40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_0423 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013922  Nmag_0423  RNA polymerase insert  100 
 
 		 249 aa  494  1e-139  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2551  RNA polymerase insert  89.96 
 
 		 249 aa  417  1e-116  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2592  RNA polymerase insert  70.38 
 
 		 259 aa  353  1e-96  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.906586  normal  0.218784 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2521  RNA polymerase insert  68.42 
 
 		 247 aa  337  9.999999999999999e-92  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.088721  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1819  RNA polymerase insert  68.98 
 
 		 250 aa  335  5e-91  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0039  DNA-directed RNA polymerase subunit D  39.63 
 
 		 267 aa  181  1e-44  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0075  DNA-directed RNA polymerase subunit D  38.91 
 
 		 266 aa  178  5.999999999999999e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1244  DNA-directed RNA polymerase subunit D  35.06 
 
 		 275 aa  148  6e-35  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00140782  normal  0.836144 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1803  DNA-directed RNA polymerase subunit D  36.36 
 
 		 276 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0972243  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1621  RNA polymerase, insert  34.08 
 
 		 264 aa  145  4.0000000000000006e-34  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2222  DNA-directed RNA polymerase subunit D  32.83 
 
 		 276 aa  145  5e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2899  DNA-directed RNA polymerase subunit D  41.51 
 
 		 272 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0578788  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1399  RNA polymerase insert  31.27 
 
 		 273 aa  126  3e-28  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2385  DNA-directed RNA polymerase subunit D  31.39 
 
 		 273 aa  125  9e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0325899  normal  0.710013 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1098  RNA polymerase insert  48.84 
 
 		 197 aa  122  5e-27  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1969  RNA polymerase insert  33.33 
 
 		 262 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00862498  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0697  RNA polymerase, insert  32.02 
 
 		 262 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00773924  normal  0.0619032 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0567  RNA polymerase insert  46.51 
 
 		 180 aa  116  3e-25  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.555923 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0271  DNA-directed RNA polymerase, subunit D  46.51 
 
 		 180 aa  116  3.9999999999999997e-25  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0280  RNA polymerase, insert  31.5 
 
 		 283 aa  115  6e-25  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1351  RNA polymerase insert  44.96 
 
 		 180 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.146665  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0633  RNA polymerase insert  47.06 
 
 		 195 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2097  DNA-directed RNA polymerase, subunit D  31.58 
 
 		 258 aa  110  3e-23  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2327  RNA polymerase, insert  35.68 
 
 		 259 aa  108  1e-22  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.000000580045  hitchhiker  0.00000634877 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1166  RNA polymerase insert  29.2 
 
 		 305 aa  100  3e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_13566  predicted protein  28.08 
 
 		 320 aa  99.8  4e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1052  RNA polymerase insert  29.72 
 
 		 265 aa  98.6  9e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.127014  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0428  RNA polymerase insert  34.18 
 
 		 221 aa  93.6  2e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0123472 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2145  DNA-directed RNA polymerase, subunit D  26.97 
 
 		 262 aa  86.7  3e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  unclonable  0.0000000000343639  hitchhiker  0.000345758 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119616  DNA-directed RNA polymerase II subunit 3  37.33 
 
 		 318 aa  82.4  0.000000000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.67705  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_74652  RNA polymerase III (C) subunit  27.36 
 
 		 336 aa  81.6  0.00000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.621842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80709  45 kDa subunit of RNA polymerase II  28.67 
 
 		 315 aa  74.7  0.000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND03040  conserved hypothetical protein  27.6 
 
 		 350 aa  73.6  0.000000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.612704  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06252  RNA polymerase II subunit 3 (AFU_orthologue; AFUA_2G13090)  33.95 
 
 		 333 aa  72.8  0.000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.586686  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02415  DNA-directed RNA polymerase I and III subunit Rpc40, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G13720)  24.53 
 
 		 373 aa  71.6  0.00000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0361662 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35770  predicted protein  29 
 
 		 360 aa  70.5  0.00000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.000177628  normal  1 
 
 
-
 
NC_006687  CNE05120  RNA polymerase II subunit 3, putative  51.67 
 
 		 377 aa  68.9  0.00000000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_52094  predicted protein  25.26 
 
 		 319 aa  62.4  0.000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.830096  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0426  DNA-directed RNA polymerase, alpha subunit  24.24 
 
 		 312 aa  45.1  0.001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0221  DNA-directed RNA polymerase subunit alpha  27.52 
 
 		 314 aa  42  0.008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>