58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_2177 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_2177  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  100 
 
 		 282 aa  580  1e-164  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1740  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  37.35 
 
 		 281 aa  154  2e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00299505  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0260  iron-sulfur cluster-binding protein  25.47 
 
 		 303 aa  75.5  0.0000000000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2905  putative flavodoxin  28.46 
 
 		 258 aa  68.9  0.00000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2228  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  23.66 
 
 		 272 aa  68.2  0.0000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0174624  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1618  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  23.48 
 
 		 272 aa  62  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000243314  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1221  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  22.45 
 
 		 275 aa  61.6  0.00000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0626  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  25.3 
 
 		 266 aa  61.2  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2803  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  26.24 
 
 		 265 aa  57  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1276  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  30.56 
 
 		 264 aa  57  0.0000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0526  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  28.14 
 
 		 260 aa  55.8  0.0000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.521957 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1101  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  25.1 
 
 		 262 aa  54.3  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3130  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  26.02 
 
 		 261 aa  53.9  0.000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2837  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  28.8 
 
 		 267 aa  53.5  0.000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2115  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  27.32 
 
 		 263 aa  52  0.00001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.267923  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0454  nitroreductase  43.4 
 
 		 271 aa  50.8  0.00003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00612332  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1288  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit F  35.71 
 
 		 346 aa  50.1  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3023  putative ferredoxin  26.97 
 
 		 269 aa  49.7  0.00005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1508  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  26.24 
 
 		 266 aa  49.7  0.00006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.620723  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2365  nitroreductase  44.26 
 
 		 273 aa  48.5  0.0001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1518  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  31.53 
 
 		 132 aa  47.8  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0341  NADH dehydrogenase (quinone)  42.59 
 
 		 597 aa  47.4  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.024737  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1298  NADH dehydrogenase (quinone)  39.62 
 
 		 598 aa  47  0.0004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1688  nitroreductase  39.13 
 
 		 273 aa  46.6  0.0004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1373  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  48 
 
 		 399 aa  45.4  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.255821  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1431  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  23.75 
 
 		 264 aa  45.1  0.001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1307  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  34.62 
 
 		 57 aa  44.7  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1883  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  42.11 
 
 		 192 aa  44.7  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.888786  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2063  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  42.31 
 
 		 385 aa  44.7  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000008917  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0390  nitroreductase  35.37 
 
 		 278 aa  44.3  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.36041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3762  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  24 
 
 		 276 aa  44.7  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0121  dihydroorotate dehydrogenase family protein  34.38 
 
 		 360 aa  44.7  0.002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0977  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  34.21 
 
 		 1105 aa  44.7  0.002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  0.00000028046  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1327  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  36.11 
 
 		 1481 aa  43.9  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0013  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.83 
 
 		 282 aa  43.5  0.003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0551  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  35 
 
 		 425 aa  43.9  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1397  NADH dehydrogenase (quinone)  40.74 
 
 		 597 aa  43.5  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0209404  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1857  NADH dehydrogenase (quinone)  43.4 
 
 		 600 aa  43.9  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1431  NIL domain protein  31.03 
 
 		 133 aa  43.9  0.003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000290887  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2944  iron-sulfur cluster-binding protein  37.93 
 
 		 155 aa  43.9  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2221  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  37.31 
 
 		 267 aa  43.9  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.100498  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1416  pyruvate ferredoxin oxidoreductase, delta subunit  37.31 
 
 		 88 aa  43.5  0.004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.509086  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1641  nitroreductase  34.94 
 
 		 272 aa  43.1  0.005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1074  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  25.94 
 
 		 266 aa  43.1  0.005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.190031  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1645  hypothetical protein  27.94 
 
 		 594 aa  42.7  0.006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.942552  normal  0.656502 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1266  nitroreductase  34.88 
 
 		 282 aa  42.7  0.007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3040  hypothetical protein  44 
 
 		 376 aa  42.7  0.007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000888548  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0310  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  22.05 
 
 		 255 aa  42.7  0.007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0053324  hitchhiker  0.000000742335 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3421  ferredoxin  37.74 
 
 		 58 aa  42.4  0.008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.387449 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2236  pyruvate synthase delta chain  35.09 
 
 		 85 aa  42.4  0.008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2443  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  55.17 
 
 		 452 aa  42.4  0.008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.915566 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0794  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  25.56 
 
 		 131 aa  42.4  0.008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.188784  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1188  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35 
 
 		 285 aa  42.4  0.008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2233  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  37.04 
 
 		 597 aa  42.4  0.009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1903  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  22.27 
 
 		 265 aa  42.4  0.009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0197  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  36.47 
 
 		 491 aa  42.4  0.009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0114933 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1527  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.77 
 
 		 283 aa  42.4  0.009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.181573  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1899  NADH dehydrogenase subunit I  27.62 
 
 		 169 aa  42  0.01  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.00550248  normal  0.26939 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>