58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_1835 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009975  MmarC6_1835  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  100 
 
 
253 aa  522  1e-147  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0067  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  100 
 
 
253 aa  522  1e-147  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.947437  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0618  hypothetical protein  47.08 
 
 
255 aa  231  6e-60  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0278  hypothetical protein  36.54 
 
 
268 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0309  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  35.12 
 
 
260 aa  134  9.999999999999999e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2063  polyferredoxin, putative  31.13 
 
 
259 aa  126  3e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1073  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  30.23 
 
 
263 aa  125  5e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.112396  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1903  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  32.17 
 
 
265 aa  125  6e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2351  iron-sulfur cluster-binding protein  31.13 
 
 
259 aa  124  1e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00218964  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1899  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  33.33 
 
 
254 aa  120  3e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1074  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  30.42 
 
 
266 aa  118  7e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.190031  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1102  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  31.32 
 
 
260 aa  117  1.9999999999999998e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0344  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  30.57 
 
 
267 aa  116  3.9999999999999997e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1294  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  29.64 
 
 
261 aa  115  6.9999999999999995e-25  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1529  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  30.89 
 
 
282 aa  113  2.0000000000000002e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3647  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  27.69 
 
 
268 aa  113  4.0000000000000004e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0472  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  31.22 
 
 
257 aa  110  2.0000000000000002e-23  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.448706 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2197  putative iron-sulfur protein  28.27 
 
 
268 aa  97.1  3e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2505  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  27.63 
 
 
264 aa  90.9  2e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2968  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  31.69 
 
 
259 aa  77  0.0000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1264  hypothetical protein  31.82 
 
 
162 aa  73.6  0.000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0238367  normal  0.165921 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05370  4Fe-4S protein  26.64 
 
 
313 aa  68.9  0.00000000007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.716357  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1263  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  32.99 
 
 
117 aa  62.4  0.000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0285894  normal  0.165921 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0985  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  22.02 
 
 
356 aa  59.3  0.00000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2228  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  26.1 
 
 
272 aa  57.4  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0174624  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1431  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  21.76 
 
 
264 aa  56.2  0.0000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3762  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  23.24 
 
 
276 aa  49.7  0.00004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3023  putative ferredoxin  21.48 
 
 
269 aa  48.9  0.00008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0591  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  25.12 
 
 
390 aa  48.9  0.00008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.463263  normal  0.063336 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1101  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  19.75 
 
 
262 aa  47.4  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1585  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  23.33 
 
 
315 aa  47.4  0.0002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0388  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  31.82 
 
 
334 aa  47.4  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1740  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  39.62 
 
 
281 aa  47  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00299505  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1618  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  20.7 
 
 
272 aa  46.6  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000243314  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2242  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  27.01 
 
 
387 aa  47  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0193529  normal  0.0185551 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0147  ech hydrogenase subunit F  37.5 
 
 
122 aa  46.2  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2803  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  22.22 
 
 
265 aa  45.8  0.0007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0366  hypothetical protein  29.29 
 
 
392 aa  45.1  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.86723  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0246  hypothetical protein  26.75 
 
 
396 aa  44.7  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.742639 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0875  hypothetical protein  33.33 
 
 
261 aa  43.9  0.002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000895194  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1283  hypothetical protein  36.92 
 
 
75 aa  44.3  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.260163  normal  0.350827 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3200  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulphur binding, conserved site  35.94 
 
 
134 aa  44.3  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.708883  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0885  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  37.04 
 
 
267 aa  44.3  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0213138 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0879  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  27.85 
 
 
381 aa  44.3  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0897  hypothetical protein  33.33 
 
 
261 aa  43.9  0.002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000169458  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2618  sulfite reductase, beta subunit  44.83 
 
 
285 aa  43.5  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.433957 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2239  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  35.29 
 
 
371 aa  43.1  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000624735 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0260  iron-sulfur cluster-binding protein  35.94 
 
 
303 aa  43.1  0.005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1576  methyl-viologen-reducing hydrogenase, delta subunit  37.04 
 
 
791 aa  42.7  0.006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1379  ferredoxin  37.93 
 
 
265 aa  42.7  0.006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000430002  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1904  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  24 
 
 
228 aa  42.7  0.006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000083594  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1321  ferredoxin  38.46 
 
 
273 aa  42.4  0.007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1288  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit F  36.84 
 
 
346 aa  42.4  0.007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4011  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  33.33 
 
 
671 aa  42.4  0.008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27430  4Fe-4S protein  28 
 
 
414 aa  42.4  0.008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2139  NADH dehydrogenase (quinone)  36.36 
 
 
596 aa  42  0.009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.306565  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20700  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  32.76 
 
 
370 aa  42  0.01  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.921643  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2056  hydrogenase, Fe-only  35.53 
 
 
644 aa  42  0.01  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000410653  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>