90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0644 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0644  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  100 
 
 		 68 aa  128  2.0000000000000002e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000788909  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2701  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  63.46 
 
 		 85 aa  62.4  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.118959  hitchhiker  0.0000735154 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2519  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  59.62 
 
 		 85 aa  61.6  0.000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1396  glycerol dehydratase activating enzyme  44.23 
 
 		 322 aa  49.3  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.214688  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1334  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  42 
 
 		 368 aa  48.9  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0262596 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2365  glycyl-radical enzyme activating protein family  41.94 
 
 		 306 aa  48.5  0.00003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000514278  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1318  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  51.85 
 
 		 67 aa  48.1  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.255294  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2192  glycyl-radical activating family protein  41.82 
 
 		 307 aa  46.6  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0175  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  40.68 
 
 		 455 aa  46.2  0.0001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2408  radical activating enzyme  38.89 
 
 		 286 aa  45.4  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0278  hypothetical protein  38.89 
 
 		 268 aa  45.4  0.0002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1838  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  38.46 
 
 		 671 aa  44.3  0.0005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2139  NADH dehydrogenase (quinone)  33.33 
 
 		 596 aa  44.3  0.0005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.306565  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1860  pyruvate flavodoxin/ferredoxin oxidoreductase domain protein  32.88 
 
 		 1215 aa  44.3  0.0005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2297  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  38.98 
 
 		 378 aa  44.3  0.0006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1450  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  46.81 
 
 		 636 aa  43.9  0.0007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.101445  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2804  NADH dehydrogenase (quinone)  46.81 
 
 		 636 aa  43.9  0.0007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.260588 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1709  pyruvate/ketoisovalerate oxidoreductase, gamma subunit  34.78 
 
 		 339 aa  43.9  0.0008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0681484  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12991  ferredoxin  36.84 
 
 		 341 aa  43.5  0.0009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.165246 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2990  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  47.06 
 
 		 179 aa  43.5  0.0009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0093  Fe-S cluster domain protein  38 
 
 		 460 aa  43.1  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000835421 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0054  pyruvate flavodoxin/ferredoxin oxidoreductase domain protein  33.73 
 
 		 1176 aa  43.5  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00219154  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0985  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  32.14 
 
 		 356 aa  43.1  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2304  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  42 
 
 		 623 aa  43.5  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20820  pyruvate flavodoxin/ferredoxin oxidoreductase domain protein  34.09 
 
 		 1179 aa  43.1  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000200952  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2548  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  38.89 
 
 		 399 aa  43.1  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0553  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit F  42.59 
 
 		 436 aa  43.5  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.238228  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0585  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit  38 
 
 		 395 aa  43.1  0.001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.00081136  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2603  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  40 
 
 		 357 aa  42.7  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.31548 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2322  4Fe-4S binding domain protein  40 
 
 		 357 aa  42.7  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000282752  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0553  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  34.38 
 
 		 100 aa  42  0.002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.000000693833  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0796  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  39.68 
 
 		 368 aa  42.7  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.18226  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1292  Fe-S cluster domain protein  35 
 
 		 443 aa  42.4  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0318  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  45.83 
 
 		 175 aa  42.4  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.188751  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0300  pyruvate ferredoxin/flavodoxin oxidoreductase  34.09 
 
 		 1189 aa  42.4  0.002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2722  putative polyferredoxin  44 
 
 		 287 aa  42  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.715099  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2857  pyruvate ferredoxin/flavodoxin oxidoreductase, delta subunit  34.62 
 
 		 363 aa  42  0.003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.000247505  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2145  Fe-S cluster domain-containing protein  35.19 
 
 		 435 aa  42  0.003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1328  pyruvate ferredoxin/flavodoxin oxidoreductase  30.12 
 
 		 1184 aa  42  0.003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000692132 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0557  sulfite reductase, subunit C  36.36 
 
 		 322 aa  42  0.003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_635  [Fe] hydrogenase, HymB subunit  38.64 
 
 		 626 aa  41.6  0.003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4738  NapH/MauN family ferredoxin-type protein  42.11 
 
 		 283 aa  42  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.199937  normal  0.474351 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1578  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  39.29 
 
 		 58 aa  41.6  0.003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0316883  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1604  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  36.11 
 
 		 77 aa  41.6  0.004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1164  pyruvate flavodoxin/ferredoxin oxidoreductase domain protein  31.11 
 
 		 1176 aa  41.6  0.004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.621358  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0419  pyruvate-flavodoxin oxidoreductase  32.39 
 
 		 1163 aa  41.6  0.004  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0463  pyruvate-flavoredoxin oxidoreductase  31.65 
 
 		 1079 aa  41.6  0.004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0388301  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3578  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  40.3 
 
 		 90 aa  41.2  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.182494  normal  0.90179 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3804  NADH dehydrogenase (quinone)  38 
 
 		 595 aa  41.2  0.005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0064  pyruvate:ferredoxin (flavodoxin) oxidoreductase  38.03 
 
 		 1171 aa  41.2  0.005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.789886  normal  0.0727512 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0318  protein of unknown function DUF362  33.96 
 
 		 398 aa  40.8  0.006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.867242 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0588  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  36.54 
 
 		 694 aa  40.8  0.006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0895503  normal  0.0578993 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1879  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  32.81 
 
 		 410 aa  40.8  0.006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.281207  normal  0.354147 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1431  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  33.9 
 
 		 264 aa  40.8  0.006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2260  methyl-viologen-reducing hydrogenase delta subunit  39.73 
 
 		 807 aa  40.8  0.006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2239  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  36.54 
 
 		 673 aa  40.4  0.007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.350238  normal  0.0521387 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2219  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  33.33 
 
 		 373 aa  40.8  0.007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1539  electron transfer flavoprotein beta-subunit  39.34 
 
 		 439 aa  40.8  0.007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.345257  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20700  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  36 
 
 		 370 aa  40.4  0.007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.921643  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0013  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.71 
 
 		 282 aa  40.8  0.007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0494  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  35.42 
 
 		 519 aa  40.4  0.007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0912  Fe-S cluster domain protein  38 
 
 		 443 aa  40.8  0.007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0546  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  43.48 
 
 		 749 aa  40.8  0.007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2679  putative polyferredoxin  44 
 
 		 287 aa  40.4  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1097  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  41.67 
 
 		 58 aa  40.8  0.007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1086  NADH dehydrogenase (quinone)  33.33 
 
 		 526 aa  40.4  0.008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1862  keto/oxoacid ferredoxin oxidoreductase subunit  38.46 
 
 		 67 aa  40.4  0.008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00222971  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0204  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit alpha  44.9 
 
 		 806 aa  40.4  0.008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00731411  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2557  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  32.2 
 
 		 369 aa  40.4  0.008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.75783  normal  0.24962 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0335  hydrogenase large subunit-like protein  39.58 
 
 		 448 aa  40.4  0.008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2785  putative polyferredoxin  44 
 
 		 287 aa  40.4  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.635315  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2766  putative polyferredoxin  44 
 
 		 287 aa  40.4  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3087  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  43.86 
 
 		 67 aa  40.4  0.008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000309533  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0138  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  37.93 
 
 		 74 aa  40.4  0.008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.425374  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2897  putative polyferredoxin  44 
 
 		 287 aa  40.4  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02950  putative PAS/PAC sensor protein  34.62 
 
 		 877 aa  40.4  0.008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4176  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  32.79 
 
 		 755 aa  40.4  0.008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000648689  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1108  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  38 
 
 		 357 aa  40  0.009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000240222  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00995  predicted 4Fe-4S membrane protein  38 
 
 		 357 aa  40  0.009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.468717  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0471  NADH dehydrogenase (quinone)  38.46 
 
 		 620 aa  40.4  0.009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00000177124  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2273  putative pyruvate oxidoreductase  34.29 
 
 		 1197 aa  40.4  0.009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1102  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  38 
 
 		 357 aa  40  0.009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1371  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  42.62 
 
 		 92 aa  40.4  0.009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0708  pyruvate ferredoxin/flavodoxin oxidoreductase, delta subunit  39.13 
 
 		 86 aa  40.4  0.009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.218436  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01002  hypothetical protein  38 
 
 		 357 aa  40  0.009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.682335  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0318  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  41.67 
 
 		 550 aa  40  0.009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1803  pyruvate:ferredoxin (flavodoxin) oxidoreductase  33.8 
 
 		 1177 aa  40  0.01  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1913  pyruvate flavodoxin/ferredoxin oxidoreductase domain-containing protein  33.8 
 
 		 1177 aa  40  0.01  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3046  ferredoxin (flavodoxin) oxidoreductase  28.4 
 
 		 1190 aa  40  0.01  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0560  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.74 
 
 		 589 aa  40  0.01  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>