54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_1709 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_1709  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding domain protein  100 
 
 		 118 aa  244  2e-64  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0789  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  55.24 
 
 		 107 aa  126  1.0000000000000001e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1888  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  50 
 
 		 114 aa  116  9e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000841156  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02130  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  47.62 
 
 		 107 aa  101  4e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0925  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  42.61 
 
 		 113 aa  99.8  1e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0997  adenylylsulfate reductase, beta subunit  38.1 
 
 		 144 aa  81.6  0.000000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000160425  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1047  adenylylsulfate reductase, beta subunit  36.19 
 
 		 147 aa  77  0.00000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0187678  normal  0.010444 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0636  adenylylsulfate reductase, beta subunit  37.14 
 
 		 147 aa  74.7  0.0000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3578  adenylylsulfate reductase, beta subunit  35.24 
 
 		 146 aa  73.6  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000448806  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1886  adenylylsulfate reductase, beta subunit  35.24 
 
 		 145 aa  73.2  0.000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000106288  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1586  adenylylsulfate reductase subunit beta  34.29 
 
 		 140 aa  68.9  0.00000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00926364  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0040  adenylylsulfate reductase, beta subunit  34.31 
 
 		 140 aa  68.9  0.00000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.333831  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1838  adenylylsulfate reductase, beta subunit  33.33 
 
 		 140 aa  67  0.00000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0138336  normal  0.023497 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1081  adenylylsulfate reductase, beta subunit  34.29 
 
 		 147 aa  66.6  0.0000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3197  adenylylsulfate reductase, beta subunit  30.97 
 
 		 162 aa  65.1  0.0000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.00000000312858  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0873  adenylylsulfate reductase, beta subunit  34.23 
 
 		 161 aa  64.7  0.0000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.970747  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1967  adenylylsulfate reductase, beta subunit  30.09 
 
 		 167 aa  64.3  0.0000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0419652 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1109  adenylylsulfate reductase subunit beta  32.38 
 
 		 162 aa  63.9  0.0000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000257152  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2892  adenylylsulfate reductase, beta subunit  32.38 
 
 		 167 aa  63.5  0.0000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.409396 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2130  adenylylsulfate reductase, beta subunit  32.38 
 
 		 162 aa  62.8  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.925917  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2137  adenylylsulfate reductase, beta subunit  31.43 
 
 		 167 aa  62  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1192  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  34.09 
 
 		 105 aa  52.4  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0064  adenylylsulfate reductase, beta subunit  38.46 
 
 		 159 aa  50.8  0.000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2283  adenylylsulfate reductase, beta subunit  38.46 
 
 		 160 aa  50.4  0.000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0351  adenylylsulfate reductase, beta subunit  36.92 
 
 		 160 aa  48.9  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.480328  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0206  ferredoxin, 4Fe-4S  40.58 
 
 		 81 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.623695 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1297  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  37.68 
 
 		 81 aa  47.8  0.00006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.814234  normal  0.164928 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5012  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  40.58 
 
 		 81 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5288  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  42 
 
 		 81 aa  47  0.00009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.782627  normal  0.0624847 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1973  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  42 
 
 		 81 aa  46.2  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34920  putative ferredoxin  46 
 
 		 81 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000025951  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6104  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  42 
 
 		 81 aa  46.2  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.416021  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1997  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  42 
 
 		 81 aa  46.2  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.859731  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1831  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  32.58 
 
 		 103 aa  46.6  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4092  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  40.38 
 
 		 88 aa  46.2  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.141555  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3162  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  42.31 
 
 		 81 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.274063  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1888  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  40.38 
 
 		 81 aa  46.2  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.394196  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1961  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  40.38 
 
 		 81 aa  46.2  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.323948  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4204  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  40.38 
 
 		 88 aa  46.2  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2802  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  35.71 
 
 		 77 aa  45.4  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.772345 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4190  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  35.71 
 
 		 77 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.806772  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3350  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  35.71 
 
 		 77 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.417972  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3675  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  35.71 
 
 		 77 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.969084  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4072  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  40.38 
 
 		 80 aa  44.3  0.0007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.512619  normal  0.499645 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2058  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  39.39 
 
 		 67 aa  43.9  0.0008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3789  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  40.38 
 
 		 76 aa  43.1  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0677  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  38.46 
 
 		 77 aa  42.4  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.35161 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4883  putative ferredoxin  38.46 
 
 		 77 aa  42.4  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.169548  normal  0.332371 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0272  adenylylsulfate reductase, beta subunit  28.04 
 
 		 161 aa  41.2  0.006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.0000000000553885  hitchhiker  0.000000190129 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0832  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  35.29 
 
 		 314 aa  40.8  0.006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.00148758  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1479  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  38.46 
 
 		 77 aa  40.8  0.007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6150  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  38 
 
 		 77 aa  40.8  0.007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4197  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  38 
 
 		 77 aa  40.4  0.008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4294  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  42.86 
 
 		 632 aa  40  0.01  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.292871  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>