40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tneu_1969 on replicon NC_010525
Organism: Thermoproteus neutrophilus V24Sta



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010525  Tneu_1969  RNA polymerase insert  100 
 
 		 262 aa  538  9.999999999999999e-153  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00862498  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0697  RNA polymerase, insert  76.72 
 
 		 262 aa  441  1e-123  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00773924  normal  0.0619032 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2097  DNA-directed RNA polymerase, subunit D  76.34 
 
 		 258 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2327  RNA polymerase, insert  73.93 
 
 		 259 aa  384  1e-106  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.000000580045  hitchhiker  0.00000634877 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1166  RNA polymerase insert  51.49 
 
 		 305 aa  283  1.0000000000000001e-75  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1244  DNA-directed RNA polymerase subunit D  36.68 
 
 		 275 aa  154  9e-37  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00140782  normal  0.836144 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0039  DNA-directed RNA polymerase subunit D  34.88 
 
 		 267 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2222  DNA-directed RNA polymerase subunit D  36.29 
 
 		 276 aa  144  1e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1803  DNA-directed RNA polymerase subunit D  33.46 
 
 		 276 aa  140  9.999999999999999e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0972243  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0075  DNA-directed RNA polymerase subunit D  33.71 
 
 		 266 aa  132  6.999999999999999e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2145  DNA-directed RNA polymerase, subunit D  36.76 
 
 		 262 aa  129  3e-29  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  unclonable  0.0000000000343639  hitchhiker  0.000345758 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2385  DNA-directed RNA polymerase subunit D  33.73 
 
 		 273 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0325899  normal  0.710013 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2521  RNA polymerase insert  33.87 
 
 		 247 aa  125  9e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.088721  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2899  DNA-directed RNA polymerase subunit D  33.72 
 
 		 272 aa  125  1e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0578788  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2592  RNA polymerase insert  33.08 
 
 		 259 aa  123  3e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.906586  normal  0.218784 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0423  RNA polymerase insert  33.33 
 
 		 249 aa  120  1.9999999999999998e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0280  RNA polymerase, insert  34.32 
 
 		 283 aa  119  3e-26  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1052  RNA polymerase insert  34.02 
 
 		 265 aa  120  3e-26  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.127014  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1819  RNA polymerase insert  32.26 
 
 		 250 aa  118  7.999999999999999e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2551  RNA polymerase insert  34.57 
 
 		 249 aa  117  1.9999999999999998e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1621  RNA polymerase, insert  30.48 
 
 		 264 aa  116  3e-25  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_13566  predicted protein  29.68 
 
 		 320 aa  115  6e-25  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1399  RNA polymerase insert  31.6 
 
 		 273 aa  113  3e-24  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0633  RNA polymerase insert  33.48 
 
 		 195 aa  109  4.0000000000000004e-23  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0428  RNA polymerase insert  39.88 
 
 		 221 aa  109  4.0000000000000004e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0123472 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0567  RNA polymerase insert  33.92 
 
 		 180 aa  108  1e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.555923 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0271  DNA-directed RNA polymerase, subunit D  33.04 
 
 		 180 aa  106  3e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1351  RNA polymerase insert  33.04 
 
 		 180 aa  105  8e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.146665  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1098  RNA polymerase insert  43.24 
 
 		 197 aa  102  6e-21  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_52094  predicted protein  28.97 
 
 		 319 aa  97.8  1e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.830096  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06252  RNA polymerase II subunit 3 (AFU_orthologue; AFUA_2G13090)  30.37 
 
 		 333 aa  96.7  4e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.586686  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND03040  conserved hypothetical protein  29.64 
 
 		 350 aa  91.3  1e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.612704  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35770  predicted protein  28.05 
 
 		 360 aa  91.7  1e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.000177628  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80709  45 kDa subunit of RNA polymerase II  35.06 
 
 		 315 aa  85.5  7e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119616  DNA-directed RNA polymerase II subunit 3  35.93 
 
 		 318 aa  85.5  8e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.67705  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02415  DNA-directed RNA polymerase I and III subunit Rpc40, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G13720)  26.8 
 
 		 373 aa  79  0.00000000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0361662 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_74652  RNA polymerase III (C) subunit  33.71 
 
 		 336 aa  65.5  0.0000000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.621842  normal  1 
 
 
-
 
NC_006687  CNE05120  RNA polymerase II subunit 3, putative  30.69 
 
 		 377 aa  60.5  0.00000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0450  DNA-directed RNA polymerase subunit alpha  28.1 
 
 		 315 aa  43.9  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000064789  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2683  DNA-directed RNA polymerase, alpha subunit  27.5 
 
 		 312 aa  43.9  0.003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00290695  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>