62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1903 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_1903  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  100 
 
 
265 aa  553  1e-157  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1073  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  66.92 
 
 
263 aa  356  1.9999999999999998e-97  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.112396  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0344  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  51.89 
 
 
267 aa  280  2e-74  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1074  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  50.37 
 
 
266 aa  257  2e-67  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.190031  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0278  hypothetical protein  39.85 
 
 
268 aa  177  2e-43  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1294  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  34.88 
 
 
261 aa  170  3e-41  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1529  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  36.15 
 
 
282 aa  159  5e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2063  polyferredoxin, putative  34.48 
 
 
259 aa  159  5e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3647  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  34.47 
 
 
268 aa  158  1e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2351  iron-sulfur cluster-binding protein  33.72 
 
 
259 aa  158  1e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00218964  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2197  putative iron-sulfur protein  31.42 
 
 
268 aa  146  4.0000000000000006e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0309  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  31.54 
 
 
260 aa  142  5e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0472  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  34.85 
 
 
257 aa  139  7e-32  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.448706 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1102  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  32.08 
 
 
260 aa  129  4.0000000000000003e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0067  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  32.17 
 
 
253 aa  125  7e-28  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.947437  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1835  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  32.17 
 
 
253 aa  125  7e-28  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2505  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  34.19 
 
 
264 aa  121  9.999999999999999e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0618  hypothetical protein  28.95 
 
 
255 aa  116  5e-25  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1263  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  44.79 
 
 
117 aa  108  1e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0285894  normal  0.165921 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1899  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  28.46 
 
 
254 aa  106  4e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1264  hypothetical protein  41.43 
 
 
162 aa  99.4  6e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0238367  normal  0.165921 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05370  4Fe-4S protein  31.58 
 
 
313 aa  98.6  8e-20  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.716357  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1431  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  27.04 
 
 
264 aa  84.3  0.000000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0985  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  28.46 
 
 
356 aa  72.8  0.000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1585  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  23.64 
 
 
315 aa  71.2  0.00000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1283  hypothetical protein  45.59 
 
 
75 aa  64.7  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.260163  normal  0.350827 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1740  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  25.46 
 
 
281 aa  56.2  0.0000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00299505  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2968  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  22.47 
 
 
259 aa  53.9  0.000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0260  iron-sulfur cluster-binding protein  20.49 
 
 
303 aa  53.1  0.000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2803  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  32.61 
 
 
265 aa  52  0.000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3023  putative ferredoxin  46.94 
 
 
269 aa  50.8  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1866  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  33.73 
 
 
351 aa  50.4  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.490364  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0626  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  24.4 
 
 
266 aa  49.3  0.00006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0997  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.21 
 
 
292 aa  48.9  0.00008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.912135  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03080  hypothetical protein  36.19 
 
 
377 aa  47.4  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2905  putative flavodoxin  24.6 
 
 
258 aa  47.8  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0503  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  48.28 
 
 
590 aa  47  0.0003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.163144  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1618  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  25 
 
 
272 aa  46.6  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000243314  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1736  putative oxidoreductase  29.21 
 
 
615 aa  45.8  0.0008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0304  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  36.25 
 
 
166 aa  45.4  0.001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.792307 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2085  dihydroorotate dehydrogenase family protein  46.67 
 
 
381 aa  44.7  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00414883  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1221  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  23.05 
 
 
275 aa  44.7  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3407  F420H2 dehydrogenase subunit I  29.91 
 
 
136 aa  44.3  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00224717  normal  0.799807 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1484  electron transfer flavoprotein alpha subunit  35.59 
 
 
397 aa  44.7  0.002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.11518  normal  0.562863 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1222  putative oxidoreductase  27.71 
 
 
616 aa  44.3  0.002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0767368  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0224  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  33.87 
 
 
367 aa  43.9  0.003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.581044  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0889  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  31.25 
 
 
357 aa  43.9  0.003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000133582  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0456  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  37.35 
 
 
361 aa  43.9  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1601  putative oxidoreductase  33.82 
 
 
615 aa  43.9  0.003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0911  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  31.25 
 
 
357 aa  43.5  0.003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000589755  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1879  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  33.33 
 
 
410 aa  43.5  0.004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.281207  normal  0.354147 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0526  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  24.61 
 
 
260 aa  42.7  0.005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.521957 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06320  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 51 kDa subunit  29.89 
 
 
594 aa  43.1  0.005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000903471  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0207  glycyl-radical activating family protein  30.77 
 
 
306 aa  42.7  0.006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0885  putative oxidoreductase  29.76 
 
 
612 aa  42.7  0.007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3830  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  30.34 
 
 
677 aa  42.4  0.008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1943  protein of unknown function DUF362  45.83 
 
 
383 aa  42.4  0.008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00286214  normal  0.07931 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2193  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  40 
 
 
60 aa  42  0.009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2177  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  22.27 
 
 
282 aa  42.4  0.009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18380  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  37.29 
 
 
287 aa  42  0.01  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.26924e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1089  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.48 
 
 
278 aa  42  0.01  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000771528  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2233  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  36.78 
 
 
597 aa  42  0.01  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>