61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_1621 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008553  Mthe_1621  RNA polymerase, insert  100 
 
 		 264 aa  533  1e-150  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0075  DNA-directed RNA polymerase subunit D  47.33 
 
 		 266 aa  252  5.000000000000001e-66  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0039  DNA-directed RNA polymerase subunit D  44.44 
 
 		 267 aa  246  3e-64  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2222  DNA-directed RNA polymerase subunit D  45.42 
 
 		 276 aa  232  4.0000000000000004e-60  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1244  DNA-directed RNA polymerase subunit D  45.05 
 
 		 275 aa  220  9.999999999999999e-57  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00140782  normal  0.836144 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1803  DNA-directed RNA polymerase subunit D  44.57 
 
 		 276 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0972243  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2385  DNA-directed RNA polymerase subunit D  42.28 
 
 		 273 aa  209  3e-53  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0325899  normal  0.710013 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2899  DNA-directed RNA polymerase subunit D  39.34 
 
 		 272 aa  194  1e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0578788  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1819  RNA polymerase insert  38.58 
 
 		 250 aa  162  4.0000000000000004e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2592  RNA polymerase insert  34.83 
 
 		 259 aa  152  5e-36  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.906586  normal  0.218784 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1052  RNA polymerase insert  33.71 
 
 		 265 aa  152  7e-36  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.127014  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2551  RNA polymerase insert  35.57 
 
 		 249 aa  146  3e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0423  RNA polymerase insert  34.08 
 
 		 249 aa  145  5e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2145  DNA-directed RNA polymerase, subunit D  35.97 
 
 		 262 aa  142  7e-33  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  unclonable  0.0000000000343639  hitchhiker  0.000345758 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1399  RNA polymerase insert  32.48 
 
 		 273 aa  139  4.999999999999999e-32  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2521  RNA polymerase insert  33.33 
 
 		 247 aa  138  7.999999999999999e-32  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.088721  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0280  RNA polymerase, insert  33.96 
 
 		 283 aa  132  6.999999999999999e-30  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1166  RNA polymerase insert  26.59 
 
 		 305 aa  118  7.999999999999999e-26  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1969  RNA polymerase insert  30.48 
 
 		 262 aa  116  3e-25  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00862498  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0697  RNA polymerase, insert  31.56 
 
 		 262 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00773924  normal  0.0619032 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0428  RNA polymerase insert  36.88 
 
 		 221 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0123472 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2327  RNA polymerase, insert  30.94 
 
 		 259 aa  109  5e-23  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.000000580045  hitchhiker  0.00000634877 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2097  DNA-directed RNA polymerase, subunit D  30.68 
 
 		 258 aa  105  9e-22  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0633  RNA polymerase insert  41.1 
 
 		 195 aa  103  3e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_13566  predicted protein  27.01 
 
 		 320 aa  102  5e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0271  DNA-directed RNA polymerase, subunit D  45.04 
 
 		 180 aa  101  1e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1351  RNA polymerase insert  44.27 
 
 		 180 aa  100  2e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.146665  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0567  RNA polymerase insert  43.51 
 
 		 180 aa  100  3e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.555923 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1098  RNA polymerase insert  37.76 
 
 		 197 aa  98.2  1e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80709  45 kDa subunit of RNA polymerase II  34.86 
 
 		 315 aa  87.4  2e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35770  predicted protein  27.63 
 
 		 360 aa  86.3  4e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.000177628  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND03040  conserved hypothetical protein  28.41 
 
 		 350 aa  84  0.000000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.612704  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_74652  RNA polymerase III (C) subunit  26.64 
 
 		 336 aa  79.7  0.00000000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.621842  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06252  RNA polymerase II subunit 3 (AFU_orthologue; AFUA_2G13090)  27.44 
 
 		 333 aa  75.9  0.0000000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.586686  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02415  DNA-directed RNA polymerase I and III subunit Rpc40, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G13720)  26.1 
 
 		 373 aa  75.9  0.0000000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0361662 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119616  DNA-directed RNA polymerase II subunit 3  30.94 
 
 		 318 aa  75.1  0.000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.67705  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_52094  predicted protein  26.3 
 
 		 319 aa  68.2  0.0000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.830096  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE05120  RNA polymerase II subunit 3, putative  43.48 
 
 		 377 aa  61.2  0.00000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1686  NADH ubiquinone oxidoreductase 20 kDa subunit  29.06 
 
 		 266 aa  52.8  0.000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1055  hypothetical protein  43.48 
 
 		 539 aa  48.5  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2247  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  27.87 
 
 		 427 aa  48.5  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000011371  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2754  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  31.43 
 
 		 426 aa  44.7  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.964993  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21920  4Fe-4S ferredoxin protein  41.18 
 
 		 130 aa  45.1  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2467  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  24.81 
 
 		 371 aa  45.4  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00514975  hitchhiker  0.000746109 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3099  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  31.85 
 
 		 369 aa  45.1  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0141541  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0541  pyruvate ferredoxin/flavodoxin oxidoreductase, delta subunit  38.6 
 
 		 87 aa  44.3  0.002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0347  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  38.6 
 
 		 269 aa  43.9  0.002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1192  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  40.43 
 
 		 105 aa  44.3  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1492  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  32.43 
 
 		 247 aa  43.5  0.003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.229965  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2707  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  38.46 
 
 		 73 aa  43.5  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.670596  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1096  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  26.19 
 
 		 266 aa  43.5  0.004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0514529  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2321  pyruvate ferredoxin/flavodoxin oxidoreductase, delta subunit  36.49 
 
 		 81 aa  43.1  0.004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1281  hypothetical protein  40.91 
 
 		 455 aa  43.5  0.004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3287  nitroreductase  29.41 
 
 		 273 aa  43.1  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.954102 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3022  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  45.1 
 
 		 73 aa  42.7  0.005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003579  radical activating enzyme  40.82 
 
 		 293 aa  42.7  0.006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1373  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  42.86 
 
 		 399 aa  42.4  0.007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.255821  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17450  glycyl-radical enzyme activator family protein  36.54 
 
 		 311 aa  42.4  0.008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.478583  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1543  nitroreductase  30.61 
 
 		 274 aa  42.4  0.008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.000000000268728  normal  0.225024 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1188  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.3 
 
 		 285 aa  42.4  0.008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4618  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  36.67 
 
 		 310 aa  42  0.01  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>