79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_1529 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_1529  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  100 
 
 		 282 aa  593  1e-168  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3647  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  72.8 
 
 		 268 aa  421  1e-117  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0278  hypothetical protein  36.12 
 
 		 268 aa  172  7.999999999999999e-42  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1903  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  36.15 
 
 		 265 aa  159  5e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2197  putative iron-sulfur protein  30.62 
 
 		 268 aa  156  3e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1073  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  36.88 
 
 		 263 aa  155  6e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.112396  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1074  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  35.96 
 
 		 266 aa  154  1e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.190031  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0344  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  35.74 
 
 		 267 aa  152  5e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2063  polyferredoxin, putative  32.05 
 
 		 259 aa  152  5e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2351  iron-sulfur cluster-binding protein  31.66 
 
 		 259 aa  150  3e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00218964  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1102  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  32.32 
 
 		 260 aa  149  6e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1294  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  30.15 
 
 		 261 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0309  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  29.48 
 
 		 260 aa  139  6e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0472  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  30.65 
 
 		 257 aa  134  1.9999999999999998e-30  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.448706 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1899  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  30.35 
 
 		 254 aa  119  4.9999999999999996e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0067  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  30.89 
 
 		 253 aa  113  3e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.947437  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1835  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  30.89 
 
 		 253 aa  113  3e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0618  hypothetical protein  28.79 
 
 		 255 aa  112  5e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2505  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  31.92 
 
 		 264 aa  106  4e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05370  4Fe-4S protein  30.8 
 
 		 313 aa  105  7e-22  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.716357  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1264  hypothetical protein  40.44 
 
 		 162 aa  97.1  3e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0238367  normal  0.165921 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1431  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  25.73 
 
 		 264 aa  93.2  4e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1263  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  38.38 
 
 		 117 aa  89.4  6e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0285894  normal  0.165921 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0985  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  26.72 
 
 		 356 aa  75.5  0.0000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1585  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  23.79 
 
 		 315 aa  68.6  0.0000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2968  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  22.73 
 
 		 259 aa  61.6  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1221  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  22.51 
 
 		 275 aa  59.3  0.00000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1740  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  24.18 
 
 		 281 aa  57  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00299505  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1283  hypothetical protein  38.57 
 
 		 75 aa  57  0.0000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.260163  normal  0.350827 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3023  putative ferredoxin  24.58 
 
 		 269 aa  51.6  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2803  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  21.22 
 
 		 265 aa  50.1  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1070  ferredoxin  26.83 
 
 		 417 aa  49.7  0.00005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000699309  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0532  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  43.18 
 
 		 55 aa  49.3  0.00007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000183692  normal  0.0950225 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2228  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  23.85 
 
 		 272 aa  48.9  0.00009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0174624  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0310  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  23.35 
 
 		 255 aa  48.5  0.0001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0053324  hitchhiker  0.000000742335 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3762  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  21.05 
 
 		 276 aa  47.4  0.0003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1101  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  24.49 
 
 		 262 aa  46.6  0.0005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1618  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  24.44 
 
 		 272 aa  46.2  0.0006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000243314  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3830  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  34.38 
 
 		 677 aa  46.2  0.0006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2715  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  38.89 
 
 		 439 aa  45.4  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.777462 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1418  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  38.1 
 
 		 62 aa  45.4  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.020637  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0885  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  39.22 
 
 		 267 aa  45.4  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0213138 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0013  coenzyme F420-reducing hydrogenase, gamma subunit  27.87 
 
 		 303 aa  45.1  0.001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1501  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  40.38 
 
 		 442 aa  45.1  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1389  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  37.1 
 
 		 61 aa  44.3  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1163  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  39.68 
 
 		 62 aa  44.3  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000343537  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1484  electron transfer flavoprotein alpha subunit  30.36 
 
 		 397 aa  44.3  0.002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.11518  normal  0.562863 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1010  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  29.27 
 
 		 80 aa  44.7  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.87535  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1072  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  44 
 
 		 56 aa  45.1  0.002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4921  pyruvate formate lyase activating enzyme  27.4 
 
 		 287 aa  43.9  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4973  pyruvate formate lyase activating enzyme  27.4 
 
 		 287 aa  43.9  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.577557  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4886  pyruvate formate lyase activating enzyme  27.4 
 
 		 287 aa  43.9  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0614153  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4980  pyruvate formate lyase activating enzyme  27.4 
 
 		 287 aa  43.9  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.902486  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1082  ferredoxin, 4Fe-4S  38.1 
 
 		 62 aa  43.9  0.003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000712834  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0477  coenzyme F420 hydrogenase  28.33 
 
 		 252 aa  43.5  0.004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.741766 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1410  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  40.91 
 
 		 56 aa  43.5  0.004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000386178  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0092  protein of unknown function DUF362  34.62 
 
 		 378 aa  43.5  0.004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0539  radical SAM domain-containing protein  32.88 
 
 		 286 aa  43.5  0.004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.536382  normal  0.0504206 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1212  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  40.38 
 
 		 441 aa  43.5  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.72306  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0526  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  35.85 
 
 		 260 aa  43.1  0.005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.521957 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0589  hypothetical protein  31.15 
 
 		 385 aa  43.1  0.005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000367442  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03080  hypothetical protein  39.53 
 
 		 377 aa  43.1  0.005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0694  NADH ubiquinone oxidoreductase 20 kDa subunit  36.23 
 
 		 228 aa  43.1  0.005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.244067  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0086  coenzyme F420 hydrogenase, subunit gamma  31.76 
 
 		 253 aa  43.1  0.005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0290511  normal  0.0588594 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0341  NADH dehydrogenase (quinone)  42.86 
 
 		 597 aa  43.1  0.005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.024737  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4819  pyruvate formate lyase activating enzyme  27.4 
 
 		 287 aa  43.1  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.387597  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1033  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  35.21 
 
 		 74 aa  42.7  0.006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  1.1303200000000001e-18  hitchhiker  0.00000903571 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0551  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  25.23 
 
 		 425 aa  42.7  0.006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0577  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  37.1 
 
 		 61 aa  42.7  0.006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0382832  normal  0.50994 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0997  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.93 
 
 		 292 aa  42.7  0.007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.912135  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0557  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  42.86 
 
 		 444 aa  42.7  0.007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0571  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  38.46 
 
 		 443 aa  42.7  0.007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.871139  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3040  hypothetical protein  41.86 
 
 		 376 aa  42.7  0.007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000888548  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0161  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  38.18 
 
 		 56 aa  42.7  0.007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00612444  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07270  NADH:ubiquinone oxidoreductase chain I-like protein  30 
 
 		 144 aa  42.7  0.007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.194831  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1929  hypothetical protein  40 
 
 		 633 aa  42.7  0.007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.986915  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2233  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  37.5 
 
 		 597 aa  42.4  0.009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2330  coenzyme F420 hydrogenase  28.33 
 
 		 262 aa  42  0.01  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1736  ferredoxin, 2(4Fe-4S)  36.54 
 
 		 56 aa  42.4  0.01  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.868501  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>