35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_23001 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008820  P9303_23001  Fe-S-cluster-containing hydrogenase components 2  100 
 
 		 323 aa  647    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20051  Fe-S-cluster-containing hydrogenase components 2  64.49 
 
 		 340 aa  458  9.999999999999999e-129  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0456807  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1131  hypothetical protein  64.17 
 
 		 340 aa  454  1.0000000000000001e-126  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1952  putative LdpA protein  65.52 
 
 		 343 aa  423  1e-117  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0378  putative LdpA protein  63.32 
 
 		 343 aa  394  1e-108  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.955391  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17421  Fe-S-cluster-containing hydrogenase components 2  46.52 
 
 		 318 aa  315  5e-85  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17511  Fe-S-cluster-containing hydrogenase components 2  45.45 
 
 		 335 aa  311  1e-83  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1652  hypothetical protein  44.83 
 
 		 335 aa  310  2.9999999999999997e-83  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.42119  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17671  Fe-S-cluster-containing hydrogenase components 2  45.03 
 
 		 335 aa  305  6e-82  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.506517  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0624  light dependent period  45.37 
 
 		 352 aa  242  6e-63  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.167467 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1231  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  41.04 
 
 		 365 aa  230  3e-59  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.520201  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1202  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  40.75 
 
 		 365 aa  228  9e-59  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4554  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  38.83 
 
 		 373 aa  207  3e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0599  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  41.01 
 
 		 386 aa  205  7e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0125  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  36.8 
 
 		 383 aa  201  9.999999999999999e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3014  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  35.07 
 
 		 405 aa  173  2.9999999999999996e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00920835 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2071  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur-binding domain-containing protein  35.43 
 
 		 394 aa  170  4e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12991  ferredoxin  26.1 
 
 		 341 aa  85.1  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.165246 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0477  hydrogenase large subunit  27.81 
 
 		 478 aa  54.3  0.000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3786  NADH ubiquinone oxidoreductase 20 kDa subunit  38.38 
 
 		 256 aa  48.1  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.531576  normal  0.312558 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3718  NADH ubiquinone oxidoreductase 20 kDa subunit  38.78 
 
 		 256 aa  45.8  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0184008  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1831  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  42.62 
 
 		 159 aa  45.1  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000011696  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0090  ferredoxin hydrogenase  27.37 
 
 		 484 aa  44.7  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2056  hydrogenase, Fe-only  28.23 
 
 		 644 aa  44.7  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000410653  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1984  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  34.72 
 
 		 366 aa  45.1  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.794956  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1371  hydrogenase large subunit domain protein  26.95 
 
 		 508 aa  44.3  0.003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000870686  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3046  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  30.91 
 
 		 639 aa  44.3  0.003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0822  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  30.91 
 
 		 639 aa  44.3  0.003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3212  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  30.91 
 
 		 639 aa  44.3  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.845239  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02719  fused predicted oxidoreductase: Fe-S subunit/nucleotide-binding subunit  30.91 
 
 		 639 aa  44.3  0.003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.645613  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0607  NADH ubiquinone oxidoreductase, 20 kDa subunit  36.11 
 
 		 264 aa  44.3  0.003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.514043  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0806  glutamate synthase, small subunit  30.91 
 
 		 639 aa  44.3  0.003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4176  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  30.91 
 
 		 641 aa  43.1  0.007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.623364  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3195  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  39.02 
 
 		 260 aa  42.7  0.008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.583416  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2623  NADH ubiquinone oxidoreductase 20 kDa subunit  38.89 
 
 		 263 aa  42.7  0.009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>