41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_0378 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_0378  putative LdpA protein  100 
 
 		 343 aa  682    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.955391  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1952  putative LdpA protein  68.51 
 
 		 343 aa  472  1e-132  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1131  hypothetical protein  55.18 
 
 		 340 aa  393  1e-108  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20051  Fe-S-cluster-containing hydrogenase components 2  54.57 
 
 		 340 aa  389  1e-107  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0456807  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23001  Fe-S-cluster-containing hydrogenase components 2  63.32 
 
 		 323 aa  385  1e-106  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17511  Fe-S-cluster-containing hydrogenase components 2  44.44 
 
 		 335 aa  311  6.999999999999999e-84  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17671  Fe-S-cluster-containing hydrogenase components 2  45.06 
 
 		 335 aa  310  2.9999999999999997e-83  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.506517  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1652  hypothetical protein  43.83 
 
 		 335 aa  310  2.9999999999999997e-83  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.42119  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17421  Fe-S-cluster-containing hydrogenase components 2  45.57 
 
 		 318 aa  306  4.0000000000000004e-82  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1231  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  42.25 
 
 		 365 aa  264  2e-69  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.520201  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1202  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  41.97 
 
 		 365 aa  263  4.999999999999999e-69  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0624  light dependent period  46.59 
 
 		 352 aa  255  6e-67  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.167467 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0125  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  38.18 
 
 		 383 aa  241  1e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4554  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  40.5 
 
 		 373 aa  227  2e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0599  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  41.16 
 
 		 386 aa  219  6e-56  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3014  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  35.34 
 
 		 405 aa  202  8e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00920835 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2071  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur-binding domain-containing protein  37.73 
 
 		 394 aa  201  9.999999999999999e-51  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12991  ferredoxin  26.01 
 
 		 341 aa  89.4  8e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.165246 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0477  hydrogenase large subunit  30.56 
 
 		 478 aa  54.7  0.000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2623  NADH ubiquinone oxidoreductase 20 kDa subunit  36.04 
 
 		 263 aa  49.7  0.00007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0090  ferredoxin hydrogenase  28.21 
 
 		 484 aa  49.3  0.00009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1179  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  38.27 
 
 		 211 aa  48.1  0.0002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0498  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  44.64 
 
 		 212 aa  46.2  0.0008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1371  hydrogenase large subunit domain protein  32.5 
 
 		 508 aa  45.8  0.001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000870686  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0725  hydrogenase-like  31.45 
 
 		 483 aa  44.7  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000665726  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1794  hydrogenase large subunit  34.88 
 
 		 462 aa  45.1  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02090  hydrogenase large subunit domain protein  28.57 
 
 		 491 aa  44.7  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1277  Fe-hydrogenase large subunit family protein  34.25 
 
 		 493 aa  43.9  0.004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000478337  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1176  glycyl-radical activating protein  31.33 
 
 		 306 aa  44.3  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2735  methanogenesis marker 16 metalloprotein  36.96 
 
 		 414 aa  43.9  0.004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.911419 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3519  twin-arginine translocation pathway signal  31.03 
 
 		 257 aa  43.5  0.005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000081919  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3465  hydrogenase large subunit domain protein  36.67 
 
 		 488 aa  43.5  0.005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3920  periplasmic Fe hydrogenase, large subunit  41.07 
 
 		 410 aa  43.5  0.005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3250  hydrogenases, Fe-only  41.07 
 
 		 410 aa  43.5  0.005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.644479  hitchhiker  0.0000163586 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2192  glycyl-radical activating family protein  35.62 
 
 		 307 aa  43.1  0.006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02060  putative PAS/PAC sensor protein  29.27 
 
 		 571 aa  43.1  0.007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0711  response regulator receiver protein  41.07 
 
 		 410 aa  43.1  0.007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.312278  hitchhiker  0.0000873565 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0369  NADH ubiquinone oxidoreductase, 20 kDa subunit  41.33 
 
 		 262 aa  42.7  0.009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.639701  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4577  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  31.86 
 
 		 188 aa  42.7  0.009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2589  CoB--CoM heterodisulfide reductase subunit A  36.76 
 
 		 792 aa  42.7  0.01  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.295963 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2337  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  29.03 
 
 		 251 aa  42.7  0.01  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>