54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mevan_0633 on replicon NC_009634
Organism: Methanococcus vannielii SB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009634  Mevan_0633  RNA polymerase insert  100 
 
 		 195 aa  396  1e-109  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0567  RNA polymerase insert  88.89 
 
 		 180 aa  332  2e-90  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.555923 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0271  DNA-directed RNA polymerase, subunit D  88.33 
 
 		 180 aa  331  4e-90  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1351  RNA polymerase insert  87.78 
 
 		 180 aa  329  2e-89  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.146665  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1098  RNA polymerase insert  69.59 
 
 		 197 aa  278  5e-74  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1803  DNA-directed RNA polymerase subunit D  44.38 
 
 		 276 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0972243  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2222  DNA-directed RNA polymerase subunit D  41.99 
 
 		 276 aa  123  1e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1819  RNA polymerase insert  43.29 
 
 		 250 aa  122  3e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1244  DNA-directed RNA polymerase subunit D  46.02 
 
 		 275 aa  117  9.999999999999999e-26  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00140782  normal  0.836144 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2899  DNA-directed RNA polymerase subunit D  43.79 
 
 		 272 aa  114  7.999999999999999e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0578788  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2385  DNA-directed RNA polymerase subunit D  44.81 
 
 		 273 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0325899  normal  0.710013 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0423  RNA polymerase insert  47.06 
 
 		 249 aa  110  1.0000000000000001e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1969  RNA polymerase insert  33.48 
 
 		 262 aa  109  2.0000000000000002e-23  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00862498  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0075  DNA-directed RNA polymerase subunit D  51.11 
 
 		 266 aa  108  4.0000000000000004e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2521  RNA polymerase insert  38.29 
 
 		 247 aa  107  8.000000000000001e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.088721  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2551  RNA polymerase insert  44.36 
 
 		 249 aa  106  3e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1621  RNA polymerase, insert  41.1 
 
 		 264 aa  103  2e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0280  RNA polymerase, insert  43.24 
 
 		 283 aa  102  3e-21  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2097  DNA-directed RNA polymerase, subunit D  34.93 
 
 		 258 aa  101  6e-21  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0697  RNA polymerase, insert  32.16 
 
 		 262 aa  100  1e-20  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00773924  normal  0.0619032 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0428  RNA polymerase insert  36.02 
 
 		 221 aa  99.8  2e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0123472 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2327  RNA polymerase, insert  34.06 
 
 		 259 aa  97.4  1e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.000000580045  hitchhiker  0.00000634877 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1399  RNA polymerase insert  38.85 
 
 		 273 aa  96.7  2e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2592  RNA polymerase insert  40.3 
 
 		 259 aa  96.3  3e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.906586  normal  0.218784 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0039  DNA-directed RNA polymerase subunit D  40.88 
 
 		 267 aa  90.1  2e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1166  RNA polymerase insert  36.69 
 
 		 305 aa  85.1  6e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_52094  predicted protein  34.41 
 
 		 319 aa  82.8  0.000000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.830096  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_13566  predicted protein  33.33 
 
 		 320 aa  81.6  0.000000000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35770  predicted protein  31 
 
 		 360 aa  81.3  0.00000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.000177628  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1052  RNA polymerase insert  35.51 
 
 		 265 aa  80.5  0.00000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.127014  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_74652  RNA polymerase III (C) subunit  34.57 
 
 		 336 aa  78.2  0.00000000000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.621842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2145  DNA-directed RNA polymerase, subunit D  35.21 
 
 		 262 aa  78.2  0.00000000000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  unclonable  0.0000000000343639  hitchhiker  0.000345758 
 
 
-
 
NC_006686  CND03040  conserved hypothetical protein  33.7 
 
 		 350 aa  74.7  0.0000000000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.612704  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119616  DNA-directed RNA polymerase II subunit 3  36.94 
 
 		 318 aa  73.9  0.000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.67705  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02415  DNA-directed RNA polymerase I and III subunit Rpc40, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G13720)  34.12 
 
 		 373 aa  70.1  0.00000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0361662 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06252  RNA polymerase II subunit 3 (AFU_orthologue; AFUA_2G13090)  36.49 
 
 		 333 aa  68.9  0.00000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.586686  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80709  45 kDa subunit of RNA polymerase II  30.72 
 
 		 315 aa  65.9  0.0000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006687  CNE05120  RNA polymerase II subunit 3, putative  52.17 
 
 		 377 aa  61.6  0.000000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4251  DNA-directed RNA polymerase subunit alpha  25.76 
 
 		 334 aa  51.2  0.000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00078349  unclonable  0.00000000000293688 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04496  DNA-directed RNA polymerase subunit alpha  24.74 
 
 		 332 aa  50.8  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4217  DNA-directed RNA polymerase subunit alpha  26.09 
 
 		 329 aa  48.1  0.00007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.969787  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0419  DNA-directed RNA polymerase subunit alpha  25.71 
 
 		 330 aa  48.1  0.00008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0395  DNA-directed RNA polymerase subunit alpha  25.24 
 
 		 330 aa  47.8  0.0001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0780  DNA-directed RNA polymerase subunit alpha  24.74 
 
 		 332 aa  47.4  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0642076 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4774  DNA-directed RNA polymerase subunit alpha  24.14 
 
 		 338 aa  46.6  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000131409 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0744  DNA-directed RNA polymerase subunit alpha  23.88 
 
 		 334 aa  45.8  0.0004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0319  DNA-directed RNA polymerase subunit alpha  24.6 
 
 		 329 aa  45.1  0.0006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1366  DNA-directed RNA polymerase subunit alpha  24.35 
 
 		 336 aa  44.3  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00249264  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1320  DNA-directed RNA polymerase subunit alpha  24.35 
 
 		 336 aa  44.3  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000100462  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1862  DNA-directed RNA polymerase, alpha subunit  24.4 
 
 		 324 aa  44.3  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1829  DNA-directed RNA polymerase subunit alpha  22.96 
 
 		 327 aa  43.5  0.002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.127798  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0362  DNA-directed RNA polymerase subunit alpha  22.96 
 
 		 327 aa  43.5  0.002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000335982  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0984  DNA-directed RNA polymerase subunit alpha  22.5 
 
 		 329 aa  42.4  0.004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00112037  hitchhiker  0.00529034 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0304  DNA-directed RNA polymerase subunit alpha  24.63 
 
 		 328 aa  42.7  0.004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000011247  hitchhiker  0.000110568 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>