76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_1388 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_1388  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  100 
 
 		 118 aa  244  4e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0307097  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5001  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  60.64 
 
 		 98 aa  128  2.0000000000000002e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000620576  normal  0.363374 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21920  4Fe-4S ferredoxin protein  49.17 
 
 		 130 aa  114  3.9999999999999997e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5008  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  53.68 
 
 		 113 aa  111  3e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.308235  normal  0.685027 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3481  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  59.14 
 
 		 111 aa  108  3e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3288  putative ferrodoxin  49.06 
 
 		 125 aa  107  4.0000000000000004e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.197637 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1896  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  54.26 
 
 		 109 aa  106  9.000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3156  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  56.12 
 
 		 135 aa  105  2e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.247179  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4334  4Fe-4S ferredoxin  50.55 
 
 		 111 aa  105  3e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.833828  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2625  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  54.64 
 
 		 135 aa  97.4  5e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0538354  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2580  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  54.64 
 
 		 135 aa  97.4  5e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0547  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  49.48 
 
 		 107 aa  95.5  2e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2619  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  53.61 
 
 		 135 aa  95.9  2e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4871  putative ferrodoxin  44.86 
 
 		 106 aa  93.2  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.419636  normal  0.314956 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3084  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  45.87 
 
 		 133 aa  87  7e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0358039 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0380  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  52.83 
 
 		 71 aa  55.5  0.0000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3090  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  33.33 
 
 		 110 aa  50.1  0.00001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1840  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  35.71 
 
 		 110 aa  49.7  0.00001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0034  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  38.6 
 
 		 517 aa  46.6  0.0001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1601  hydrogenase, Fe-only  31.82 
 
 		 582 aa  45.8  0.0002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0574  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  42 
 
 		 62 aa  45.1  0.0003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.208407  normal  0.175405 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3090  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  35.14 
 
 		 97 aa  45.4  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1441  ferredoxin family protein  41.07 
 
 		 94 aa  44.3  0.0005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0722291  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0454  photosystem I subunit VII  40.68 
 
 		 81 aa  42.7  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.11246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0236  hydrogenase, Fe-only  32.35 
 
 		 586 aa  43.1  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.660897  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0171  photosystem I subunit VII  38.98 
 
 		 99 aa  43.1  0.001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0535  photosystem I subunit VII  38.98 
 
 		 81 aa  43.1  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.966086  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0087  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  39.22 
 
 		 114 aa  43.1  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.803989  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26051  photosystem I subunit VII  38.98 
 
 		 81 aa  43.5  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2170  ferredoxin  32.89 
 
 		 107 aa  42.4  0.002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1428  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  45.83 
 
 		 61 aa  42.4  0.002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1344  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  42 
 
 		 62 aa  42.7  0.002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0127  photosystem I subunit VII  38.98 
 
 		 91 aa  42.4  0.002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.409793  hitchhiker  0.00279555 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0625  nitroreductase  38.96 
 
 		 279 aa  42.7  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0497203  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0077  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  31.71 
 
 		 112 aa  42.4  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.278987  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0264  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  42 
 
 		 62 aa  42.7  0.002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18001  photosystem I subunit VII  38.98 
 
 		 81 aa  42.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0085  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  36.21 
 
 		 840 aa  42.7  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17951  photosystem I subunit VII  38.98 
 
 		 81 aa  42.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.028019  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18171  photosystem I subunit VII  38.98 
 
 		 81 aa  42.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.102176  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2082  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  32.89 
 
 		 107 aa  42.4  0.002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3887  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  26.67 
 
 		 291 aa  42.7  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.367781 
 
 
-
 
NC_003296  RS01900  ferredoxin protein  32.26 
 
 		 112 aa  42.7  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.460726  normal  0.203128 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3538  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  30.59 
 
 		 112 aa  42  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.286368 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4480  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  32.26 
 
 		 112 aa  42  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.123207 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4614  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  32.26 
 
 		 112 aa  42  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0640  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  40 
 
 		 62 aa  42  0.003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.612108  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0279  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  28 
 
 		 112 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.16218 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1486  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  33.33 
 
 		 107 aa  41.6  0.003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7544  ferredoxin II  27.78 
 
 		 112 aa  42  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.147446  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0875  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  39.62 
 
 		 102 aa  41.2  0.004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0631978  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1741  photosystem I subunit VII  38.98 
 
 		 81 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.518947 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0055  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  35.09 
 
 		 515 aa  41.2  0.004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1658  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  37.29 
 
 		 107 aa  41.6  0.004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0957  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  28.24 
 
 		 500 aa  41.6  0.004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.653223  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0184  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  32.14 
 
 		 112 aa  41.6  0.004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0840878  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0123  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  26.42 
 
 		 112 aa  41.2  0.005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1128  glutamate synthase, alpha subunit, putative  25.3 
 
 		 500 aa  41.2  0.005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.147695  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_946  glutamate synthase-like protein, gltB-like fragment  25.3 
 
 		 500 aa  41.2  0.005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3920  periplasmic Fe hydrogenase, large subunit  36 
 
 		 410 aa  41.2  0.005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3250  hydrogenases, Fe-only  36 
 
 		 410 aa  41.2  0.005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.644479  hitchhiker  0.0000163586 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1224  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  36.36 
 
 		 118 aa  40.8  0.006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.910611 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1965  Fe-S-cluster-containing hydrogenase components 1-like  35.09 
 
 		 517 aa  40.8  0.006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0255  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  28.72 
 
 		 110 aa  40.8  0.007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1278  photosystem I subunit VII  35.48 
 
 		 81 aa  40.4  0.007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1307  photosystem I subunit VII  35.48 
 
 		 81 aa  40.4  0.007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1826  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  32.94 
 
 		 112 aa  40.8  0.007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.0000171361  normal  0.337326 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2364  protein of unknown function DUF362  30.91 
 
 		 376 aa  40.4  0.008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4509  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  29.9 
 
 		 404 aa  40.4  0.008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000389854 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4980  photosystem I subunit VII  37.29 
 
 		 81 aa  40.4  0.009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.688925 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17321  photosystem I subunit VII  37.29 
 
 		 81 aa  40.4  0.009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2202  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  37.74 
 
 		 118 aa  40.4  0.009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.18705  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20591  photosystem I subunit VII  37.29 
 
 		 81 aa  40.4  0.009  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.594482  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1700  photosystem I subunit VII  37.29 
 
 		 81 aa  40.4  0.009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1184  photosystem I subunit VII  37.29 
 
 		 81 aa  40.4  0.009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  hitchhiker  0.00269057  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3630  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  33.87 
 
 		 133 aa  40  0.01  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>