56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1803 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_1803  DNA-directed RNA polymerase subunit D  100 
 
 		 276 aa  563  1.0000000000000001e-159  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0972243  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2222  DNA-directed RNA polymerase subunit D  62.64 
 
 		 276 aa  366  1e-100  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1244  DNA-directed RNA polymerase subunit D  61.9 
 
 		 275 aa  350  2e-95  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00140782  normal  0.836144 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2385  DNA-directed RNA polymerase subunit D  59.41 
 
 		 273 aa  342  2.9999999999999997e-93  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0325899  normal  0.710013 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2899  DNA-directed RNA polymerase subunit D  57.72 
 
 		 272 aa  333  1e-90  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0578788  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0039  DNA-directed RNA polymerase subunit D  47.08 
 
 		 267 aa  264  1e-69  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0075  DNA-directed RNA polymerase subunit D  49.82 
 
 		 266 aa  261  6e-69  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1621  RNA polymerase, insert  44.57 
 
 		 264 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1399  RNA polymerase insert  38.49 
 
 		 273 aa  171  1e-41  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1819  RNA polymerase insert  37.22 
 
 		 250 aa  160  2e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0280  RNA polymerase, insert  37.12 
 
 		 283 aa  153  2.9999999999999998e-36  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2592  RNA polymerase insert  35.02 
 
 		 259 aa  152  7e-36  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.906586  normal  0.218784 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0423  RNA polymerase insert  36.36 
 
 		 249 aa  148  1.0000000000000001e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1166  RNA polymerase insert  33.71 
 
 		 305 aa  146  3e-34  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2551  RNA polymerase insert  38 
 
 		 249 aa  143  2e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1969  RNA polymerase insert  33.46 
 
 		 262 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00862498  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2521  RNA polymerase insert  34.08 
 
 		 247 aa  137  1e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.088721  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0697  RNA polymerase, insert  33.46 
 
 		 262 aa  137  2e-31  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00773924  normal  0.0619032 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1052  RNA polymerase insert  32.58 
 
 		 265 aa  134  9.999999999999999e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.127014  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2145  DNA-directed RNA polymerase, subunit D  32.39 
 
 		 262 aa  134  9.999999999999999e-31  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  unclonable  0.0000000000343639  hitchhiker  0.000345758 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0567  RNA polymerase insert  45.71 
 
 		 180 aa  132  6.999999999999999e-30  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.555923 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2097  DNA-directed RNA polymerase, subunit D  36.15 
 
 		 258 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0271  DNA-directed RNA polymerase, subunit D  44.57 
 
 		 180 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1351  RNA polymerase insert  44.57 
 
 		 180 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.146665  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0633  RNA polymerase insert  44.38 
 
 		 195 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_13566  predicted protein  32.12 
 
 		 320 aa  127  3e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2327  RNA polymerase, insert  33.71 
 
 		 259 aa  122  7e-27  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.000000580045  hitchhiker  0.00000634877 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0428  RNA polymerase insert  41.94 
 
 		 221 aa  122  8e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0123472 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1098  RNA polymerase insert  44.67 
 
 		 197 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35770  predicted protein  28.8 
 
 		 360 aa  107  1e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.000177628  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_74652  RNA polymerase III (C) subunit  32.28 
 
 		 336 aa  102  6e-21  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.621842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119616  DNA-directed RNA polymerase II subunit 3  36.46 
 
 		 318 aa  99  8e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.67705  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80709  45 kDa subunit of RNA polymerase II  39.26 
 
 		 315 aa  97.1  3e-19  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06252  RNA polymerase II subunit 3 (AFU_orthologue; AFUA_2G13090)  39.39 
 
 		 333 aa  97.1  3e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.586686  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND03040  conserved hypothetical protein  25.82 
 
 		 350 aa  90.1  3e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.612704  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE05120  RNA polymerase II subunit 3, putative  27.36 
 
 		 377 aa  88.2  1e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_52094  predicted protein  25.75 
 
 		 319 aa  79.3  0.00000000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.830096  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02415  DNA-directed RNA polymerase I and III subunit Rpc40, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G13720)  30.88 
 
 		 373 aa  78.6  0.0000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0361662 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1586  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  40.74 
 
 		 65 aa  50.4  0.00003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3425  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  40.85 
 
 		 82 aa  47  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.121057  hitchhiker  0.00916142 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2040  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  31.58 
 
 		 194 aa  44.7  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0885  putative oxidoreductase  26.72 
 
 		 612 aa  44.3  0.002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1127  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  41.33 
 
 		 301 aa  44.7  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.216131 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0774  aldo/keto reductase  40.82 
 
 		 315 aa  44.3  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000724112  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2591  DNA-directed RNA polymerase subunit alpha  28.57 
 
 		 321 aa  43.9  0.003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00931011  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0152  aldo/keto reductase  38.78 
 
 		 315 aa  43.9  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.145765  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0588  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  37.93 
 
 		 694 aa  43.1  0.005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0895503  normal  0.0578993 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0713  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  41.07 
 
 		 283 aa  42.7  0.006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0085  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  35.64 
 
 		 840 aa  43.1  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1838  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  39.66 
 
 		 671 aa  42.7  0.006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1641  aldo/keto reductase  42.86 
 
 		 315 aa  42.7  0.006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.316031  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2239  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  37.93 
 
 		 673 aa  42.7  0.007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.350238  normal  0.0521387 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1215  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  34.85 
 
 		 368 aa  42.7  0.007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0064  adenylylsulfate reductase, beta subunit  32.14 
 
 		 159 aa  42.7  0.007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1530  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  31.25 
 
 		 80 aa  42.4  0.009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0018  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  41.82 
 
 		 93 aa  42.4  0.009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0689181  normal  0.439492 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>