoxin homolog FixX  38.3 
 
 
95 aa  71.6  0.000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.922786 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3233  putative ferredoxin  38.95 
 
 
95 aa  71.2  0.000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0048  ferredoxin homolog FixX  38.3 
 
 
95 aa  70.9  0.000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1028  putative ferredoxin  35.11 
 
 
95 aa  70.9  0.000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1398  ferredoxin-like protein  36.17 
 
 
97 aa  69.7  0.00000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0672004  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0314  putative ferredoxin  36.17 
 
 
98 aa  69.7  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4042  putative ferredoxin  37.89 
 
 
95 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2680  putative ferredoxin  37.89 
 
 
95 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.606102 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0589  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  38.71 
 
 
89 aa  66.6  0.0000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.000249296  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0084  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding domain protein  35.11 
 
 
95 aa  66.6  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.951067 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0084  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding domain-containing protein  35.11 
 
 
95 aa  66.6  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.588767  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0087  ferredoxin-like protein ydiT  35.11 
 
 
95 aa  66.6  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0085  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding domain-containing protein  35.11 
 
 
95 aa  66.6  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.807465  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0088  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding domain protein  35.11 
 
 
95 aa  66.6  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.38578 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3555  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  38.3 
 
 
92 aa  65.9  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00130  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  42.25 
 
 
94 aa  66.2  0.0000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4275  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  41.11 
 
 
90 aa  65.1  0.0000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09260  ferredoxin-like protein  40.43 
 
 
98 aa  64.7  0.0000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.759582 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01669  predicted 4Fe-4S ferredoxin-type protein  33.33 
 
 
97 aa  63.9  0.0000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1495  iron-sulfur cluster-binding protein  33.33 
 
 
97 aa  64.3  0.0000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.306818 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01658  hypothetical protein  33.33 
 
 
97 aa  63.9  0.0000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1903  iron-sulfur cluster-binding protein  33.33 
 
 
97 aa  64.3  0.0000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2417  iron-sulfur cluster-binding protein  33.33 
 
 
97 aa  64.3  0.0000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1917  iron-sulfur cluster-binding protein  33.33 
 
 
97 aa  64.3  0.0000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0575  hypothetical protein  35.79 
 
 
94 aa  63.9  0.0000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2123  hypothetical protein  39.36 
 
 
94 aa  63.5  0.0000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1942  iron-sulfur cluster-binding protein  32.29 
 
 
97 aa  63.2  0.000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.332806  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1481  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding domain-containing protein  32.98 
 
 
97 aa  63.2  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0731484 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1821  putative ferredoxin  32.98 
 
 
97 aa  63.2  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1447  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding domain protein  32.98 
 
 
97 aa  62.8  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.128489 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3107  putative ferredoxin  38.95 
 
 
99 aa  62.8  0.000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000394196 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1931  hypothetical protein  34.38 
 
 
97 aa  62.8  0.000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0527008 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1463  ferredoxin like protein  32.98 
 
 
97 aa  62.8  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03178  electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase  35.79 
 
 
549 aa  62.4  0.000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.420637  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1821  putative ferredoxin  38.95 
 
 
99 aa  62.8  0.000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.09414  normal  0.305366 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1993  ferredoxin like protein  32.98 
 
 
97 aa  62.4  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0887759  normal  0.0253227 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27810  ferredoxin-like protein  37.62 
 
 
103 aa  62  0.000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1435  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  35.71 
 
 
97 aa  61.2  0.000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.610605  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3065  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  36.17 
 
 
571 aa  59.7  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08760  ferredoxin-like protein  35.05 
 
 
102 aa  58.5  0.00000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.696801 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2595  FAD dependent oxidoreductase  35.05 
 
 
553 aa  57.8  0.00000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.399286 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6076  electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase  36.26 
 
 
554 aa  57.4  0.00000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2059  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  36.73 
 
 
558 aa  57.4  0.00000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2907  putative ferredoxin  34.62 
 
 
86 aa  57  0.00000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3069  putative ferredoxin  34.62 
 
 
86 aa  57  0.00000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2346  putative electron transfer flavoprotein dehydrogenase  34.78 
 
 
552 aa  57  0.00000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.398943  normal  0.0520477 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5421  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  35.16 
 
 
554 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0428869  normal  0.981132 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3523  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  40.62 
 
 
550 aa  56.2  0.0000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3106  putative ferredoxin  34.12 
 
 
86 aa  56.6  0.0000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0911919  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4022  putative ferredoxin  33.33 
 
 
86 aa  55.5  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.878654 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1392  electrotransfer ubiquinone oxidoreductase  35.48 
 
 
553 aa  55.8  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0319  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  36.14 
 
 
559 aa  55.5  0.0000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.013654 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>