65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_2115 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013512  Sdel_2115  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  100 
 
 
263 aa  536  1e-151  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.267923  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1508  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  45.28 
 
 
266 aa  232  6e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.620723  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0626  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  46.07 
 
 
266 aa  228  1e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1276  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  46.21 
 
 
264 aa  218  6e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2803  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  42.26 
 
 
265 aa  217  2e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2837  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  42.86 
 
 
267 aa  210  2e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2905  putative flavodoxin  44.71 
 
 
258 aa  209  5e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1140  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  42.22 
 
 
271 aa  195  7e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.439364  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3023  putative ferredoxin  40.6 
 
 
269 aa  189  4e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1618  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  38.85 
 
 
272 aa  185  6e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000243314  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2228  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  38.91 
 
 
272 aa  182  3e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0174624  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0526  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  38.7 
 
 
260 aa  181  9.000000000000001e-45  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.521957 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3762  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  35.47 
 
 
276 aa  175  6e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3130  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  37.26 
 
 
261 aa  162  5.0000000000000005e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1221  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  32.37 
 
 
275 aa  147  2.0000000000000003e-34  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0310  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  33.33 
 
 
255 aa  144  1e-33  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0053324  hitchhiker  0.000000742335 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1101  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  35.36 
 
 
262 aa  139  3.9999999999999997e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0415  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  29.66 
 
 
256 aa  132  7.999999999999999e-30  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1416  iron-sulfur cluster-binding protein  40 
 
 
99 aa  71.6  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.584187  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1740  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  26.98 
 
 
281 aa  67  0.0000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00299505  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2177  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  27.32 
 
 
282 aa  52  0.000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0472  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  23.04 
 
 
257 aa  51.6  0.00001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.448706 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2968  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  25.3 
 
 
259 aa  50.8  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0619  nitrite and sulphite reductase  34.48 
 
 
639 aa  50.4  0.00003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00799056  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0260  iron-sulfur cluster-binding protein  23.14 
 
 
303 aa  48.9  0.00008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1578  radical SAM family protein  27.45 
 
 
280 aa  47.4  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2063  polyferredoxin, putative  42.86 
 
 
259 aa  47.4  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2351  iron-sulfur cluster-binding protein  33.9 
 
 
259 aa  47.8  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00218964  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0778  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  38.46 
 
 
618 aa  47.8  0.0002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.542223  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0344  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  29.26 
 
 
267 aa  46.6  0.0004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3941  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  35.29 
 
 
315 aa  46.2  0.0006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000105876  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1294  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  24.58 
 
 
261 aa  45.4  0.0008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1438  glycyl-radical enzyme activating protein family  45 
 
 
301 aa  45.1  0.001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0456  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  36.76 
 
 
361 aa  45.4  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0020  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  48.84 
 
 
128 aa  45.1  0.001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3132  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  40.38 
 
 
298 aa  44.7  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00229195  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1385  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  47.73 
 
 
368 aa  44.3  0.002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07320  Fe-S-cluster-containing hydrogenase subunit  38.82 
 
 
192 aa  44.3  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.862775  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1188  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  41.86 
 
 
289 aa  44.7  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.445325  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2505  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  28.18 
 
 
264 aa  43.9  0.003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05370  4Fe-4S protein  43.18 
 
 
313 aa  43.9  0.003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.716357  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0990  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  43.1 
 
 
324 aa  43.1  0.004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.204655  normal  0.267306 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1074  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  33.66 
 
 
266 aa  43.1  0.004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.190031  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02100  Fe-S-cluster-containing hydrogenase subunit  41.07 
 
 
179 aa  43.1  0.005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1969  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  33.33 
 
 
299 aa  43.1  0.005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000637611  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1777  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  34.69 
 
 
369 aa  43.1  0.005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0607  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  46.94 
 
 
190 aa  42.7  0.005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.819324 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1852  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  42.86 
 
 
368 aa  42.7  0.005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.200113  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2775  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  38.89 
 
 
428 aa  43.1  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00380307  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02274  ferredoxin  25.69 
 
 
553 aa  43.1  0.005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3209  protein of unknown function DUF362  30 
 
 
375 aa  43.1  0.005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00612543  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0886  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  40.62 
 
 
373 aa  43.1  0.005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.38221  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1899  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  22.03 
 
 
254 aa  42.7  0.006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0246  hypothetical protein  40.82 
 
 
396 aa  42.7  0.006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.742639 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0121  dihydroorotate dehydrogenase family protein  30.1 
 
 
360 aa  42.7  0.006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4107  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  46.51 
 
 
290 aa  42.4  0.007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.975487  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3079  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  38.33 
 
 
670 aa  42.4  0.007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.160134 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3040  hypothetical protein  45.24 
 
 
376 aa  42.7  0.007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000888548  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3176  polysulfide reductase, subunit B  48.89 
 
 
188 aa  42.4  0.008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1096  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  32.58 
 
 
266 aa  42.4  0.008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0514529  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2441  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  35.38 
 
 
680 aa  42.4  0.008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0351  adenylylsulfate reductase, beta subunit  29.41 
 
 
160 aa  42.4  0.008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.480328  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3616  iron-sulfur cluster-binding protein  32.98 
 
 
580 aa  42  0.009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07270  NADH:ubiquinone oxidoreductase chain I-like protein  40.35 
 
 
144 aa  42  0.009  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.194831  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1073  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  45 
 
 
263 aa  42  0.01  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.112396  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>