90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_5012 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010501  PputW619_5012  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  100 
 
 
81 aa  167  4e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0206  ferredoxin, 4Fe-4S  98.77 
 
 
81 aa  165  2e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.623695 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3162  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  93.83 
 
 
81 aa  160  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.274063  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34920  putative ferredoxin  88.89 
 
 
81 aa  155  2e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000025951  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1297  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  79.01 
 
 
81 aa  141  3e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.814234  normal  0.164928 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1961  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  79.01 
 
 
81 aa  139  9e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.323948  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1888  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  79.01 
 
 
81 aa  139  9e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.394196  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6104  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  77.78 
 
 
81 aa  136  1e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.416021  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1973  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  77.78 
 
 
81 aa  136  1e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5288  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  76.54 
 
 
81 aa  134  5e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.782627  normal  0.0624847 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1997  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  76.54 
 
 
81 aa  133  7.000000000000001e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.859731  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4204  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  75.31 
 
 
88 aa  132  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4092  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  75.31 
 
 
88 aa  132  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.141555  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2802  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  75.71 
 
 
77 aa  120  8e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.772345 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6150  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  72.97 
 
 
77 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4197  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  75.71 
 
 
77 aa  114  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4190  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  65.43 
 
 
77 aa  112  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.806772  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1479  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  70.83 
 
 
77 aa  113  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3675  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  65.43 
 
 
77 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.969084  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3350  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  65.43 
 
 
77 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.417972  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0677  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  71.43 
 
 
77 aa  111  3e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.35161 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4883  putative ferredoxin  65.43 
 
 
77 aa  111  4.0000000000000004e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.169548  normal  0.332371 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3789  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  67.61 
 
 
76 aa  98.2  4e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4072  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  59.15 
 
 
80 aa  95.9  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.512619  normal  0.499645 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0481  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  38.81 
 
 
96 aa  50.1  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02130  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  39.71 
 
 
107 aa  48.9  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1894  ferredoxin  36.14 
 
 
282 aa  49.3  0.00002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000000460706  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0272  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  38.81 
 
 
66 aa  48.5  0.00003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0565502 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0789  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  40.98 
 
 
107 aa  48.5  0.00003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1709  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding domain protein  40.58 
 
 
118 aa  47.4  0.00007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1334  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  41.67 
 
 
368 aa  47.4  0.00007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0262596 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0318  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  44.83 
 
 
175 aa  47.4  0.00007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.188751  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0351  adenylylsulfate reductase, beta subunit  41.67 
 
 
160 aa  46.6  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.480328  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2892  adenylylsulfate reductase, beta subunit  42.62 
 
 
167 aa  45.4  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.409396 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2130  adenylylsulfate reductase, beta subunit  42.62 
 
 
162 aa  46.2  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.925917  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1109  adenylylsulfate reductase subunit beta  42.62 
 
 
162 aa  45.4  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000257152  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0064  adenylylsulfate reductase, beta subunit  41.67 
 
 
159 aa  44.7  0.0004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0832  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  30.16 
 
 
314 aa  44.7  0.0004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.00148758  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1241  ferredoxin family protein  36.76 
 
 
96 aa  45.1  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.251684  normal  0.0451259 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2137  adenylylsulfate reductase, beta subunit  40.98 
 
 
167 aa  44.7  0.0005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2283  adenylylsulfate reductase, beta subunit  41.67 
 
 
160 aa  44.7  0.0005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0919  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  28.99 
 
 
281 aa  43.9  0.0007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3521  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  31.25 
 
 
66 aa  43.5  0.0009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000023193  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2705  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  34.78 
 
 
259 aa  43.1  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0968  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  44.26 
 
 
63 aa  43.5  0.001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.35121  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0997  adenylylsulfate reductase, beta subunit  39.68 
 
 
144 aa  42.7  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000160425  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0994  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  37.88 
 
 
395 aa  43.5  0.001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2058  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  34.85 
 
 
67 aa  43.1  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1113  NIL domain protein  29.69 
 
 
147 aa  43.1  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.646686  normal  0.0231239 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0759  ferredoxin  36.07 
 
 
60 aa  43.1  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000247622 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2557  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  33.78 
 
 
369 aa  43.5  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.75783  normal  0.24962 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1429  adenylylsulfate reductase, beta subunit  46.94 
 
 
160 aa  42.4  0.002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0667078 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3197  adenylylsulfate reductase, beta subunit  40.98 
 
 
162 aa  42.4  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.00000000312858  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0074  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  40.32 
 
 
62 aa  42.4  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.112658  normal  0.013412 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1234  adenylylsulfate reductase, beta subunit  46.94 
 
 
164 aa  41.6  0.003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.480788  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2223  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  38.24 
 
 
75 aa  42  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.454145 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2990  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  33.33 
 
 
179 aa  42  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1188  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  36.54 
 
 
289 aa  41.6  0.004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.445325  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1968  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  33.9 
 
 
208 aa  41.6  0.004  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000012714  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0117  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  32.69 
 
 
318 aa  41.2  0.004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0085  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  34.55 
 
 
840 aa  41.6  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2387  hypothetical protein  33.9 
 
 
208 aa  41.6  0.004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00833756  hitchhiker  0.0000441402 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01643  predicted 4Fe-4S ferridoxin-type protein  33.9 
 
 
208 aa  41.6  0.004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0323242  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1523  hypothetical protein  33.9 
 
 
208 aa  41.6  0.004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00369582  hitchhiker  0.0000000711614 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1957  hypothetical protein  33.9 
 
 
208 aa  41.6  0.004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00915  hitchhiker  0.000000199442 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1755  hypothetical protein  33.9 
 
 
208 aa  41.6  0.004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000216624  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1889  hypothetical protein  33.9 
 
 
208 aa  41.6  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000269157  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0597  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  34.92 
 
 
129 aa  41.2  0.005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1714  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  37.7 
 
 
395 aa  41.2  0.005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20700  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  40.35 
 
 
370 aa  40.8  0.006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.921643  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2794  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  32.31 
 
 
687 aa  40.8  0.006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0439  formate dehydrogenase, beta subunit  37.33 
 
 
300 aa  40.8  0.007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1410  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  39.66 
 
 
56 aa  40.8  0.007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000386178  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4244  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  40 
 
 
281 aa  40.8  0.007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.700128  normal  0.148707 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0967  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  37.7 
 
 
395 aa  40.8  0.007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1441  ferredoxin family protein  31.34 
 
 
94 aa  40.8  0.007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0722291  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4164  CoB--CoM heterodisulfide reductase subunit A  34.43 
 
 
632 aa  40.4  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0657  NADH dehydrogenase (quinone)  33.33 
 
 
590 aa  40.4  0.008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.210561  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0178  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  42.86 
 
 
443 aa  40.4  0.008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1192  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  32.2 
 
 
105 aa  40.4  0.008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3467  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  32.31 
 
 
699 aa  40.4  0.008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0324842  normal  0.270074 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3718  NADH ubiquinone oxidoreductase 20 kDa subunit  32.14 
 
 
256 aa  40.4  0.008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0184008  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0979  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  37.7 
 
 
395 aa  40.4  0.008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.363777  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2056  hydrogenase, Fe-only  32.69 
 
 
644 aa  40.4  0.008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000410653  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0310  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  33.82 
 
 
321 aa  40.4  0.008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000217497  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3200  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulphur binding, conserved site  30.14 
 
 
134 aa  40.4  0.009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.708883  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0821  response regulator receiver modulated FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.05 
 
 
1139 aa  40  0.01  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.187038 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1967  adenylylsulfate reductase, beta subunit  37.7 
 
 
167 aa  40  0.01  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0419652 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0824  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  36.36 
 
 
557 aa  40  0.01  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1888  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  39.34 
 
 
114 aa  40  0.01  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000841156  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>