55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maeo_1098 on replicon NC_009635
Organism: Methanococcus aeolicus Nankai-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009635  Maeo_1098  RNA polymerase insert  100 
 
 		 197 aa  401  1e-111  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0633  RNA polymerase insert  69.59 
 
 		 195 aa  278  5e-74  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0567  RNA polymerase insert  72.67 
 
 		 180 aa  256  1e-67  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.555923 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1351  RNA polymerase insert  72.09 
 
 		 180 aa  255  3e-67  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.146665  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0271  DNA-directed RNA polymerase, subunit D  71.51 
 
 		 180 aa  255  3e-67  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0423  RNA polymerase insert  48.84 
 
 		 249 aa  122  3e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1803  DNA-directed RNA polymerase subunit D  44.67 
 
 		 276 aa  121  8e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0972243  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0428  RNA polymerase insert  35.82 
 
 		 221 aa  115  5e-25  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0123472 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1819  RNA polymerase insert  40 
 
 		 250 aa  114  8.999999999999998e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1244  DNA-directed RNA polymerase subunit D  46.43 
 
 		 275 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00140782  normal  0.836144 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2551  RNA polymerase insert  46.1 
 
 		 249 aa  113  2.0000000000000002e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2222  DNA-directed RNA polymerase subunit D  42.86 
 
 		 276 aa  112  3e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2592  RNA polymerase insert  43.06 
 
 		 259 aa  108  4.0000000000000004e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.906586  normal  0.218784 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2899  DNA-directed RNA polymerase subunit D  44.29 
 
 		 272 aa  108  5e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0578788  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2385  DNA-directed RNA polymerase subunit D  40.37 
 
 		 273 aa  106  2e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0325899  normal  0.710013 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0075  DNA-directed RNA polymerase subunit D  43.36 
 
 		 266 aa  106  2e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2521  RNA polymerase insert  39.49 
 
 		 247 aa  105  4e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.088721  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1969  RNA polymerase insert  43.24 
 
 		 262 aa  102  4e-21  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00862498  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1621  RNA polymerase, insert  37.76 
 
 		 264 aa  98.2  6e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1399  RNA polymerase insert  37.8 
 
 		 273 aa  96.7  2e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2327  RNA polymerase, insert  39.19 
 
 		 259 aa  96.3  2e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.000000580045  hitchhiker  0.00000634877 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0697  RNA polymerase, insert  40.67 
 
 		 262 aa  95.5  5e-19  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00773924  normal  0.0619032 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_52094  predicted protein  35.96 
 
 		 319 aa  92.8  3e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.830096  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1166  RNA polymerase insert  36.91 
 
 		 305 aa  92  4e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0280  RNA polymerase, insert  37.09 
 
 		 283 aa  91.7  6e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2097  DNA-directed RNA polymerase, subunit D  31.76 
 
 		 258 aa  90.1  2e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1052  RNA polymerase insert  36.59 
 
 		 265 aa  90.5  2e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.127014  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0039  DNA-directed RNA polymerase subunit D  36.99 
 
 		 267 aa  87.8  9e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119616  DNA-directed RNA polymerase II subunit 3  35.67 
 
 		 318 aa  84.3  0.000000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.67705  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND03040  conserved hypothetical protein  33.33 
 
 		 350 aa  82.4  0.000000000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.612704  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_13566  predicted protein  31.11 
 
 		 320 aa  80.5  0.00000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2145  DNA-directed RNA polymerase, subunit D  33.33 
 
 		 262 aa  76.6  0.0000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  unclonable  0.0000000000343639  hitchhiker  0.000345758 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_74652  RNA polymerase III (C) subunit  29.89 
 
 		 336 aa  76.3  0.0000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.621842  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06252  RNA polymerase II subunit 3 (AFU_orthologue; AFUA_2G13090)  30.82 
 
 		 333 aa  73.9  0.000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.586686  normal  1 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35770  predicted protein  28.04 
 
 		 360 aa  71.2  0.000000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.000177628  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80709  45 kDa subunit of RNA polymerase II  29.45 
 
 		 315 aa  68.2  0.00000000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006687  CNE05120  RNA polymerase II subunit 3, putative  41.38 
 
 		 377 aa  61.6  0.000000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02415  DNA-directed RNA polymerase I and III subunit Rpc40, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G13720)  49.09 
 
 		 373 aa  59.7  0.00000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0361662 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4774  DNA-directed RNA polymerase subunit alpha  24.53 
 
 		 338 aa  50.8  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000131409 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2879  DNA-directed RNA polymerase, alpha subunit  25.52 
 
 		 319 aa  47  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1862  DNA-directed RNA polymerase, alpha subunit  24.09 
 
 		 324 aa  45.8  0.0004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2591  DNA-directed RNA polymerase subunit alpha  23.04 
 
 		 321 aa  45.4  0.0005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00931011  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1569  DNA-directed RNA polymerase subunit alpha  23.11 
 
 		 339 aa  45.1  0.0007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.246587  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2039  DNA-directed RNA polymerase subunit alpha  23.58 
 
 		 338 aa  43.1  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.343858  normal  0.530425 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2683  DNA-directed RNA polymerase, alpha subunit  28.14 
 
 		 312 aa  43.1  0.003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00290695  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1388  DNA-directed RNA polymerase subunit alpha  22.64 
 
 		 339 aa  43.1  0.003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.385663 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0395  DNA-directed RNA polymerase subunit alpha  25.44 
 
 		 330 aa  42.7  0.003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0419  DNA-directed RNA polymerase subunit alpha  25.44 
 
 		 330 aa  42.7  0.003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1110  DNA-directed RNA polymerase subunit alpha  24.79 
 
 		 328 aa  42.7  0.004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000205308  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04496  DNA-directed RNA polymerase subunit alpha  24.22 
 
 		 332 aa  41.6  0.008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1366  DNA-directed RNA polymerase subunit alpha  23.67 
 
 		 336 aa  41.6  0.008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00249264  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1320  DNA-directed RNA polymerase subunit alpha  23.67 
 
 		 336 aa  41.6  0.008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000100462  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5046  DNA-directed RNA polymerase subunit alpha  21.43 
 
 		 343 aa  41.6  0.008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0408631  normal  0.958591 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1010  DNA-directed RNA polymerase subunit alpha  23.11 
 
 		 336 aa  41.2  0.01  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.21505 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0319  DNA-directed RNA polymerase subunit alpha  23.78 
 
 		 329 aa  41.2  0.01  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>