43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_1101 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_1101  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  100 
 
 		 262 aa  536  1e-151  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0526  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  47.49 
 
 		 260 aa  244  6.999999999999999e-64  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.521957 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2228  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  39.93 
 
 		 272 aa  221  9.999999999999999e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0174624  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1618  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  40.51 
 
 		 272 aa  219  5e-56  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000243314  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3130  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  40.38 
 
 		 261 aa  207  2e-52  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1508  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  39.18 
 
 		 266 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.620723  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3023  putative ferredoxin  39.71 
 
 		 269 aa  173  2.9999999999999996e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1276  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  38.35 
 
 		 264 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0626  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  36.84 
 
 		 266 aa  163  3e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1221  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  32.47 
 
 		 275 aa  162  4.0000000000000004e-39  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3762  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  36.78 
 
 		 276 aa  160  2e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0415  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  34.63 
 
 		 256 aa  160  2e-38  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2803  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  33.71 
 
 		 265 aa  159  6e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2837  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  35.21 
 
 		 267 aa  153  2.9999999999999998e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2905  putative flavodoxin  35.88 
 
 		 258 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2115  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  35.36 
 
 		 263 aa  151  1e-35  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.267923  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0310  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  32.95 
 
 		 255 aa  141  9.999999999999999e-33  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0053324  hitchhiker  0.000000742335 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1140  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  34.96 
 
 		 271 aa  132  6.999999999999999e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.439364  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1740  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  28.83 
 
 		 281 aa  84.3  0.000000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00299505  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1416  iron-sulfur cluster-binding protein  40.62 
 
 		 99 aa  75.1  0.000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.584187  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2177  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  28.27 
 
 		 282 aa  60.1  0.00000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1431  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  19.92 
 
 		 264 aa  52  0.000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2063  polyferredoxin, putative  24.37 
 
 		 259 aa  50.1  0.00004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1529  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  24.49 
 
 		 282 aa  50.1  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1835  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  19.75 
 
 		 253 aa  49.7  0.00005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0067  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  19.75 
 
 		 253 aa  49.7  0.00005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.947437  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2086  ferredoxin  38.89 
 
 		 128 aa  47  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.771962 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2351  iron-sulfur cluster-binding protein  23.35 
 
 		 259 aa  46.6  0.0004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00218964  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1717  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  38.98 
 
 		 233 aa  46.6  0.0004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.310265  normal  0.576374 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1294  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  21.6 
 
 		 261 aa  45.1  0.001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0224  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  33.33 
 
 		 367 aa  43.5  0.003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.581044  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0194  ferredoxin-type protein (NapH)  40.74 
 
 		 233 aa  43.9  0.003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.728865  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0318  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  31.51 
 
 		 550 aa  43.1  0.004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0260  iron-sulfur cluster-binding protein  23.26 
 
 		 303 aa  42.7  0.006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3200  methyl-viologen-reducing hydrogenase delta subunit  32.26 
 
 		 763 aa  42.7  0.006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02950  putative PAS/PAC sensor protein  40 
 
 		 877 aa  42.7  0.007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1102  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  20.2 
 
 		 260 aa  42.4  0.007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0494  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  37.5 
 
 		 519 aa  42.7  0.007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0556  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  32.88 
 
 		 542 aa  42.4  0.007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1879  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  36.54 
 
 		 410 aa  42.7  0.007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.281207  normal  0.354147 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0886  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  38.89 
 
 		 233 aa  42.4  0.009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1903  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  24.19 
 
 		 265 aa  42  0.01  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3883  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  38.78 
 
 		 84 aa  42  0.01  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>