35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU1416 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1416  iron-sulfur cluster-binding protein  100 
 
 		 99 aa  198  1.9999999999999998e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.584187  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2837  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  58.59 
 
 		 267 aa  124  4.0000000000000003e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2905  putative flavodoxin  48.98 
 
 		 258 aa  104  5e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1508  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  44.79 
 
 		 266 aa  89.7  1e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.620723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0626  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  40.62 
 
 		 266 aa  84  6e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1276  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  42.71 
 
 		 264 aa  81.3  0.000000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1140  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  41.24 
 
 		 271 aa  80.1  0.000000000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.439364  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0526  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  45.36 
 
 		 260 aa  76.3  0.0000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.521957 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1101  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  40.62 
 
 		 262 aa  75.1  0.0000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2115  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  40 
 
 		 263 aa  71.6  0.000000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.267923  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2803  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  39.18 
 
 		 265 aa  69.7  0.00000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3130  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  33.33 
 
 		 261 aa  61.2  0.000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3023  putative ferredoxin  37.11 
 
 		 269 aa  56.6  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3132  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  41.67 
 
 		 298 aa  52  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00229195  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1221  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  33.66 
 
 		 275 aa  50.8  0.000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3762  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  29.59 
 
 		 276 aa  48.9  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0121  dihydroorotate dehydrogenase family protein  40.43 
 
 		 360 aa  48.9  0.00002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1618  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  36.59 
 
 		 272 aa  48.9  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000243314  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1188  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  36.84 
 
 		 289 aa  45.8  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.445325  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2968  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  40.38 
 
 		 259 aa  43.5  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0799  pyruvate flavodoxin/ferredoxin oxidoreductase domain protein  29.13 
 
 		 1192 aa  43.1  0.001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.000076441  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0561  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  30.38 
 
 		 298 aa  42.7  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0370155  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0310  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  31.94 
 
 		 255 aa  42  0.003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0053324  hitchhiker  0.000000742335 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0213  iron-sulfur cluster-binding domain-containing protein  37.74 
 
 		 547 aa  42  0.003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.462864  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0978  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  33.33 
 
 		 848 aa  42  0.003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000062571  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0531  pyruvate flavodoxin/ferredoxin oxidoreductase domain protein  29.41 
 
 		 1184 aa  41.2  0.005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1903  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  48.84 
 
 		 265 aa  41.2  0.005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2228  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  29.63 
 
 		 272 aa  41.2  0.005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0174624  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3096  hypothetical protein  33.33 
 
 		 451 aa  40.8  0.005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000224267  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2427  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  45.1 
 
 		 283 aa  40.8  0.006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2942  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  43.75 
 
 		 427 aa  40.8  0.006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.453854  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1208  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  32.53 
 
 		 252 aa  40.4  0.008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.226249  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1630  benzoyl-CoA oxygenase, component A  43.75 
 
 		 426 aa  40.4  0.008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.170592  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2086  ferredoxin  40.38 
 
 		 128 aa  40.4  0.008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.771962 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0804  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  36 
 
 		 136 aa  40.4  0.009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>