75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_1585 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014150  Bmur_1585  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  100 
 
 
315 aa  647    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2968  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  30.98 
 
 
259 aa  77  0.0000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1903  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  23.64 
 
 
265 aa  71.2  0.00000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1529  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  23.79 
 
 
282 aa  68.6  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3647  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  20.24 
 
 
268 aa  67.8  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1431  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  24.51 
 
 
264 aa  61.6  0.00000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0344  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  25.95 
 
 
267 aa  60.8  0.00000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0985  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  24.24 
 
 
356 aa  60.5  0.00000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0278  hypothetical protein  22.58 
 
 
268 aa  59.7  0.00000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0309  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  25.73 
 
 
260 aa  59.3  0.00000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1074  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  23.79 
 
 
266 aa  57.4  0.0000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.190031  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1073  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  23.79 
 
 
263 aa  57  0.0000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.112396  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2197  putative iron-sulfur protein  25.19 
 
 
268 aa  56.6  0.0000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1102  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  24.8 
 
 
260 aa  56.2  0.0000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0260  iron-sulfur cluster-binding protein  24.63 
 
 
303 aa  55.8  0.0000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0472  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  21.46 
 
 
257 aa  53.5  0.000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.448706 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2351  iron-sulfur cluster-binding protein  26.32 
 
 
259 aa  53.1  0.000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00218964  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2063  polyferredoxin, putative  24.7 
 
 
259 aa  51.6  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1294  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  24.8 
 
 
261 aa  49.3  0.0001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2933  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  33.33 
 
 
505 aa  48.9  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1070  ferredoxin  32.47 
 
 
417 aa  47.4  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000699309  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0067  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  23.33 
 
 
253 aa  47.4  0.0003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.947437  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1835  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  23.33 
 
 
253 aa  47.4  0.0003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0885  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  35 
 
 
267 aa  47.4  0.0003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0213138 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1899  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  22.98 
 
 
254 aa  47  0.0004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06320  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 51 kDa subunit  39.58 
 
 
594 aa  46.6  0.0006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000903471  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1389  hypothetical protein  29.89 
 
 
111 aa  46.2  0.0008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0934  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  41.38 
 
 
695 aa  45.8  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1613  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  29.76 
 
 
531 aa  45.1  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05370  4Fe-4S protein  33.85 
 
 
313 aa  45.8  0.001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.716357  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3084  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  33.87 
 
 
133 aa  44.7  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0358039 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0736  ferredoxin  45.45 
 
 
59 aa  44.7  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1441  ferredoxin family protein  30.16 
 
 
94 aa  44.7  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0722291  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0380  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  42 
 
 
71 aa  44.7  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1327  hypothetical protein  36.92 
 
 
667 aa  44.7  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0697  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  40 
 
 
196 aa  44.7  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0262  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  26.04 
 
 
147 aa  44.3  0.003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0832222 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2172  cyclic nucleotide-binding protein  41.07 
 
 
565 aa  43.9  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.653365  hitchhiker  0.000000233561 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1538  benzoyl-CoA oxygenase/reductase, BoxA protein  29.87 
 
 
416 aa  43.9  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0510  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  41.07 
 
 
559 aa  43.9  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0098001  normal  0.0322264 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2146  iron-sulfur cluster-binding protein  29.63 
 
 
146 aa  43.5  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.471732  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0072  benzoyl-CoA oxygenase/reductase, BoxA protein  33.87 
 
 
439 aa  43.9  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.860838  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1630  benzoyl-CoA oxygenase, component A  33.33 
 
 
426 aa  43.9  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.170592  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1792  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  30.86 
 
 
565 aa  43.9  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0346302 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3689  cyclic nucleotide-binding protein  28.57 
 
 
454 aa  43.9  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.120597  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1740  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  42 
 
 
281 aa  43.9  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00299505  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1227  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  40.38 
 
 
228 aa  43.1  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5270  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  32.81 
 
 
670 aa  43.5  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.170376  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0551  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  32.2 
 
 
425 aa  43.5  0.005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0919  NADH dehydrogenase (quinone)  37.04 
 
 
596 aa  43.5  0.005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2551  molybdopterin oxidoreductase, iron-sulfur binding subunit  28.35 
 
 
920 aa  43.5  0.005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0967  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  26.5 
 
 
395 aa  43.5  0.005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0804  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  28.8 
 
 
136 aa  43.5  0.005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0305  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  31.75 
 
 
404 aa  43.1  0.005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1450  putative ferredoxin  30.61 
 
 
558 aa  43.5  0.005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0579  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  40.43 
 
 
62 aa  43.1  0.006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2077  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  32.31 
 
 
368 aa  43.1  0.006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.917974 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3661  benzoyl-CoA oxygenase/reductase, BoxA protein  31.88 
 
 
431 aa  43.1  0.006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0207  glycyl-radical activating family protein  35.85 
 
 
306 aa  43.1  0.006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1487  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  26.45 
 
 
324 aa  43.1  0.006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00133534  hitchhiker  0.0000000109439 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3615  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  34.62 
 
 
211 aa  43.1  0.006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1936  Electron transfer flavoprotein alpha/beta- subunit  31.25 
 
 
441 aa  43.1  0.006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.993938  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2270  cyclic nucleotide-binding protein  31.34 
 
 
477 aa  43.1  0.007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00166052 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1281  hypothetical protein  36.17 
 
 
455 aa  43.1  0.007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1323  benzoyl-CoA oxygenase, component A  33.33 
 
 
417 aa  43.1  0.007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2505  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  21.24 
 
 
264 aa  42.7  0.007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1736  ferredoxin, 2(4Fe-4S)  32.69 
 
 
56 aa  42.7  0.008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.868501  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14300  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  44.68 
 
 
331 aa  42.4  0.009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  4.06573e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3830  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  31.82 
 
 
677 aa  42.4  0.009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1241  ferredoxin family protein  28.79 
 
 
96 aa  42.4  0.009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.251684  normal  0.0451259 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0222  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  33.87 
 
 
423 aa  42.7  0.009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2058  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  36 
 
 
67 aa  42.7  0.009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0734  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  33.82 
 
 
424 aa  42.4  0.01  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.197929  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0132  ferredoxin  41.67 
 
 
58 aa  42.4  0.01  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.862186 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5001  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  38 
 
 
98 aa  42.4  0.01  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000620576  normal  0.363374 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>