41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_2222 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_2222  DNA-directed RNA polymerase subunit D  100 
 
 		 276 aa  563  1e-160  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1803  DNA-directed RNA polymerase subunit D  62.64 
 
 		 276 aa  366  1e-100  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0972243  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2385  DNA-directed RNA polymerase subunit D  61.99 
 
 		 273 aa  361  8e-99  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0325899  normal  0.710013 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1244  DNA-directed RNA polymerase subunit D  63.67 
 
 		 275 aa  357  9e-98  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00140782  normal  0.836144 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2899  DNA-directed RNA polymerase subunit D  59.19 
 
 		 272 aa  333  1e-90  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0578788  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0075  DNA-directed RNA polymerase subunit D  48.86 
 
 		 266 aa  251  1e-65  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0039  DNA-directed RNA polymerase subunit D  44.53 
 
 		 267 aa  248  5e-65  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1621  RNA polymerase, insert  45.42 
 
 		 264 aa  232  4.0000000000000004e-60  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2592  RNA polymerase insert  33.59 
 
 		 259 aa  158  7e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.906586  normal  0.218784 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1819  RNA polymerase insert  34.93 
 
 		 250 aa  156  3e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1052  RNA polymerase insert  35.27 
 
 		 265 aa  154  2e-36  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.127014  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1399  RNA polymerase insert  35.34 
 
 		 273 aa  147  1.0000000000000001e-34  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0280  RNA polymerase, insert  38.04 
 
 		 283 aa  146  3e-34  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1166  RNA polymerase insert  34.12 
 
 		 305 aa  145  5e-34  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0423  RNA polymerase insert  32.83 
 
 		 249 aa  145  6e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1969  RNA polymerase insert  36.29 
 
 		 262 aa  144  2e-33  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00862498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2145  DNA-directed RNA polymerase, subunit D  33.33 
 
 		 262 aa  144  2e-33  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  unclonable  0.0000000000343639  hitchhiker  0.000345758 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0697  RNA polymerase, insert  35.5 
 
 		 262 aa  140  3e-32  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00773924  normal  0.0619032 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2551  RNA polymerase insert  32.93 
 
 		 249 aa  134  1.9999999999999998e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2521  RNA polymerase insert  32.05 
 
 		 247 aa  132  6e-30  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.088721  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2097  DNA-directed RNA polymerase, subunit D  36.08 
 
 		 258 aa  132  9e-30  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_13566  predicted protein  29.55 
 
 		 320 aa  125  6e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0633  RNA polymerase insert  41.99 
 
 		 195 aa  123  3e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0567  RNA polymerase insert  48.12 
 
 		 180 aa  122  7e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.555923 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2327  RNA polymerase, insert  36.36 
 
 		 259 aa  121  9.999999999999999e-27  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.000000580045  hitchhiker  0.00000634877 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0271  DNA-directed RNA polymerase, subunit D  46.62 
 
 		 180 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1351  RNA polymerase insert  46.62 
 
 		 180 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.146665  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1098  RNA polymerase insert  42.86 
 
 		 197 aa  112  5e-24  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0428  RNA polymerase insert  38.96 
 
 		 221 aa  112  9e-24  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0123472 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35770  predicted protein  31.23 
 
 		 360 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.000177628  normal  1 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119616  DNA-directed RNA polymerase II subunit 3  36.02 
 
 		 318 aa  95.9  6e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.67705  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_74652  RNA polymerase III (C) subunit  27.7 
 
 		 336 aa  93.6  3e-18  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.621842  normal  1 
 
 
-
 
NC_006687  CNE05120  RNA polymerase II subunit 3, putative  27.46 
 
 		 377 aa  90.5  3e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80709  45 kDa subunit of RNA polymerase II  29.09 
 
 		 315 aa  89  8e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_52094  predicted protein  26.32 
 
 		 319 aa  85.1  0.000000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.830096  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06252  RNA polymerase II subunit 3 (AFU_orthologue; AFUA_2G13090)  35.76 
 
 		 333 aa  84.3  0.000000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.586686  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02415  DNA-directed RNA polymerase I and III subunit Rpc40, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G13720)  24.31 
 
 		 373 aa  84  0.000000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0361662 
 
 
-
 
NC_006686  CND03040  conserved hypothetical protein  27.59 
 
 		 350 aa  82.8  0.000000000000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.612704  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1431  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  30.77 
 
 		 264 aa  45.8  0.0007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1586  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  40.74 
 
 		 65 aa  45.1  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1373  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  29.49 
 
 		 399 aa  43.5  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.255821  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>