97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_0039 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007955  Mbur_0039  DNA-directed RNA polymerase subunit D  100 
 
 		 267 aa  546  1e-154  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0075  DNA-directed RNA polymerase subunit D  63.77 
 
 		 266 aa  357  9e-98  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1803  DNA-directed RNA polymerase subunit D  47.08 
 
 		 276 aa  264  1e-69  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0972243  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2899  DNA-directed RNA polymerase subunit D  47.08 
 
 		 272 aa  259  3e-68  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0578788  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1244  DNA-directed RNA polymerase subunit D  46.49 
 
 		 275 aa  255  5e-67  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00140782  normal  0.836144 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2222  DNA-directed RNA polymerase subunit D  44.53 
 
 		 276 aa  248  5e-65  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1621  RNA polymerase, insert  44.44 
 
 		 264 aa  246  3e-64  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2385  DNA-directed RNA polymerase subunit D  42.7 
 
 		 273 aa  236  4e-61  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0325899  normal  0.710013 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2592  RNA polymerase insert  38.75 
 
 		 259 aa  186  3e-46  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.906586  normal  0.218784 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0423  RNA polymerase insert  39.63 
 
 		 249 aa  181  1e-44  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1819  RNA polymerase insert  38.64 
 
 		 250 aa  179  4e-44  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2521  RNA polymerase insert  36.23 
 
 		 247 aa  163  3e-39  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.088721  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2551  RNA polymerase insert  38.31 
 
 		 249 aa  161  1e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0280  RNA polymerase, insert  34.9 
 
 		 283 aa  149  4e-35  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2097  DNA-directed RNA polymerase, subunit D  36.09 
 
 		 258 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1969  RNA polymerase insert  34.88 
 
 		 262 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00862498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2145  DNA-directed RNA polymerase, subunit D  31.97 
 
 		 262 aa  144  1e-33  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  unclonable  0.0000000000343639  hitchhiker  0.000345758 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1399  RNA polymerase insert  33.21 
 
 		 273 aa  144  2e-33  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1052  RNA polymerase insert  33.46 
 
 		 265 aa  142  4e-33  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.127014  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0697  RNA polymerase, insert  32.7 
 
 		 262 aa  141  9.999999999999999e-33  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00773924  normal  0.0619032 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_13566  predicted protein  29.58 
 
 		 320 aa  133  1.9999999999999998e-30  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2327  RNA polymerase, insert  35.02 
 
 		 259 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.000000580045  hitchhiker  0.00000634877 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1166  RNA polymerase insert  28.68 
 
 		 305 aa  129  6e-29  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80709  45 kDa subunit of RNA polymerase II  32.09 
 
 		 315 aa  112  6e-24  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0428  RNA polymerase insert  36.31 
 
 		 221 aa  106  4e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0123472 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_74652  RNA polymerase III (C) subunit  28.62 
 
 		 336 aa  106  4e-22  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.621842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0271  DNA-directed RNA polymerase, subunit D  41.61 
 
 		 180 aa  95.9  6e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06252  RNA polymerase II subunit 3 (AFU_orthologue; AFUA_2G13090)  35.39 
 
 		 333 aa  95.1  9e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.586686  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0567  RNA polymerase insert  41.61 
 
 		 180 aa  95.5  9e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.555923 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1351  RNA polymerase insert  41.61 
 
 		 180 aa  94.7  1e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.146665  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119616  DNA-directed RNA polymerase II subunit 3  28.23 
 
 		 318 aa  93.2  4e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.67705  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND03040  conserved hypothetical protein  25.67 
 
 		 350 aa  90.5  3e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.612704  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0633  RNA polymerase insert  40.88 
 
 		 195 aa  90.1  4e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02415  DNA-directed RNA polymerase I and III subunit Rpc40, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G13720)  27.24 
 
 		 373 aa  88.6  9e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0361662 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1098  RNA polymerase insert  36.99 
 
 		 197 aa  87.8  2e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35770  predicted protein  26.77 
 
 		 360 aa  85.9  6e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.000177628  normal  1 
 
 
-
 
NC_006687  CNE05120  RNA polymerase II subunit 3, putative  30.24 
 
 		 377 aa  72.8  0.000000000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_52094  predicted protein  23.67 
 
 		 319 aa  71.6  0.00000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.830096  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3575  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  36.92 
 
 		 367 aa  50.4  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0152  aldo/keto reductase  43.14 
 
 		 315 aa  50.1  0.00004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.145765  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0040  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  32.31 
 
 		 367 aa  50.1  0.00004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1711  pyruvate ferredoxin/flavodoxin oxidoreductase, delta subunit  34.94 
 
 		 89 aa  49.7  0.00005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0380  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  37.5 
 
 		 71 aa  48.9  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2588  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit F  33.78 
 
 		 486 aa  47.8  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.228886 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3425  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  30.3 
 
 		 82 aa  47.4  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.121057  hitchhiker  0.00916142 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1540  hypothetical protein  40 
 
 		 379 aa  48.1  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1679  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  41.76 
 
 		 154 aa  47.4  0.0003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.247517  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00640  dissimilatory sulfite reductase (desulfoviridin), alpha/beta subunit  41.07 
 
 		 62 aa  47  0.0003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.0000382755  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2242  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  35.8 
 
 		 387 aa  46.6  0.0004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0193529  normal  0.0185551 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0096  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  36.84 
 
 		 383 aa  46.6  0.0005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.337966  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0591  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  33.75 
 
 		 390 aa  46.2  0.0005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.463263  normal  0.063336 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2041  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  34.85 
 
 		 165 aa  46.2  0.0006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000212693  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1215  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  34.48 
 
 		 368 aa  46.2  0.0006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1609  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  39.66 
 
 		 96 aa  45.8  0.0007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.170259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2240  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  39.66 
 
 		 96 aa  45.8  0.0007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0164643  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1636  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  39.66 
 
 		 96 aa  45.8  0.0007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2477  glycyl-radical enzyme activating protein family  31.76 
 
 		 310 aa  45.4  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.731109  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0799  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  39.56 
 
 		 154 aa  45.4  0.001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.366557  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1586  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  38.89 
 
 		 65 aa  45.1  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2040  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  28.57 
 
 		 194 aa  45.1  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0556  nitroreductase  34.48 
 
 		 345 aa  45.1  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3050  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  33.33 
 
 		 432 aa  45.1  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4080  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  26.6 
 
 		 197 aa  45.4  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0562629 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5106  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  25.27 
 
 		 188 aa  45.1  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0524  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  31 
 
 		 368 aa  45.4  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1089  iron-sulfur cluster-binding protein  28.12 
 
 		 368 aa  44.7  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.0040129  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02630  dissimilatory sulfite reductase (desulfoviridin), alpha/beta subunit  41.18 
 
 		 57 aa  44.3  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.862545 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1113  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  29.07 
 
 		 153 aa  43.9  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0559  NADH dehydrogenase (quinone)  35.71 
 
 		 624 aa  44.7  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.382532  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5623  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  37.93 
 
 		 96 aa  44.7  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.147371  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0485  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  37.93 
 
 		 96 aa  44.7  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.251159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0202  pyruvate ferredoxin/flavodoxin oxidoreductase, delta subunit  40.32 
 
 		 86 aa  44.3  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0570  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  37.93 
 
 		 96 aa  44.7  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.193823  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0668  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  37.93 
 
 		 96 aa  44.7  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1662  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  37.93 
 
 		 96 aa  44.7  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.128776  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3216  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  28.28 
 
 		 168 aa  44.7  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3660  NADH ubiquinone oxidoreductase, 20 kDa subunit  27.27 
 
 		 256 aa  44.3  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1226  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  33.33 
 
 		 432 aa  43.9  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0796  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  27.1 
 
 		 368 aa  43.9  0.003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.18226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0173  pyruvate ferredoxin/flavodoxin oxidoreductase, delta subunit  38.71 
 
 		 85 aa  43.5  0.003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0221  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  40.74 
 
 		 154 aa  43.9  0.003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.452485  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0626  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  34.52 
 
 		 389 aa  43.1  0.004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0651793  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02503  ferredoxin  36.07 
 
 		 165 aa  43.1  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2135  protein of unknown function DUF362  36.36 
 
 		 375 aa  43.1  0.004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0153  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  40 
 
 		 272 aa  43.1  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000000371436  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1641  aldo/keto reductase  40 
 
 		 315 aa  43.1  0.005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.316031  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0270  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  30.43 
 
 		 368 aa  42.7  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.241383 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0504  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  41.94 
 
 		 285 aa  42.7  0.006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.720822 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0708  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  28.74 
 
 		 153 aa  42.7  0.006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  hitchhiker  0.00573386  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1921  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  31.65 
 
 		 153 aa  42.7  0.007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.160971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0226  NADH dehydrogenase (quinone)  33.73 
 
 		 632 aa  42.7  0.007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.096685  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0398  hypothetical protein  30.43 
 
 		 403 aa  42.4  0.008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.503263  normal  0.749229 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1896  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  27.85 
 
 		 109 aa  42.4  0.008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0549  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  37.1 
 
 		 72 aa  42  0.009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.116211 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05703  hypothetical protein similar to : Formate hydrogenlyase subunit 6/NADH:ubiquinone oxidoreductase 23 kD subunit (Broad)  32.14 
 
 		 224 aa  42  0.009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.803618 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0574  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  36.07 
 
 		 62 aa  42  0.01  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.208407  normal  0.175405 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1536  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  22.94 
 
 		 170 aa  42  0.01  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>