191 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_0380 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008228  Patl_0380  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  100 
 
 
71 aa  147  4e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2580  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  46.03 
 
 
135 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2625  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  46.03 
 
 
135 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0538354  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2619  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  46.03 
 
 
135 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1388  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  52.83 
 
 
118 aa  55.5  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0307097  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3481  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  49.09 
 
 
111 aa  54.3  0.0000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5001  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  49.06 
 
 
98 aa  52.8  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000620576  normal  0.363374 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1896  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  50 
 
 
109 aa  52  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3156  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  42.62 
 
 
135 aa  51.2  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.247179  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4871  putative ferrodoxin  50 
 
 
106 aa  50.4  0.000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.419636  normal  0.314956 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2223  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  48 
 
 
75 aa  50.4  0.000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.454145 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50970  Electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  41.94 
 
 
174 aa  50.1  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0817561  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2056  hydrogenase, Fe-only  46.94 
 
 
644 aa  49.3  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000410653  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0272  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  40.38 
 
 
66 aa  48.9  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0565502 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0039  DNA-directed RNA polymerase subunit D  37.5 
 
 
267 aa  48.9  0.00003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5008  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  44.23 
 
 
113 aa  47.8  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.308235  normal  0.685027 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3191  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  41.07 
 
 
229 aa  47.8  0.00005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.662861 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2016  electron transport complex protein RnfB  41.94 
 
 
188 aa  47.4  0.00006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3288  putative ferrodoxin  45.28 
 
 
125 aa  47.4  0.00007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.197637 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1864  electron transport complex protein RnfB  43.55 
 
 
205 aa  46.6  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.164914  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4334  4Fe-4S ferredoxin  41.51 
 
 
111 aa  46.6  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.833828  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2173  electron transport complex protein RnfB  41.94 
 
 
193 aa  46.6  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0287954  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1831  electron transport complex protein RnfB  43.55 
 
 
189 aa  46.2  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.101638  normal  0.0584321 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0085  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  38 
 
 
840 aa  46.6  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21920  4Fe-4S ferredoxin protein  41.51 
 
 
130 aa  45.8  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3521  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  34.38 
 
 
66 aa  46.2  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000023193  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1479  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  42.86 
 
 
77 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1792  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  40.38 
 
 
565 aa  45.8  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0346302 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2894  electron transport complex protein RnfB  41.94 
 
 
178 aa  45.4  0.0003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0547  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  42.31 
 
 
107 aa  45.1  0.0003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0155  AMP-dependent synthetase and ligase  40 
 
 
627 aa  45.4  0.0003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5219  photosystem I iron-sulfur protein PsaC  41.18 
 
 
81 aa  45.1  0.0003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3084  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  50 
 
 
133 aa  45.1  0.0003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0358039 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1786  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  45.61 
 
 
192 aa  45.1  0.0003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0967  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  43.75 
 
 
395 aa  44.7  0.0004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4072  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  40.43 
 
 
80 aa  44.3  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.512619  normal  0.499645 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1585  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  42 
 
 
315 aa  44.7  0.0005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2041  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  37.29 
 
 
165 aa  44.3  0.0005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000212693  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1181  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  34.92 
 
 
94 aa  44.3  0.0006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1544  electron transport complex protein RnfB  41.94 
 
 
198 aa  44.3  0.0006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00831464 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1741  photosystem I subunit VII  39.71 
 
 
81 aa  44.3  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.518947 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1301  glutamate synthase (NADPH)  39.22 
 
 
510 aa  43.9  0.0007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1613  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  42.31 
 
 
531 aa  43.9  0.0007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2058  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  37.25 
 
 
67 aa  43.9  0.0007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2509  electron transport complex protein RnfB  40.32 
 
 
193 aa  43.9  0.0008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3484  photosystem I subunit VII  39.71 
 
 
81 aa  43.9  0.0008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.882203  normal  0.40097 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0979  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  43.75 
 
 
395 aa  43.9  0.0009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.363777  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0087  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  40.38 
 
 
114 aa  43.9  0.0009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.803989  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5623  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  43.1 
 
 
96 aa  43.9  0.0009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.147371  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1662  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  43.1 
 
 
96 aa  43.9  0.0009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.128776  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0485  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  43.1 
 
 
96 aa  43.9  0.0009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.251159  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2067  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  41.94 
 
 
189 aa  43.9  0.0009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0305749  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0570  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  43.1 
 
 
96 aa  43.9  0.0009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.193823  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0668  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  43.1 
 
 
96 aa  43.9  0.0009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2354  electron transport complex protein RnfB  42.86 
 
 
189 aa  43.9  0.0009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.720002  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2155  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  42.19 
 
 
196 aa  43.5  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02965  electron transport complex protein RnfB  37.1 
 
 
197 aa  43.5  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0994  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  45.45 
 
 
395 aa  43.5  0.001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0510  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  44.23 
 
 
559 aa  43.1  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0098001  normal  0.0322264 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0708  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  35.94 
 
 
153 aa  43.5  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  hitchhiker  0.00573386  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2135  protein of unknown function DUF362  38.6 
 
 
375 aa  43.1  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02730  electron transport complex protein RnfB  40.32 
 
 
193 aa  43.1  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000653403  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3251  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  39.29 
 
 
153 aa  43.5  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0934  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  42.37 
 
 
695 aa  43.5  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2274  electron transport complex protein RnfB  40.32 
 
 
204 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000478609  normal  0.512145 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2966  electron transport complex protein RnfB  38.1 
 
 
188 aa  43.5  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0244352  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2441  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  40 
 
 
680 aa  43.1  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2065  electron transport complex protein RnfB  40.32 
 
 
193 aa  43.5  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000637231  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1910  electron transport complex protein RnfB  40.32 
 
 
193 aa  43.5  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000153045  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1283  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  38.89 
 
 
566 aa  43.1  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2169  electron transport complex protein RnfB  40.32 
 
 
193 aa  43.5  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000157134  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0126  formate hydrogenlyase complex iron-sulfur subunit  34.85 
 
 
176 aa  43.5  0.001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3522  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  42.37 
 
 
128 aa  43.1  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2099  NADH dehydrogenase (quinone)  44 
 
 
634 aa  43.5  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0860011  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4546  electron transport complex protein RnfB  40.32 
 
 
199 aa  43.5  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2260  electron transport complex protein RnfB  40.32 
 
 
199 aa  43.5  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000168907  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2064  electron transport complex protein RnfB  40.32 
 
 
204 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000222941  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1849  electron transport complex protein RnfB  41.27 
 
 
199 aa  43.5  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000101519  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1569  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  33.33 
 
 
431 aa  43.5  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.433482  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0537  electron transport complex protein RnfB  37.1 
 
 
195 aa  42.7  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.05126  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2111  electron transport complex protein RnfB  40.32 
 
 
204 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0389991  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4883  putative ferredoxin  38.78 
 
 
77 aa  42.4  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.169548  normal  0.332371 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1174  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  39.06 
 
 
209 aa  42.7  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0031  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  37.74 
 
 
578 aa  42.4  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.43195 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2627  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  38.71 
 
 
186 aa  42.7  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0535  photosystem I subunit VII  38.24 
 
 
81 aa  42.4  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.966086  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3079  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  36.84 
 
 
670 aa  42.7  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.160134 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1636  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  41.38 
 
 
96 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002948  electron transport complex protein RnfB  37.1 
 
 
198 aa  42.7  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00169587  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14300  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  33.33 
 
 
331 aa  42.4  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  4.06573e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2418  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  41.82 
 
 
652 aa  42.4  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1403  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  36.07 
 
 
92 aa  42.7  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0826775  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0702  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  34.38 
 
 
153 aa  42.7  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1754  ferredoxin  47.17 
 
 
139 aa  42.4  0.002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1157  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  35.62 
 
 
177 aa  42.7  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1278  photosystem I subunit VII  39.71 
 
 
81 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26051  photosystem I subunit VII  43.64 
 
 
81 aa  42.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1609  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  41.38 
 
 
96 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.170259  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2240  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  41.38 
 
 
96 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0164643  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2043  electron transport complex protein RnfB  41.27 
 
 
189 aa  42.4  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0243874  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>