40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_1819 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_1819  RNA polymerase insert  100 
 
 		 250 aa  489  1e-137  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2592  RNA polymerase insert  70.38 
 
 		 259 aa  358  4e-98  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.906586  normal  0.218784 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0423  RNA polymerase insert  68.98 
 
 		 249 aa  335  5e-91  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2551  RNA polymerase insert  70.13 
 
 		 249 aa  316  3e-85  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2521  RNA polymerase insert  62.6 
 
 		 247 aa  309  2.9999999999999997e-83  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.088721  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0039  DNA-directed RNA polymerase subunit D  38.64 
 
 		 267 aa  179  4e-44  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0075  DNA-directed RNA polymerase subunit D  37.69 
 
 		 266 aa  166  2e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1621  RNA polymerase, insert  38.58 
 
 		 264 aa  162  4.0000000000000004e-39  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1803  DNA-directed RNA polymerase subunit D  37.22 
 
 		 276 aa  160  2e-38  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0972243  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2222  DNA-directed RNA polymerase subunit D  34.93 
 
 		 276 aa  156  3e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1244  DNA-directed RNA polymerase subunit D  34.78 
 
 		 275 aa  144  1e-33  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00140782  normal  0.836144 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2385  DNA-directed RNA polymerase subunit D  31.37 
 
 		 273 aa  138  6e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0325899  normal  0.710013 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1399  RNA polymerase insert  34.46 
 
 		 273 aa  124  2e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0633  RNA polymerase insert  43.29 
 
 		 195 aa  122  4e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1969  RNA polymerase insert  32.26 
 
 		 262 aa  118  7e-26  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00862498  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0280  RNA polymerase, insert  35.38 
 
 		 283 aa  118  7.999999999999999e-26  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0697  RNA polymerase, insert  32.55 
 
 		 262 aa  118  9.999999999999999e-26  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00773924  normal  0.0619032 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0271  DNA-directed RNA polymerase, subunit D  41.18 
 
 		 180 aa  117  9.999999999999999e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0567  RNA polymerase insert  41.18 
 
 		 180 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.555923 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1351  RNA polymerase insert  41.18 
 
 		 180 aa  116  3e-25  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.146665  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2899  DNA-directed RNA polymerase subunit D  29.96 
 
 		 272 aa  115  6e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0578788  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1098  RNA polymerase insert  40 
 
 		 197 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1052  RNA polymerase insert  29.17 
 
 		 265 aa  109  5e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.127014  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2097  DNA-directed RNA polymerase, subunit D  30.36 
 
 		 258 aa  104  2e-21  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2327  RNA polymerase, insert  31.05 
 
 		 259 aa  102  6e-21  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.000000580045  hitchhiker  0.00000634877 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2145  DNA-directed RNA polymerase, subunit D  28.46 
 
 		 262 aa  100  2e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  unclonable  0.0000000000343639  hitchhiker  0.000345758 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0428  RNA polymerase insert  35.45 
 
 		 221 aa  94.4  2e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0123472 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1166  RNA polymerase insert  28.03 
 
 		 305 aa  90.1  3e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_13566  predicted protein  28.72 
 
 		 320 aa  85.1  9e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_74652  RNA polymerase III (C) subunit  25.34 
 
 		 336 aa  81.3  0.00000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.621842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119616  DNA-directed RNA polymerase II subunit 3  26.95 
 
 		 318 aa  77  0.0000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.67705  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80709  45 kDa subunit of RNA polymerase II  27.13 
 
 		 315 aa  75.9  0.0000000000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06252  RNA polymerase II subunit 3 (AFU_orthologue; AFUA_2G13090)  31.82 
 
 		 333 aa  71.2  0.00000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.586686  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02415  DNA-directed RNA polymerase I and III subunit Rpc40, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G13720)  23.97 
 
 		 373 aa  68.6  0.00000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0361662 
 
 
-
 
NC_006686  CND03040  conserved hypothetical protein  24.2 
 
 		 350 aa  67  0.0000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.612704  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35770  predicted protein  23.96 
 
 		 360 aa  65.1  0.000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.000177628  normal  1 
 
 
-
 
NC_006687  CNE05120  RNA polymerase II subunit 3, putative  49.15 
 
 		 377 aa  62.8  0.000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_52094  predicted protein  22.78 
 
 		 319 aa  62.8  0.000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.830096  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1110  DNA-directed RNA polymerase subunit alpha  27.78 
 
 		 328 aa  43.5  0.003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000205308  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0426  DNA-directed RNA polymerase, alpha subunit  30.5 
 
 		 312 aa  42.4  0.007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>