65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_1244 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008942  Mlab_1244  DNA-directed RNA polymerase subunit D  100 
 
 		 275 aa  564  1e-160  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00140782  normal  0.836144 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2222  DNA-directed RNA polymerase subunit D  63.67 
 
 		 276 aa  357  9e-98  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1803  DNA-directed RNA polymerase subunit D  61.9 
 
 		 276 aa  350  2e-95  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0972243  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2385  DNA-directed RNA polymerase subunit D  60.07 
 
 		 273 aa  341  7e-93  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0325899  normal  0.710013 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2899  DNA-directed RNA polymerase subunit D  57.14 
 
 		 272 aa  317  9e-86  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0578788  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0039  DNA-directed RNA polymerase subunit D  46.49 
 
 		 267 aa  255  5e-67  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0075  DNA-directed RNA polymerase subunit D  46.72 
 
 		 266 aa  240  1e-62  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1621  RNA polymerase, insert  45.05 
 
 		 264 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1399  RNA polymerase insert  37.67 
 
 		 273 aa  163  3e-39  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0697  RNA polymerase, insert  38.31 
 
 		 262 aa  160  1e-38  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00773924  normal  0.0619032 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1969  RNA polymerase insert  36.68 
 
 		 262 aa  154  1e-36  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00862498  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2592  RNA polymerase insert  33.96 
 
 		 259 aa  152  4e-36  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.906586  normal  0.218784 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0280  RNA polymerase, insert  36 
 
 		 283 aa  149  4e-35  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0423  RNA polymerase insert  35.06 
 
 		 249 aa  148  7e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2551  RNA polymerase insert  36.33 
 
 		 249 aa  147  2.0000000000000003e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1819  RNA polymerase insert  34.78 
 
 		 250 aa  144  2e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2521  RNA polymerase insert  32.47 
 
 		 247 aa  143  2e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.088721  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_13566  predicted protein  31.79 
 
 		 320 aa  139  3.9999999999999997e-32  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1052  RNA polymerase insert  35.56 
 
 		 265 aa  138  7.999999999999999e-32  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.127014  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2097  DNA-directed RNA polymerase, subunit D  35.5 
 
 		 258 aa  135  5e-31  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2145  DNA-directed RNA polymerase, subunit D  35.8 
 
 		 262 aa  132  7.999999999999999e-30  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  unclonable  0.0000000000343639  hitchhiker  0.000345758 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1166  RNA polymerase insert  31.25 
 
 		 305 aa  130  3e-29  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0567  RNA polymerase insert  47.65 
 
 		 180 aa  120  3e-26  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.555923 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0428  RNA polymerase insert  41.83 
 
 		 221 aa  118  7.999999999999999e-26  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0123472 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0271  DNA-directed RNA polymerase, subunit D  46.47 
 
 		 180 aa  118  9e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2327  RNA polymerase, insert  34.24 
 
 		 259 aa  118  9.999999999999999e-26  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.000000580045  hitchhiker  0.00000634877 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1351  RNA polymerase insert  46.47 
 
 		 180 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.146665  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0633  RNA polymerase insert  46.02 
 
 		 195 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1098  RNA polymerase insert  46.43 
 
 		 197 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119616  DNA-directed RNA polymerase II subunit 3  30.64 
 
 		 318 aa  110  3e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.67705  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35770  predicted protein  29.02 
 
 		 360 aa  107  2e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.000177628  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND03040  conserved hypothetical protein  29.32 
 
 		 350 aa  102  7e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.612704  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80709  45 kDa subunit of RNA polymerase II  28.2 
 
 		 315 aa  89  8e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06252  RNA polymerase II subunit 3 (AFU_orthologue; AFUA_2G13090)  27.47 
 
 		 333 aa  85.5  8e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.586686  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_74652  RNA polymerase III (C) subunit  29.29 
 
 		 336 aa  84.3  0.000000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.621842  normal  1 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_52094  predicted protein  27.68 
 
 		 319 aa  83.6  0.000000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.830096  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE05120  RNA polymerase II subunit 3, putative  25 
 
 		 377 aa  80.9  0.00000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02415  DNA-directed RNA polymerase I and III subunit Rpc40, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G13720)  27.76 
 
 		 373 aa  80.5  0.00000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0361662 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0426  DNA-directed RNA polymerase, alpha subunit  30.71 
 
 		 312 aa  47.8  0.0002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0018  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  40 
 
 		 93 aa  45.4  0.0009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0689181  normal  0.439492 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1217  DNA-directed RNA polymerase subunit alpha  27.11 
 
 		 345 aa  45.4  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0300236 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0618  hypothetical protein  27.68 
 
 		 255 aa  45.4  0.001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3484  photosystem I subunit VII  44.44 
 
 		 81 aa  45.1  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.882203  normal  0.40097 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3425  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  39.13 
 
 		 82 aa  44.3  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.121057  hitchhiker  0.00916142 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1184  photosystem I subunit VII  42.59 
 
 		 81 aa  44.3  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  hitchhiker  0.00269057  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0171  photosystem I subunit VII  42.59 
 
 		 99 aa  44.7  0.002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0127  photosystem I subunit VII  42.59 
 
 		 91 aa  44.3  0.002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.409793  hitchhiker  0.00279555 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1307  photosystem I subunit VII  42.59 
 
 		 81 aa  44.3  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1700  photosystem I subunit VII  42.59 
 
 		 81 aa  44.3  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4065  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  27.06 
 
 		 713 aa  44.7  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.929518  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0535  photosystem I subunit VII  42.59 
 
 		 81 aa  44.3  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.966086  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1741  photosystem I subunit VII  41.82 
 
 		 81 aa  44.3  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.518947 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4980  photosystem I subunit VII  42.59 
 
 		 81 aa  44.3  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.688925 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1278  photosystem I subunit VII  42.59 
 
 		 81 aa  44.3  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20591  photosystem I subunit VII  42.59 
 
 		 81 aa  44.3  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.594482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17321  photosystem I subunit VII  42.59 
 
 		 81 aa  44.3  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0454  photosystem I subunit VII  42.59 
 
 		 81 aa  43.5  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.11246  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18171  photosystem I subunit VII  42.59 
 
 		 81 aa  43.9  0.003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.102176  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17951  photosystem I subunit VII  42.59 
 
 		 81 aa  43.9  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.028019  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18001  photosystem I subunit VII  42.59 
 
 		 81 aa  43.9  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1530  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  32.86 
 
 		 80 aa  43.1  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26051  photosystem I subunit VII  42.59 
 
 		 81 aa  43.1  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5219  photosystem I iron-sulfur protein PsaC  40.74 
 
 		 81 aa  43.1  0.005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3544  glycyl-radical enzyme activating protein family  33.33 
 
 		 316 aa  42.4  0.009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0613  DNA-directed RNA polymerase subunit alpha  24.85 
 
 		 334 aa  42.4  0.009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>