38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_119616 on replicon NC_009356
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009356  OSTLU_119616  DNA-directed RNA polymerase II subunit 3  100 
 
 		 318 aa  650    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.67705  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06252  RNA polymerase II subunit 3 (AFU_orthologue; AFUA_2G13090)  35.86 
 
 		 333 aa  155  1e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.586686  normal  1 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_13566  predicted protein  33.02 
 
 		 320 aa  148  1.0000000000000001e-34  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80709  45 kDa subunit of RNA polymerase II  33.44 
 
 		 315 aa  146  4.0000000000000006e-34  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND03040  conserved hypothetical protein  34.7 
 
 		 350 aa  133  3.9999999999999996e-30  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.612704  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35770  predicted protein  28.4 
 
 		 360 aa  132  9e-30  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.000177628  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_74652  RNA polymerase III (C) subunit  31.21 
 
 		 336 aa  120  4.9999999999999996e-26  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.621842  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02415  DNA-directed RNA polymerase I and III subunit Rpc40, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G13720)  32.15 
 
 		 373 aa  117  1.9999999999999998e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0361662 
 
 
-
 
NC_006687  CNE05120  RNA polymerase II subunit 3, putative  32.62 
 
 		 377 aa  114  3e-24  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0280  RNA polymerase, insert  31.25 
 
 		 283 aa  113  5e-24  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_52094  predicted protein  30.25 
 
 		 319 aa  111  2.0000000000000002e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.830096  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1244  DNA-directed RNA polymerase subunit D  30.64 
 
 		 275 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00140782  normal  0.836144 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1166  RNA polymerase insert  30.43 
 
 		 305 aa  108  1e-22  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0428  RNA polymerase insert  37.99 
 
 		 221 aa  102  1e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0123472 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1803  DNA-directed RNA polymerase subunit D  36.46 
 
 		 276 aa  99  1e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0972243  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2145  DNA-directed RNA polymerase, subunit D  28.32 
 
 		 262 aa  97.8  2e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  unclonable  0.0000000000343639  hitchhiker  0.000345758 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2222  DNA-directed RNA polymerase subunit D  36.02 
 
 		 276 aa  95.9  7e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1052  RNA polymerase insert  28.12 
 
 		 265 aa  95.5  1e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.127014  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0075  DNA-directed RNA polymerase subunit D  36.96 
 
 		 266 aa  94.7  2e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0039  DNA-directed RNA polymerase subunit D  28.23 
 
 		 267 aa  93.2  6e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0697  RNA polymerase, insert  37.5 
 
 		 262 aa  91.3  2e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00773924  normal  0.0619032 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2899  DNA-directed RNA polymerase subunit D  33.33 
 
 		 272 aa  88.6  1e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0578788  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2592  RNA polymerase insert  28.57 
 
 		 259 aa  88.2  2e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.906586  normal  0.218784 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1969  RNA polymerase insert  35.93 
 
 		 262 aa  85.5  0.000000000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00862498  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2551  RNA polymerase insert  28.72 
 
 		 249 aa  84.3  0.000000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1098  RNA polymerase insert  35.67 
 
 		 197 aa  84.3  0.000000000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2385  DNA-directed RNA polymerase subunit D  31.87 
 
 		 273 aa  83.6  0.000000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0325899  normal  0.710013 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0423  RNA polymerase insert  37.33 
 
 		 249 aa  82.4  0.000000000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2327  RNA polymerase, insert  39.64 
 
 		 259 aa  80.9  0.00000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.000000580045  hitchhiker  0.00000634877 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1399  RNA polymerase insert  33.33 
 
 		 273 aa  80.1  0.00000000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2521  RNA polymerase insert  38 
 
 		 247 aa  78.6  0.0000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.088721  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0567  RNA polymerase insert  37.25 
 
 		 180 aa  77  0.0000000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.555923 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1819  RNA polymerase insert  26.95 
 
 		 250 aa  77  0.0000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1351  RNA polymerase insert  36.6 
 
 		 180 aa  75.9  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.146665  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0271  DNA-directed RNA polymerase, subunit D  35.95 
 
 		 180 aa  75.5  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1621  RNA polymerase, insert  30.94 
 
 		 264 aa  75.1  0.000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0633  RNA polymerase insert  36.94 
 
 		 195 aa  73.9  0.000000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2097  DNA-directed RNA polymerase, subunit D  28.37 
 
 		 258 aa  73.2  0.000000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>