64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_1508 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_1508  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  100 
 
 		 266 aa  544  1e-154  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.620723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0626  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  61.65 
 
 		 266 aa  337  9.999999999999999e-92  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1276  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  52.06 
 
 		 264 aa  259  5.0000000000000005e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2803  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  46.44 
 
 		 265 aa  248  1e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2905  putative flavodoxin  45.45 
 
 		 258 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2115  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  45.28 
 
 		 263 aa  232  6e-60  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.267923  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2837  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  47.15 
 
 		 267 aa  226  3e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1140  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  46.39 
 
 		 271 aa  221  9.999999999999999e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.439364  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3023  putative ferredoxin  41.35 
 
 		 269 aa  199  3e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1618  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  40.81 
 
 		 272 aa  183  2.0000000000000003e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000243314  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2228  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  40.44 
 
 		 272 aa  183  3e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0174624  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3130  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  36.5 
 
 		 261 aa  179  5.999999999999999e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0526  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  40 
 
 		 260 aa  176  2e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.521957 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3762  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  36.33 
 
 		 276 aa  168  1e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1101  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  39.18 
 
 		 262 aa  161  1e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0310  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  35.09 
 
 		 255 aa  157  2e-37  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0053324  hitchhiker  0.000000742335 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0415  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  30.04 
 
 		 256 aa  142  6e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1221  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  32.38 
 
 		 275 aa  135  7.000000000000001e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1416  iron-sulfur cluster-binding protein  44.79 
 
 		 99 aa  89.7  4e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.584187  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1740  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  27.24 
 
 		 281 aa  53.1  0.000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00299505  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1899  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  23.87 
 
 		 254 aa  50.4  0.00003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2177  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  26.24 
 
 		 282 aa  49.7  0.00006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1176  glycyl-radical activating protein  40.91 
 
 		 306 aa  48.9  0.00008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2721  hypothetical protein  40.68 
 
 		 369 aa  48.9  0.00008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.504995  decreased coverage  0.0000694638 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0396  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  53.06 
 
 		 652 aa  48.5  0.0001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.599531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0778  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  37.88 
 
 		 618 aa  48.1  0.0001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.542223  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0839  putative PAS/PAC sensor protein  38.46 
 
 		 569 aa  47.4  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00192903 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3040  hypothetical protein  44.64 
 
 		 376 aa  46.6  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000888548  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2618  sulfite reductase, beta subunit  41.38 
 
 		 285 aa  45.8  0.0006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.433957 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0449  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  39.39 
 
 		 665 aa  46.2  0.0006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.222499  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1453  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  35.94 
 
 		 1067 aa  46.2  0.0006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.551419 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0260  iron-sulfur cluster-binding protein  23.08 
 
 		 303 aa  45.8  0.0007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5270  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  48.98 
 
 		 670 aa  45.8  0.0007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.170376  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20700  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  35.09 
 
 		 370 aa  45.4  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.921643  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0413  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  37.88 
 
 		 665 aa  45.1  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.295225  normal  0.166033 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0381  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  37.88 
 
 		 679 aa  45.1  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0020  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  37.84 
 
 		 128 aa  45.1  0.001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0115  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  32.58 
 
 		 372 aa  45.4  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.012041  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0207  glycyl-radical activating family protein  51.16 
 
 		 306 aa  45.4  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3079  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  46.94 
 
 		 670 aa  44.3  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.160134 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0911  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  31.71 
 
 		 357 aa  44.3  0.002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000589755  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0889  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  31.71 
 
 		 357 aa  43.9  0.002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000133582  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2583  pyruvate/ketoisovalerate oxidoreductase, gamma subunit  33.33 
 
 		 306 aa  44.7  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1327  hypothetical protein  27.14 
 
 		 667 aa  44.3  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1943  protein of unknown function DUF362  37.88 
 
 		 383 aa  44.3  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00286214  normal  0.07931 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1073  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  27.02 
 
 		 263 aa  43.9  0.003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.112396  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2763  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  33.93 
 
 		 198 aa  43.5  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02060  putative PAS/PAC sensor protein  32.84 
 
 		 571 aa  43.5  0.004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1805  hypothetical protein  25.82 
 
 		 388 aa  43.5  0.004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0748579  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0270  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  26.97 
 
 		 368 aa  43.1  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.241383 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1846  putative PAS/PAC sensor protein  33.33 
 
 		 572 aa  43.1  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.997362 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1109  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  27.08 
 
 		 365 aa  43.5  0.004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.195082  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0213  iron-sulfur cluster-binding domain-containing protein  28.89 
 
 		 547 aa  43.5  0.004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.462864  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1089  iron-sulfur cluster-binding protein  29.9 
 
 		 368 aa  43.1  0.005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.0040129  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1507  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  27.52 
 
 		 229 aa  42.7  0.005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000279616 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1879  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  44.19 
 
 		 410 aa  43.1  0.005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.281207  normal  0.354147 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0285  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  26.97 
 
 		 368 aa  43.1  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3195  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  36.36 
 
 		 675 aa  42.4  0.007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0284  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  40.35 
 
 		 181 aa  42.4  0.007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.419432  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0619  nitrite and sulphite reductase  31.58 
 
 		 639 aa  42.4  0.008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00799056  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1686  NADH ubiquinone oxidoreductase 20 kDa subunit  33.87 
 
 		 266 aa  42.4  0.009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1438  glycyl-radical enzyme activating protein family  44.19 
 
 		 301 aa  42.4  0.009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1217  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  42.86 
 
 		 398 aa  42  0.01  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1114  hypothetical protein  32.31 
 
 		 384 aa  42  0.01  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.54603  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>