More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_1607 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_1607  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  100 
 
 
399 aa  816    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1879  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  50.51 
 
 
410 aa  407  1.0000000000000001e-112  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.281207  normal  0.354147 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1373  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  43.26 
 
 
399 aa  352  7e-96  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.255821  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1539  electron transfer flavoprotein beta-subunit  43.11 
 
 
439 aa  335  1e-90  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.345257  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1544  Electron transfer flavoprotein alpha/beta- subunit  49.24 
 
 
339 aa  331  1e-89  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2066  electron transfer flavoprotein subunit alpha  41.35 
 
 
448 aa  325  6e-88  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0684  electron transfer flavoprotein subunit alpha  41.88 
 
 
443 aa  323  2e-87  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0329544  normal  0.845757 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1358  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  41.46 
 
 
452 aa  323  3e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0059  electron transfer flavoprotein alpha and beta-subunits  47.02 
 
 
341 aa  322  8e-87  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00122913 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1936  Electron transfer flavoprotein alpha/beta- subunit  41.5 
 
 
441 aa  322  8e-87  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.993938  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2927  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  41.46 
 
 
452 aa  320  1.9999999999999998e-86  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2775  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  39.23 
 
 
428 aa  321  1.9999999999999998e-86  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00380307  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0571  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  41.48 
 
 
443 aa  319  5e-86  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.871139  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2415  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  40.7 
 
 
441 aa  318  9e-86  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2257  electron transfer flavoprotein subunit alpha  41.27 
 
 
442 aa  317  2e-85  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00336089  hitchhiker  0.0000000000804212 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1212  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  41.9 
 
 
441 aa  316  4e-85  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.72306  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1484  electron transfer flavoprotein alpha subunit  40.65 
 
 
397 aa  314  1.9999999999999998e-84  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.11518  normal  0.562863 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2796  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  48.04 
 
 
340 aa  312  6.999999999999999e-84  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2715  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  42.07 
 
 
439 aa  311  1e-83  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.777462 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0368  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  46.29 
 
 
338 aa  311  1e-83  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2786  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  41.96 
 
 
447 aa  311  2e-83  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2582  3-hydroxybutyryl-CoA dehydrogenase  44.78 
 
 
335 aa  309  5e-83  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2284  3-hydroxybutyryl-CoA dehydrogenase  44.78 
 
 
335 aa  309  5e-83  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.383741  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1467  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  41.71 
 
 
447 aa  307  2.0000000000000002e-82  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1501  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  40.6 
 
 
442 aa  306  3e-82  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2132  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  39.7 
 
 
436 aa  304  2.0000000000000002e-81  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000989021 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0304  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  42.21 
 
 
397 aa  304  2.0000000000000002e-81  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0309  electron transfer flavoprotein, alpha subunit/FixB family protein  41.77 
 
 
397 aa  302  6.000000000000001e-81  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2086  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  40.33 
 
 
436 aa  300  3e-80  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1078  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  47.56 
 
 
335 aa  298  1e-79  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.224584 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0583  electron transfer flavoprotein alpha subunit  48.33 
 
 
341 aa  298  1e-79  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1316  electron transfer flavoprotein alpha subunit  41.34 
 
 
401 aa  298  1e-79  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0957  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  46.04 
 
 
342 aa  290  4e-77  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1354  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  44.28 
 
 
334 aa  289  6e-77  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00167442  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1435  electron transfer flavoprotein fixB (alpha subunit)  44.55 
 
 
367 aa  289  7e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000130268  normal  0.0153048 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3597  electron transfer flavoprotein alpha subunit  45.71 
 
 
342 aa  289  8e-77  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7738  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  44.51 
 
 
374 aa  282  7.000000000000001e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0342501  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10530  electron transfer flavoprotein, alpha subunit, FixB  44.48 
 
 
360 aa  281  1e-74  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.291846  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2314  electron transfer flavoprotein beta-subunit  44.55 
 
 
371 aa  279  6e-74  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.261239  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0131  electron transfer flavoprotein alpha subunit  44.14 
 
 
333 aa  277  2e-73  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1195  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  43.19 
 
 
364 aa  275  1.0000000000000001e-72  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.028424 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1479  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  43.19 
 
 
364 aa  275  1.0000000000000001e-72  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3576  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  44.28 
 
 
369 aa  272  6e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.846794  normal  0.141898 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2266  electron transfer flavoprotein  42.94 
 
 
365 aa  272  8.000000000000001e-72  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1261  electron transfer flavoprotein, alpha subunit-like protein  45.43 
 
 
338 aa  270  2e-71  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1194  electron transfer flavoprotein alpha subunit  45.43 
 
 
338 aa  270  2e-71  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1369  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  42.73 
 
 
374 aa  270  4e-71  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0654  electron transfer flavoprotein, alpha subunit-like protein  44.79 
 
 
317 aa  268  1e-70  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.480174  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1554  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  43.2 
 
 
364 aa  266  4e-70  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.243155  normal  0.702054 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2132  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  41.52 
 
 
346 aa  266  4e-70  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2861  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  41.54 
 
 
329 aa  266  5e-70  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1779  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  42.9 
 
 
325 aa  265  7e-70  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0645  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  41.49 
 
 
345 aa  266  7e-70  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.229702  hitchhiker  0.000990499 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2372  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  41.89 
 
 
346 aa  260  3e-68  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5085  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  42.3 
 
 
368 aa  260  3e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0476  electron transfer flavoprotein alpha subunit  38.46 
 
 
350 aa  260  4e-68  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000000000313809  decreased coverage  0.000297308 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0141  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  40.06 
 
 
369 aa  259  5.0000000000000005e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1089  electron transfer flavoprotein beta-subunit  42.09 
 
 
368 aa  258  9e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.419334  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3647  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  40.92 
 
 
329 aa  258  2e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0488  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  41.02 
 
 
370 aa  257  2e-67  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4014  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  42.77 
 
 
663 aa  257  2e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.797538  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1836  electron transfer flavoprotein alpha subunit  41.9 
 
 
325 aa  256  4e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0730508  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4534  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  40.98 
 
 
328 aa  255  8e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0891717  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2199  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  38.78 
 
 
347 aa  254  3e-66  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5047  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  41.69 
 
 
375 aa  253  3e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.303357  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1699  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  41.49 
 
 
326 aa  253  6e-66  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.440081  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0776  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  41.67 
 
 
339 aa  252  7e-66  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0985  electron transfer flavoprotein subunit beta  42.09 
 
 
367 aa  252  9.000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.104458 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3615  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  41.94 
 
 
368 aa  251  1e-65  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0544664 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6229  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  41.25 
 
 
370 aa  248  1e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4447  electron transfer flavoprotein beta-subunit  40.48 
 
 
369 aa  248  2e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0635  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  36.72 
 
 
610 aa  245  9.999999999999999e-64  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.3535  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5871  protein FixB  41.27 
 
 
368 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0138766  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4928  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  41.09 
 
 
370 aa  241  1e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1248  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  36.58 
 
 
601 aa  239  8e-62  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2298  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  38.53 
 
 
328 aa  230  4e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.8751  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1997  electron transfer flavoprotein alpha subunit  39.47 
 
 
352 aa  228  1e-58  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3686  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  37.31 
 
 
348 aa  225  9e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3167  electron transfer flavoprotein alpha subunit  38.61 
 
 
328 aa  225  1e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.144656  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2625  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  38.23 
 
 
325 aa  220  3e-56  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000950552  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0411  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  38.11 
 
 
325 aa  220  3e-56  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3222  electron transfer flavoprotein alpha subunit  37.31 
 
 
325 aa  219  6e-56  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0697  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  37.46 
 
 
317 aa  219  7.999999999999999e-56  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0107  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  37.92 
 
 
329 aa  219  8.999999999999998e-56  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.281869 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1857  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  36.59 
 
 
330 aa  218  1e-55  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.519797  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0605  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  36.39 
 
 
325 aa  217  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4649  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  36.09 
 
 
325 aa  216  5e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4269  electron transfer flavoprotein, alpha subunit (alpha-ETF)  36.09 
 
 
325 aa  216  5e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4650  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  36.09 
 
 
325 aa  216  5e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4350  electron transfer flavoprotein alpha subunit  36.09 
 
 
325 aa  216  8e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.233822  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4630  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  36.09 
 
 
325 aa  216  8e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0583219  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4418  electron transfer flavoprotein subunit alpha  36.09 
 
 
325 aa  215  9e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4257  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  36.09 
 
 
325 aa  215  9e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4634  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  36.09 
 
 
325 aa  215  9e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4759  electron transfer flavoprotein subunit alpha  36.09 
 
 
325 aa  215  9e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0831  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  37.61 
 
 
325 aa  211  2e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1075  electron transfer flavoprotein alpha subunit  35.76 
 
 
320 aa  197  3e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0540  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  36.31 
 
 
589 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.448343  normal  0.108603 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3700  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  33.95 
 
 
327 aa  196  6e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0768904  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3658  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  34.93 
 
 
320 aa  194  3e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>