61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_1479 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_1479  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  100 
 
 		 77 aa  155  2e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0677  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  87.01 
 
 		 77 aa  138  3e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.35161 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4883  putative ferredoxin  85.71 
 
 		 77 aa  135  1e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.169548  normal  0.332371 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4190  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  81.82 
 
 		 77 aa  130  7.999999999999999e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.806772  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3350  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  81.82 
 
 		 77 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.417972  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3675  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  81.82 
 
 		 77 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.969084  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2802  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  74.03 
 
 		 77 aa  121  4e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.772345 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4204  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  75.34 
 
 		 88 aa  118  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4092  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  75.34 
 
 		 88 aa  118  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.141555  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6150  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  68.83 
 
 		 77 aa  117  6e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4197  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  68.83 
 
 		 77 aa  114  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3162  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  72.22 
 
 		 81 aa  113  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.274063  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5012  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  70.83 
 
 		 81 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1297  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  73.24 
 
 		 81 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.814234  normal  0.164928 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34920  putative ferredoxin  72.22 
 
 		 81 aa  112  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000025951  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1888  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  73.24 
 
 		 81 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.394196  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1973  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  73.24 
 
 		 81 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1961  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  73.24 
 
 		 81 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.323948  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6104  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  73.24 
 
 		 81 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.416021  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5288  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  73.24 
 
 		 81 aa  111  3e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.782627  normal  0.0624847 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0206  ferredoxin, 4Fe-4S  69.44 
 
 		 81 aa  110  8.000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.623695 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1997  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  73.24 
 
 		 81 aa  110  8.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.859731  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4072  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  55.84 
 
 		 80 aa  95.9  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.512619  normal  0.499645 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3789  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  62.82 
 
 		 76 aa  93.2  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2223  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  47.06 
 
 		 75 aa  50.4  0.000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.454145 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0272  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  36.76 
 
 		 66 aa  47.4  0.00007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0565502 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3521  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  36.92 
 
 		 66 aa  46.6  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000023193  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0759  ferredoxin  39.34 
 
 		 60 aa  46.6  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000247622 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0556  nitroreductase  35.94 
 
 		 345 aa  45.8  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0380  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  42.86 
 
 		 71 aa  45.8  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2058  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  34.85 
 
 		 67 aa  44.3  0.0006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1194  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  39.34 
 
 		 1487 aa  44.3  0.0006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2283  adenylylsulfate reductase, beta subunit  40.82 
 
 		 160 aa  44.3  0.0006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3096  hypothetical protein  35.82 
 
 		 451 aa  43.1  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000224267  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1334  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  41.07 
 
 		 368 aa  43.5  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0262596 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3050  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  31.58 
 
 		 432 aa  42.4  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2501  aldo/keto reductase  40.68 
 
 		 316 aa  42.7  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0064  adenylylsulfate reductase, beta subunit  34.92 
 
 		 159 aa  42.4  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0736  ferredoxin  39.58 
 
 		 59 aa  42  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0310  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  33.33 
 
 		 321 aa  42  0.003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000217497  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2056  hydrogenase, Fe-only  33.33 
 
 		 644 aa  42  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000410653  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1825  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  37.7 
 
 		 287 aa  41.6  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3534  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  30.3 
 
 		 950 aa  41.6  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.93778  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2705  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  32.35 
 
 		 259 aa  41.6  0.004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0178  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  39.29 
 
 		 443 aa  41.6  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2405  molydopterin dinucleotide-binding region  40 
 
 		 1299 aa  41.2  0.005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.598133  hitchhiker  0.00155962 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0117  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  39.29 
 
 		 318 aa  41.2  0.005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0168  glycyl-radical enzyme activating protein family  37.04 
 
 		 303 aa  40.8  0.006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.465492  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1031  iron-sulfur cluster-binding protein  42.86 
 
 		 63 aa  40.8  0.006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.125159  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1528  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  39.71 
 
 		 88 aa  40.8  0.006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.546618  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1709  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding domain protein  38.46 
 
 		 118 aa  40.8  0.007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0318  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  37.93 
 
 		 175 aa  40.4  0.007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.188751  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1576  methyl-viologen-reducing hydrogenase, delta subunit  38.98 
 
 		 791 aa  40.8  0.007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1379  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  31.25 
 
 		 936 aa  40.4  0.008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000976966 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2557  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  34.78 
 
 		 369 aa  40.4  0.008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.75783  normal  0.24962 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1188  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  34.62 
 
 		 289 aa  40.4  0.008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.445325  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3051  formate hydrogenlyase complex iron-sulfur subunit  35.09 
 
 		 180 aa  40  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.266242 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0532  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  39.66 
 
 		 55 aa  40.4  0.009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000183692  normal  0.0950225 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1977  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  35.09 
 
 		 1021 aa  40  0.01  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2969  formate hydrogenlyase complex iron-sulfur subunit  35.09 
 
 		 180 aa  40  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3035  formate hydrogenlyase complex iron-sulfur subunit  35.09 
 
 		 180 aa  40  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000101448 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>