79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_1899 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_1899  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  100 
 
 		 254 aa  521  1e-147  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1102  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  34.11 
 
 		 260 aa  156  2e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0067  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  33.33 
 
 		 253 aa  120  3e-26  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.947437  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1835  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  33.33 
 
 		 253 aa  120  3e-26  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1529  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  30.35 
 
 		 282 aa  119  3.9999999999999996e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0278  hypothetical protein  29.28 
 
 		 268 aa  117  3e-25  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3647  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  27.78 
 
 		 268 aa  115  5e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2197  putative iron-sulfur protein  28.35 
 
 		 268 aa  114  2.0000000000000002e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0344  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  27.24 
 
 		 267 aa  107  2e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1903  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  28.46 
 
 		 265 aa  106  4e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1294  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  28.94 
 
 		 261 aa  106  4e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0309  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  30.8 
 
 		 260 aa  105  8e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1073  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  27.06 
 
 		 263 aa  104  1e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.112396  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0618  hypothetical protein  27.69 
 
 		 255 aa  103  2e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2351  iron-sulfur cluster-binding protein  28.35 
 
 		 259 aa  103  3e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00218964  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2063  polyferredoxin, putative  28.35 
 
 		 259 aa  103  3e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2505  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  26.72 
 
 		 264 aa  100  3e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1074  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  26.44 
 
 		 266 aa  94  2e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.190031  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05370  4Fe-4S protein  27.1 
 
 		 313 aa  89  7e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.716357  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0472  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  27.87 
 
 		 257 aa  87.8  1e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.448706 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1431  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  24.9 
 
 		 264 aa  79  0.00000000000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1263  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  40 
 
 		 117 aa  75.9  0.0000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0285894  normal  0.165921 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2968  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  27.76 
 
 		 259 aa  68.6  0.00000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0526  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  22.18 
 
 		 260 aa  63.9  0.000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.521957 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2803  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  25.21 
 
 		 265 aa  60.8  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1740  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  25.69 
 
 		 281 aa  60.5  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00299505  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3130  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  24.74 
 
 		 261 aa  59.7  0.00000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0985  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  25.48 
 
 		 356 aa  56.6  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0415  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  26.53 
 
 		 256 aa  55.1  0.000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2228  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  23.86 
 
 		 272 aa  54.3  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0174624  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3023  putative ferredoxin  22.55 
 
 		 269 aa  52  0.000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3762  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  22.95 
 
 		 276 aa  50.4  0.00003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1508  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  23.87 
 
 		 266 aa  50.4  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.620723  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1221  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  25.4 
 
 		 275 aa  50.4  0.00003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2905  putative flavodoxin  21.54 
 
 		 258 aa  48.9  0.00007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1618  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  20.99 
 
 		 272 aa  48.5  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000243314  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0796  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  42.86 
 
 		 368 aa  47.4  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.18226  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2837  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  21.94 
 
 		 267 aa  47.8  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1058  ferredoxin-type protein, NapH/MauN family  37.04 
 
 		 272 aa  47.4  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1879  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  41.67 
 
 		 410 aa  47.8  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.281207  normal  0.354147 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0270  radical SAM domain-containing protein  40.85 
 
 		 292 aa  47.8  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000473608 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1585  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  22.98 
 
 		 315 aa  47  0.0003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1033  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  44.9 
 
 		 74 aa  47.4  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  1.1303200000000001e-18  hitchhiker  0.00000903571 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0310  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  21.31 
 
 		 255 aa  46.6  0.0004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0053324  hitchhiker  0.000000742335 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1318  NADH dehydrogenase (quinone)  46.94 
 
 		 626 aa  46.2  0.0004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1426  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  36.36 
 
 		 228 aa  46.6  0.0004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  0.00000000192957  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3944  radical SAM domain-containing protein  42.42 
 
 		 292 aa  46.6  0.0004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1368  NADH dehydrogenase (quinone)  46.94 
 
 		 626 aa  46.2  0.0005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2229  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  44.9 
 
 		 56 aa  45.8  0.0007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000195937  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2708  ferredoxin family protein  42.86 
 
 		 56 aa  45.4  0.0009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0216856  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0069  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  38.81 
 
 		 397 aa  45.4  0.001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.416863  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1929  hypothetical protein  46.34 
 
 		 633 aa  45.1  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.986915  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0452  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  37.78 
 
 		 347 aa  45.1  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000191107  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2056  hydrogenase, Fe-only  35.71 
 
 		 644 aa  45.4  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000410653  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1484  electron transfer flavoprotein alpha subunit  41.67 
 
 		 397 aa  44.7  0.001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.11518  normal  0.562863 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2278  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  40.82 
 
 		 55 aa  43.9  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000124494  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0810  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  43.9 
 
 		 356 aa  43.9  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.232624  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0806  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  43.9 
 
 		 358 aa  43.9  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0103679  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1945  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  40.82 
 
 		 55 aa  43.9  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1753  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  42.86 
 
 		 55 aa  43.9  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000316895  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0759  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  43.9 
 
 		 356 aa  43.5  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.939096  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2544  putative ferredoxin  40 
 
 		 59 aa  43.5  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  7.88743e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3425  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  41.67 
 
 		 82 aa  43.1  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.121057  hitchhiker  0.00916142 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2233  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  32.5 
 
 		 597 aa  43.1  0.004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2635  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  39.06 
 
 		 392 aa  43.1  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000007278  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3830  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  31.51 
 
 		 677 aa  43.1  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1070  ferredoxin  33.96 
 
 		 417 aa  43.1  0.004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000699309  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2115  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  22.03 
 
 		 263 aa  42.7  0.005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.267923  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2139  NADH dehydrogenase (quinone)  43.4 
 
 		 596 aa  43.1  0.005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.306565  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3505  NADH dehydrogenase (quinone)  43.75 
 
 		 619 aa  42.7  0.005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.960223  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1298  NADH dehydrogenase (quinone)  43.75 
 
 		 598 aa  42.4  0.007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1264  hypothetical protein  27.05 
 
 		 162 aa  42.4  0.007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0238367  normal  0.165921 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0500  ferredoxin-nitroreductase protein  35.29 
 
 		 277 aa  42.4  0.008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0559  hypothetical protein  43.9 
 
 		 634 aa  42.4  0.008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1326  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit domain protein  25 
 
 		 498 aa  42  0.009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.137293  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1781  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  43.1 
 
 		 317 aa  42  0.009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000125629  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0441  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  34.78 
 
 		 848 aa  42  0.009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1188  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  40.82 
 
 		 108 aa  42  0.01  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.66609 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1576  methyl-viologen-reducing hydrogenase, delta subunit  36.54 
 
 		 791 aa  42  0.01  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>