More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_2192 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_2192  glycyl-radical activating family protein  100 
 
 		 307 aa  629  1e-179  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2477  glycyl-radical enzyme activating protein family  37.58 
 
 		 310 aa  224  2e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.731109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4091  glycyl-radical enzyme activating protein family  40.79 
 
 		 305 aa  218  1e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2752  glycyl-radical activating family protein  41.85 
 
 		 310 aa  213  3.9999999999999995e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0367  glycyl-radical enzyme activating protein family  40.28 
 
 		 310 aa  207  2e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2102  pyruvate formate-lyase-activating enzyme, putative  36.88 
 
 		 298 aa  201  9.999999999999999e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.510382  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1176  glycyl-radical activating protein  40.51 
 
 		 306 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2500  glycyl-radical enzyme activating protein family  38 
 
 		 294 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3544  glycyl-radical enzyme activating protein family  39.37 
 
 		 316 aa  196  3e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0168  glycyl-radical enzyme activating protein family  37.83 
 
 		 303 aa  196  4.0000000000000005e-49  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.465492  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0490  glycyl-radical activating family protein  42.75 
 
 		 307 aa  194  2e-48  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.164514 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1396  glycerol dehydratase activating enzyme  39.48 
 
 		 322 aa  193  3e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.214688  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3054  radical-activating enzyme  39.58 
 
 		 302 aa  191  1e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.969131  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3258  glycyl-radical enzyme activating protein family  33.88 
 
 		 303 aa  191  1e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.807185  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1247  glycyl-radical enzyme activating protein family  38.2 
 
 		 299 aa  191  2e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1586  glycyl-radical enzyme activating protein family  39.93 
 
 		 314 aa  190  2e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0487316  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0207  glycyl-radical activating family protein  40.22 
 
 		 306 aa  190  2.9999999999999997e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2966  glycyl-radical activating family protein  39.48 
 
 		 297 aa  189  5e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2365  glycyl-radical enzyme activating protein family  35.71 
 
 		 306 aa  189  5.999999999999999e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000514278  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1438  glycyl-radical enzyme activating protein family  37.5 
 
 		 301 aa  187  2e-46  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1272  radical-activating enzyme  40.15 
 
 		 309 aa  187  2e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0916  pyruvate-formate lyase-activating enzyme  36.88 
 
 		 306 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0858803  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3715  glycyl-radical enzyme activating protein family  36.59 
 
 		 316 aa  183  3e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0980  glycyl-radical activating family protein  39.11 
 
 		 297 aa  181  2e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.131362 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1435  glycyl-radical enzyme activating protein family  40.99 
 
 		 312 aa  178  1e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1073  glycyl-radical enzyme activating protein family  33.71 
 
 		 298 aa  177  2e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.949815  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17450  glycyl-radical enzyme activator family protein  38.05 
 
 		 311 aa  176  4e-43  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.478583  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2144  glycyl-radical enzyme activating protein family  37.85 
 
 		 298 aa  172  6.999999999999999e-42  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1541  glycyl-radical activating protein  37.68 
 
 		 348 aa  163  4.0000000000000004e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.883211  normal  0.703307 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0943  pyruvate-formate lyase-activating enzyme  38.15 
 
 		 318 aa  162  6e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0115559  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3704  glycyl-radical enzyme activating protein family  34.34 
 
 		 304 aa  159  6e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1358  glycyl-radical enzyme activating protein family  34.85 
 
 		 310 aa  157  2e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1418  glycyl-radical activating family protein  33.33 
 
 		 315 aa  157  2e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3277  glycyl-radical activating family protein  37 
 
 		 318 aa  156  3e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3460  glycyl-radical enzyme activating protein family  38.99 
 
 		 330 aa  154  2e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3281  radical-activating enzyme  31.49 
 
 		 320 aa  154  2e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4446  pyruvate formate lyase II activase  33.21 
 
 		 292 aa  153  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.193926 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4520  pyruvate formate lyase II activase  33.21 
 
 		 292 aa  153  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000270977 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4904  glycyl-radical enzyme activating protein family  35.46 
 
 		 327 aa  149  6e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4034  glycyl-radical enzyme activating protein family  30.61 
 
 		 292 aa  144  2e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1318  glycyl-radical activating family protein  36.76 
 
 		 299 aa  143  3e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0352967  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4064  pyruvate formate lyase II activase  30.85 
 
 		 292 aa  143  4e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4438  pyruvate formate lyase II activase  31.13 
 
 		 292 aa  143  4e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03837  pyruvate formate lyase II activase  31.32 
 
 		 292 aa  142  6e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4491  pyruvate formate lyase II activase  31.32 
 
 		 292 aa  142  6e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.730323  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4186  pyruvate formate lyase II activase  31.32 
 
 		 292 aa  142  6e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03786  hypothetical protein  31.32 
 
 		 292 aa  142  6e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5412  pyruvate formate lyase II activase  31.32 
 
 		 279 aa  142  7e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4399  pyruvate formate lyase II activase  31.32 
 
 		 292 aa  142  8e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.710487  normal  0.473369 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0325  pyruvate formate-lyase-activating enzyme  32.09 
 
 		 258 aa  139  3.9999999999999997e-32  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.719518  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1938  glycyl-radical enzyme activating protein family  33.73 
 
 		 273 aa  137  2e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.239617  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0995  glycyl-radical enzyme activating protein family  35.23 
 
 		 299 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0974  glycyl-radical enzyme activating protein family  34.9 
 
 		 299 aa  133  3.9999999999999996e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.232079  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0912  glycyl-radical enzyme activating protein family  34.9 
 
 		 299 aa  133  3.9999999999999996e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0945  glycyl-radical enzyme activating protein  34.9 
 
 		 299 aa  133  3.9999999999999996e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0885  glycyl-radical enzyme activating protein family  34.56 
 
 		 299 aa  132  5e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00791  predicted pyruvate formate lyase activating enzyme  35.84 
 
 		 308 aa  132  7.999999999999999e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2641  glycyl-radical activating family protein  34.19 
 
 		 299 aa  132  7.999999999999999e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00101807 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00808  hypothetical protein  35.84 
 
 		 308 aa  132  7.999999999999999e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2524  glycyl-radical enzyme activating protein family  35.84 
 
 		 308 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.275532  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0849  glycyl-radical activating family protein  35.77 
 
 		 299 aa  130  3e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2820  glycyl-radical activating family protein  36.13 
 
 		 299 aa  129  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0882  glycyl-radical activating family protein  36.13 
 
 		 299 aa  129  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2818  glycyl-radical enzyme activating protein family  36.13 
 
 		 299 aa  129  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0425809  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0895  glycyl-radical activating family protein  36.13 
 
 		 299 aa  129  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0974  glycyl-radical enzyme activating protein  36.13 
 
 		 299 aa  129  7.000000000000001e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3029  glycyl-radical enzyme activating protein family  29.45 
 
 		 260 aa  127  3e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001155  pyruvate formate-lyase activating enzyme  31.67 
 
 		 309 aa  124  2e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000234207  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1578  radical SAM family protein  30.8 
 
 		 280 aa  121  1.9999999999999998e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23160  pyruvate formate-lyase activating enzyme  30.48 
 
 		 247 aa  120  3e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1175  glycyl-radical activating family protein  32.45 
 
 		 263 aa  119  7e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0579151  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4921  pyruvate formate lyase activating enzyme  32.83 
 
 		 287 aa  114  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4819  pyruvate formate lyase activating enzyme  32.83 
 
 		 287 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.387597  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04255  predicted pyruvate formate lyase activating enzyme  32.45 
 
 		 287 aa  114  3e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.542782  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3619  Radical SAM domain protein  32.45 
 
 		 287 aa  114  3e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04221  hypothetical protein  32.45 
 
 		 287 aa  114  3e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.606707  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4886  pyruvate formate lyase activating enzyme  32.45 
 
 		 287 aa  113  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0614153  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4980  pyruvate formate lyase activating enzyme  32.45 
 
 		 287 aa  112  6e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.902486  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4614  radical SAM domain-containing protein  32.08 
 
 		 287 aa  112  7.000000000000001e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3677  radical SAM domain-containing protein  32.08 
 
 		 287 aa  112  7.000000000000001e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.005025 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4973  pyruvate formate lyase activating enzyme  32.45 
 
 		 287 aa  112  7.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.577557  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4927  radical SAM domain-containing protein  32.08 
 
 		 287 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4923  radical SAM domain protein  31.7 
 
 		 287 aa  109  5e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4977  radical SAM domain-containing protein  31.32 
 
 		 287 aa  109  6e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.258865  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5892  radical SAM domain protein  31.7 
 
 		 287 aa  108  9.000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3944  radical SAM domain-containing protein  30.74 
 
 		 292 aa  108  1e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0506  pyruvate formate-lyase activating enzyme  28.87 
 
 		 238 aa  107  2e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0339577  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2408  radical activating enzyme  31.15 
 
 		 286 aa  106  6e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0267  putative pyruvate formate lyase activating enzyme  31.27 
 
 		 298 aa  105  9e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0149457 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0270  radical SAM domain-containing protein  29.92 
 
 		 292 aa  104  2e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000473608 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1777  (Formate-C-acetyltransferase)-activating enzyme  29.67 
 
 		 279 aa  104  2e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000493175  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0539  radical SAM domain-containing protein  28.68 
 
 		 286 aa  103  3e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.536382  normal  0.0504206 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2284  radical SAM domain-containing protein  31.15 
 
 		 298 aa  103  3e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00260507  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2401  radical SAM domain-containing protein  30.74 
 
 		 298 aa  102  6e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.312992  unclonable  0.00000836266 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1357  pyruvate formate-lyase activating enzyme  29.5 
 
 		 235 aa  102  7e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1170  pyruvate formate-lyase activating enzyme  29.5 
 
 		 235 aa  102  7e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.763287  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0432  pyruvate formate-lyase activating enzyme  29.85 
 
 		 243 aa  102  8e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0564  pyruvate formate-lyase-activating enzyme  29.7 
 
 		 243 aa  101  1e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0566  pyruvate formate-lyase-activating enzyme  29.7 
 
 		 243 aa  101  1e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1605  pyruvate-formate lyase activating enzyme  29.09 
 
 		 266 aa  101  1e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>