84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_1618 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_1618  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  100 
 
 
272 aa  554  1e-157  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000243314  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2228  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  82.72 
 
 
272 aa  473  1e-132  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0174624  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1221  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  49.26 
 
 
275 aa  277  1e-73  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3130  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  40.15 
 
 
261 aa  204  9e-52  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0526  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  37.64 
 
 
260 aa  204  1e-51  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.521957 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1101  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  40.51 
 
 
262 aa  202  5e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3762  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  40.67 
 
 
276 aa  186  4e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2115  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  38.85 
 
 
263 aa  185  7e-46  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.267923  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1508  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  40.81 
 
 
266 aa  183  2.0000000000000003e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.620723  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0626  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  39.93 
 
 
266 aa  182  5.0000000000000004e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2803  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  39.13 
 
 
265 aa  181  1e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3023  putative ferredoxin  33.81 
 
 
269 aa  167  2e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2837  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  35.87 
 
 
267 aa  165  5.9999999999999996e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2905  putative flavodoxin  36.13 
 
 
258 aa  158  9e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1276  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  33.57 
 
 
264 aa  157  3e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0415  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  37.19 
 
 
256 aa  155  9e-37  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0310  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  31.6 
 
 
255 aa  146  4.0000000000000006e-34  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0053324  hitchhiker  0.000000742335 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1140  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  34.17 
 
 
271 aa  137  2e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.439364  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1740  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  25 
 
 
281 aa  73.2  0.000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00299505  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2177  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  23.48 
 
 
282 aa  62  0.00000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0260  iron-sulfur cluster-binding protein  23.11 
 
 
303 aa  52.8  0.000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2197  putative iron-sulfur protein  24.42 
 
 
268 aa  50.8  0.00003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1416  iron-sulfur cluster-binding protein  36.59 
 
 
99 aa  48.9  0.00008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.584187  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1899  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  20.99 
 
 
254 aa  48.5  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1835  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  20.7 
 
 
253 aa  46.6  0.0004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0309  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  24.42 
 
 
260 aa  47  0.0004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2019  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  47.73 
 
 
57 aa  46.6  0.0004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0067  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  20.7 
 
 
253 aa  46.6  0.0004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.947437  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1903  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  25 
 
 
265 aa  46.6  0.0004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1529  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  24.44 
 
 
282 aa  46.2  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1153  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  48.78 
 
 
493 aa  46.6  0.0005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0519703 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2968  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  23.17 
 
 
259 aa  46.2  0.0006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0780  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  32.61 
 
 
469 aa  45.8  0.0007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.222302  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1161  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  31.34 
 
 
519 aa  45.8  0.0007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0774  hypothetical protein  32.61 
 
 
469 aa  45.8  0.0007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.112831  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0538  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  28.17 
 
 
477 aa  45.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1748  cytochrome c oxidase cbb3 type, accessory protein FixG  26.03 
 
 
468 aa  45.1  0.001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00201056 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1777  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  23.93 
 
 
369 aa  45.1  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1641  nitroreductase  38.6 
 
 
272 aa  45.4  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0903  hypothetical protein  28.12 
 
 
157 aa  45.4  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  hitchhiker  0.000048234 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0388  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  33.33 
 
 
334 aa  45.1  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5931  cytochrome c oxidase cbb3 type accessory protein FixG  48.72 
 
 
524 aa  44.3  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.420299 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0692  iron-sulfur cluster-binding protein  28.17 
 
 
477 aa  44.3  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1281  cytochrome c oxidase accessory protein CcoG  31.73 
 
 
477 aa  44.3  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1074  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  46.51 
 
 
266 aa  44.3  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.190031  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2472  nitroreductase  36 
 
 
272 aa  43.9  0.003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.151442  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1844  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  31.11 
 
 
485 aa  43.9  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.965223  normal  0.826111 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1885  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  31.58 
 
 
1016 aa  43.9  0.003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1073  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  32.05 
 
 
263 aa  43.9  0.003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.112396  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2530  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  34.62 
 
 
484 aa  43.9  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.737644 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3660.1  ferredoxin  35.56 
 
 
346 aa  43.5  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0344  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  46.51 
 
 
267 aa  43.9  0.003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0778  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  40 
 
 
618 aa  43.5  0.003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.542223  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3419  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  28.57 
 
 
470 aa  43.9  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0724088  normal  0.0680698 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2347  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  46.34 
 
 
477 aa  43.5  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.408057 
 
 
-
 
NC_004310  BR0359  iron-sulfur cluster-binding protein  44.19 
 
 
516 aa  43.1  0.004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.649908  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1183  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  40 
 
 
363 aa  43.5  0.004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1877  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  33.77 
 
 
460 aa  43.1  0.004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5020  cytochrome c oxidase accessory protein CcoG  41.86 
 
 
523 aa  43.5  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0465  cytochrome c oxidase cbb3 type accessory protein FixG  44.19 
 
 
521 aa  43.5  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.421731  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0375  cytochrome c oxidase accessory protein CcoG  44.19 
 
 
515 aa  43.1  0.004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.515612  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2795  nitrogen fixation protein  45.24 
 
 
488 aa  43.1  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.31119  normal  0.817799 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0457  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  38.71 
 
 
485 aa  43.1  0.005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3853  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  45 
 
 
506 aa  43.1  0.005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2487  cytochrome c oxidase accessory protein CcoG  43.9 
 
 
466 aa  43.1  0.005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.07329 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4958  cytochrome c oxidase accessory protein CcoG  46.15 
 
 
522 aa  43.1  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.675511  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2505  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  20 
 
 
264 aa  42.7  0.006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3083  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  32 
 
 
480 aa  42.7  0.006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2293  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  31.88 
 
 
238 aa  42.7  0.006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000237712  hitchhiker  0.000000435819 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2449  cytochrome c oxidase accessory protein CcoG  34.88 
 
 
489 aa  42.7  0.006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.77223  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2390  cytochrome c oxidase accessory protein CcoG  44.19 
 
 
528 aa  42.4  0.007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.399444  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1998  FixG-related protein  36.76 
 
 
470 aa  42.4  0.007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.749846  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0062  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  24.14 
 
 
354 aa  42.7  0.007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5572  hypothetical protein  27.97 
 
 
170 aa  42.4  0.007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2540  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  45 
 
 
476 aa  42.4  0.008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1359  cytochrome c oxidase accessory protein CcoG  48.72 
 
 
485 aa  42.4  0.008  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.162506 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0728  cytochrome c oxidase accessory protein CcoG  38.24 
 
 
475 aa  42.4  0.008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.137672 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2539  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  38.03 
 
 
472 aa  42.4  0.008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.644869  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3200  methyl-viologen-reducing hydrogenase delta subunit  37.29 
 
 
763 aa  42.4  0.009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1528  cytochrome c oxidase cbb3 type accessory protein FixG  43.9 
 
 
513 aa  42  0.009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2608  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  48.72 
 
 
470 aa  42.4  0.009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0319381  normal  0.552113 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3559  cytochrome c oxidase accessory protein CcoG  36.96 
 
 
497 aa  42  0.009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.499056  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3228  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  31.46 
 
 
477 aa  42  0.009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.12962  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1578  radical SAM family protein  36 
 
 
280 aa  42.4  0.009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>