50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_0344 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009712  Mboo_0344  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  100 
 
 
267 aa  552  1e-156  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1074  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  55.64 
 
 
266 aa  297  1e-79  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.190031  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1073  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  53.82 
 
 
263 aa  281  7.000000000000001e-75  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.112396  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1903  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  51.89 
 
 
265 aa  280  2e-74  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0278  hypothetical protein  41.04 
 
 
268 aa  184  9e-46  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1294  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  35.14 
 
 
261 aa  159  6e-38  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1529  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  35.74 
 
 
282 aa  152  4e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3647  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  33.46 
 
 
268 aa  147  1.0000000000000001e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2197  putative iron-sulfur protein  29.96 
 
 
268 aa  137  3.0000000000000003e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0309  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  32.08 
 
 
260 aa  131  1.0000000000000001e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0472  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  33.21 
 
 
257 aa  129  5.0000000000000004e-29  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.448706 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2505  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  33.46 
 
 
264 aa  122  9e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2351  iron-sulfur cluster-binding protein  27.55 
 
 
259 aa  119  7e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00218964  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2063  polyferredoxin, putative  27.55 
 
 
259 aa  118  9e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1102  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  30.6 
 
 
260 aa  116  3e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0067  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  30.57 
 
 
253 aa  116  3.9999999999999997e-25  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.947437  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1835  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  30.57 
 
 
253 aa  116  3.9999999999999997e-25  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0618  hypothetical protein  29.52 
 
 
255 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1899  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  27.24 
 
 
254 aa  107  2e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1431  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  28.52 
 
 
264 aa  94  2e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1263  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  41.18 
 
 
117 aa  91.7  1e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0285894  normal  0.165921 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1264  hypothetical protein  43.38 
 
 
162 aa  90.1  3e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0238367  normal  0.165921 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1283  hypothetical protein  55.88 
 
 
75 aa  85.9  7e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.260163  normal  0.350827 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05370  4Fe-4S protein  29.21 
 
 
313 aa  82  0.000000000000009  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.716357  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0985  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  27.1 
 
 
356 aa  71.2  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1585  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  25.95 
 
 
315 aa  60.8  0.00000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2803  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  27.49 
 
 
265 aa  55.8  0.0000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2968  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  23.31 
 
 
259 aa  55.5  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1740  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  25.45 
 
 
281 aa  50.8  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00299505  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3023  putative ferredoxin  24.08 
 
 
269 aa  50.1  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2905  putative flavodoxin  22.92 
 
 
258 aa  48.9  0.00009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0260  iron-sulfur cluster-binding protein  22.1 
 
 
303 aa  48.5  0.0001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3130  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  50 
 
 
261 aa  48.5  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0532  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  45.65 
 
 
55 aa  48.5  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000183692  normal  0.0950225 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0526  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  26.74 
 
 
260 aa  47.8  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.521957 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2115  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  29.26 
 
 
263 aa  46.6  0.0004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.267923  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0471  NADH dehydrogenase (quinone)  50 
 
 
620 aa  46.2  0.0005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00000177124  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1327  hypothetical protein  34.94 
 
 
667 aa  43.9  0.003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1276  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  34.48 
 
 
264 aa  43.9  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1618  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  46.51 
 
 
272 aa  43.9  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000243314  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1484  electron transfer flavoprotein alpha subunit  28.81 
 
 
397 aa  43.9  0.003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.11518  normal  0.562863 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1070  ferredoxin  40 
 
 
417 aa  43.1  0.005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000699309  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0560  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.21 
 
 
589 aa  43.1  0.005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1083  NADH dehydrogenase subunit I  35.85 
 
 
156 aa  42.7  0.006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3830  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  39.29 
 
 
677 aa  42.7  0.006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0441  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.49 
 
 
285 aa  42.7  0.006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.278106  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17130  4Fe-4S protein  44.68 
 
 
516 aa  42.7  0.007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.29858  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2837  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  25.1 
 
 
267 aa  42.4  0.007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3941  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  38.81 
 
 
315 aa  42  0.01  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000105876  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0796  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  36.36 
 
 
368 aa  42  0.01  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.18226  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>