53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NATL1_20051 on replicon NC_008819
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL1A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008819  NATL1_20051  Fe-S-cluster-containing hydrogenase components 2  100 
 
 
340 aa  696    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0456807  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1131  hypothetical protein  97.94 
 
 
340 aa  679    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23001  Fe-S-cluster-containing hydrogenase components 2  64.49 
 
 
323 aa  434  1e-120  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1952  putative LdpA protein  57.8 
 
 
343 aa  399  9.999999999999999e-111  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0378  putative LdpA protein  54.57 
 
 
343 aa  376  1e-103  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.955391  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17421  Fe-S-cluster-containing hydrogenase components 2  50 
 
 
318 aa  316  5e-85  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1652  hypothetical protein  46.91 
 
 
335 aa  312  4.999999999999999e-84  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.42119  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17511  Fe-S-cluster-containing hydrogenase components 2  47.22 
 
 
335 aa  309  2.9999999999999997e-83  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17671  Fe-S-cluster-containing hydrogenase components 2  45.87 
 
 
335 aa  305  9.000000000000001e-82  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.506517  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0624  light dependent period  40.96 
 
 
352 aa  240  2.9999999999999997e-62  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.167467 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1231  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  39.38 
 
 
365 aa  236  5.0000000000000005e-61  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.520201  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1202  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  39.09 
 
 
365 aa  234  1.0000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0125  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  37.27 
 
 
383 aa  226  5.0000000000000005e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4554  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  37.57 
 
 
373 aa  218  2e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0599  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  36.94 
 
 
386 aa  207  2e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2071  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur-binding domain-containing protein  40.34 
 
 
394 aa  194  1e-48  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3014  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  35.67 
 
 
405 aa  193  3e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00920835 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12991  ferredoxin  25.86 
 
 
341 aa  84.3  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.165246 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0090  ferredoxin hydrogenase  35.16 
 
 
484 aa  49.3  0.00009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0884  hydrogenase large subunit domain protein  28.75 
 
 
507 aa  45.8  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.139599  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2712  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  32.65 
 
 
653 aa  45.8  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3465  hydrogenase large subunit domain protein  35.9 
 
 
488 aa  45.8  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2623  NADH ubiquinone oxidoreductase 20 kDa subunit  30.58 
 
 
263 aa  45.4  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1753  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  41.3 
 
 
55 aa  44.3  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000316895  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2623  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  31.63 
 
 
653 aa  44.3  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1318  NADH dehydrogenase (quinone)  37.5 
 
 
626 aa  44.3  0.003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1368  NADH dehydrogenase (quinone)  37.5 
 
 
626 aa  44.3  0.003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1371  hydrogenase large subunit domain protein  26.28 
 
 
508 aa  43.9  0.004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000870686  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0996  hydrogenase large subunit domain protein  33.33 
 
 
454 aa  43.5  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000195829  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0128  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  38 
 
 
97 aa  43.1  0.006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3588  molybdopterin oxidoreductase family protein  22.41 
 
 
1012 aa  43.1  0.006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0607  NADH ubiquinone oxidoreductase, 20 kDa subunit  29.27 
 
 
264 aa  43.1  0.007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.514043  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1636  molybdopterin oxidoreductase family protein  22.41 
 
 
979 aa  43.1  0.007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.632493  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3631  molybdopterin oxidoreductase family protein  22.41 
 
 
979 aa  43.1  0.007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.461158  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3519  twin-arginine translocation pathway signal  36.92 
 
 
257 aa  43.1  0.007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000081919  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3281  formate dehydrogenase, alpha subunit  22.41 
 
 
979 aa  43.1  0.007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2672  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  40.68 
 
 
653 aa  43.1  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1277  Fe-hydrogenase large subunit family protein  31.43 
 
 
493 aa  43.1  0.007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000478337  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3367  molybdopterin oxidoreductase family protein  22.41 
 
 
979 aa  43.1  0.007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3598  molybdopterin oxidoreductase family protein  22.41 
 
 
979 aa  43.1  0.007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3681  molybdopterin oxidoreductase family protein  22.41 
 
 
979 aa  43.1  0.007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.725199  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2738  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  48.78 
 
 
653 aa  43.1  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2845  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  48.78 
 
 
653 aa  43.1  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.625431  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3331  formate dehydrogenase, alpha subunit  22.41 
 
 
979 aa  42.7  0.008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.291632  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1794  hydrogenase large subunit  34.48 
 
 
462 aa  42.7  0.008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3212  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  26.61 
 
 
639 aa  42.7  0.009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.845239  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0822  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  26.61 
 
 
639 aa  42.7  0.009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0806  glutamate synthase, small subunit  26.61 
 
 
639 aa  42.7  0.009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0477  hydrogenase large subunit  27.08 
 
 
478 aa  42.7  0.01  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02719  fused predicted oxidoreductase: Fe-S subunit/nucleotide-binding subunit  26.61 
 
 
639 aa  42.7  0.01  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.645613  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3046  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  26.61 
 
 
639 aa  42.7  0.01  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1708  hydrogenase large subunit domain protein  33.7 
 
 
435 aa  42.7  0.01  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3786  NADH ubiquinone oxidoreductase 20 kDa subunit  25.55 
 
 
256 aa  42.7  0.01  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.531576  normal  0.312558 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>