More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_4509 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_4509  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  100 
 
 		 404 aa  796    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000389854 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4148  iron-sulfur cluster-binding protein  68.66 
 
 		 291 aa  376  1e-103  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3887  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  70.88 
 
 		 291 aa  366  1e-100  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.367781 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2121  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  59.77 
 
 		 335 aa  204  2e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.412453  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2400  NADH:ubiquinone oxidoreductase, subunit RnfB  71.11 
 
 		 206 aa  200  3.9999999999999996e-50  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.942423 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2966  electron transport complex protein RnfB  70.54 
 
 		 188 aa  196  5.000000000000001e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0244352  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1639  electron transport complex protein RnfB  75 
 
 		 188 aa  196  8.000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2198  electron transport complex protein RnfB  66.18 
 
 		 189 aa  195  1e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.401389  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18930  electron transport complex protein RnfB  72.66 
 
 		 188 aa  195  1e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000143693  normal  0.123767 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1403  electron transport complex protein RnfB  72.58 
 
 		 191 aa  194  2e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.466807  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2940  hypothetical protein  48.18 
 
 		 204 aa  192  7e-48  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1544  electron transport complex protein RnfB  70.87 
 
 		 198 aa  192  1e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00831464 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02730  electron transport complex protein RnfB  68.46 
 
 		 193 aa  191  2e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000653403  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2794  hypothetical protein  47.73 
 
 		 204 aa  188  1e-46  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2354  electron transport complex protein RnfB  65.12 
 
 		 189 aa  188  2e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.720002  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1864  electron transport complex protein RnfB  64.34 
 
 		 205 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.164914  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0937  electron transport complex protein RnfB  69.29 
 
 		 192 aa  183  5.0000000000000004e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.556541  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1831  electron transport complex protein RnfB  64.34 
 
 		 189 aa  182  7e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.101638  normal  0.0584321 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2067  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  65.12 
 
 		 189 aa  182  9.000000000000001e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0305749  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2043  electron transport complex protein RnfB  65.12 
 
 		 189 aa  182  9.000000000000001e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0243874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2557  electron transport complex protein RnfB  64.34 
 
 		 189 aa  181  2e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.229137  normal  0.143119 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2111  electron transport complex protein RnfB  62.02 
 
 		 204 aa  181  2e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0389991  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2274  electron transport complex protein RnfB  62.02 
 
 		 204 aa  181  2e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000478609  normal  0.512145 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2064  electron transport complex protein RnfB  62.02 
 
 		 204 aa  181  2e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000222941  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002948  electron transport complex protein RnfB  64.34 
 
 		 198 aa  181  2.9999999999999997e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00169587  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2509  electron transport complex protein RnfB  62.02 
 
 		 193 aa  181  2.9999999999999997e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02965  electron transport complex protein RnfB  63.57 
 
 		 197 aa  180  2.9999999999999997e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2065  electron transport complex protein RnfB  62.02 
 
 		 193 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000637231  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2173  electron transport complex protein RnfB  63.57 
 
 		 193 aa  181  2.9999999999999997e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0287954  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1006  ferredoxin  48.12 
 
 		 268 aa  180  4e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.235991  normal  0.110987 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2240  electron transport complex protein RnfB  63.91 
 
 		 190 aa  180  4e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000443884 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4546  electron transport complex protein RnfB  62.02 
 
 		 199 aa  180  4e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1910  electron transport complex protein RnfB  62.02 
 
 		 193 aa  180  4e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000153045  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2169  electron transport complex protein RnfB  62.02 
 
 		 193 aa  180  4e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000157134  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2260  electron transport complex protein RnfB  62.02 
 
 		 199 aa  180  4e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000168907  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1849  electron transport complex protein RnfB  60.47 
 
 		 199 aa  179  9e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000101519  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0537  electron transport complex protein RnfB  62.79 
 
 		 195 aa  178  1e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.05126  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0737  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  61.65 
 
 		 184 aa  178  1e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.258045  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2705  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  45.56 
 
 		 259 aa  177  3e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1871  electron transport complex protein RnfB  57.53 
 
 		 194 aa  176  5e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00186515  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0872  ferredoxin  49.35 
 
 		 276 aa  176  7e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.349751 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2007  electron transport complex protein RnfB  61.36 
 
 		 207 aa  176  8e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1895  electron transport complex protein RnfB  61.36 
 
 		 207 aa  176  8e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2253  electron transport complex protein RnfB  61.36 
 
 		 188 aa  175  9.999999999999999e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0146582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0307  electron transport complex protein  44.64 
 
 		 213 aa  174  1.9999999999999998e-42  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2016  electron transport complex protein RnfB  64.89 
 
 		 188 aa  175  1.9999999999999998e-42  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19260  electron transport complex protein RnfB  70.87 
 
 		 187 aa  174  1.9999999999999998e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.772376  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0937  ferredoxin  48.7 
 
 		 276 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0647122 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1884  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  44.64 
 
 		 213 aa  174  1.9999999999999998e-42  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2894  electron transport complex protein RnfB  63.77 
 
 		 178 aa  173  5e-42  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0850  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  44.74 
 
 		 216 aa  173  5e-42  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.223684  normal  0.0952897 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0994  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  44.74 
 
 		 216 aa  173  5e-42  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0262542  normal  0.103074 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1786  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  65.19 
 
 		 192 aa  172  5.999999999999999e-42  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19250  electron transport complex protein RnfC  37.17 
 
 		 688 aa  172  1e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1015  ferredoxin  49.13 
 
 		 279 aa  171  2e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0219422  normal  0.72194 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2928  ferredoxin  62.5 
 
 		 137 aa  171  3e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.314785  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1047  ferredoxin  46.58 
 
 		 248 aa  170  5e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1754  ferredoxin  63.64 
 
 		 139 aa  169  9e-41  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5668  ferredoxin  57.23 
 
 		 334 aa  168  1e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1714  ferredoxin  55.28 
 
 		 342 aa  169  1e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.283033  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2349  ferredoxin  55.28 
 
 		 306 aa  168  1e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.108055 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1680  ferredoxin  63.64 
 
 		 139 aa  169  1e-40  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2326  ferredoxin  55.28 
 
 		 342 aa  169  1e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2365  ferredoxin  56.6 
 
 		 339 aa  168  2e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2245  ferredoxin  56.6 
 
 		 341 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.666336 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2155  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  60.31 
 
 		 196 aa  167  2.9999999999999998e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3233  electron transport complex protein RnfB  64.89 
 
 		 183 aa  166  5e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01788  ferredoxin  62.31 
 
 		 142 aa  166  8e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0102822  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0951  ferredoxin  55.97 
 
 		 320 aa  166  8e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.143394  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1236  ferredoxin  60.61 
 
 		 279 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.41049 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2024  electron transport complex protein RnfB  57.58 
 
 		 192 aa  164  3e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3310  ferredoxin  55.35 
 
 		 279 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1174  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  63.08 
 
 		 209 aa  162  1e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2627  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  61.65 
 
 		 186 aa  161  2e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1791  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  61.65 
 
 		 194 aa  161  2e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.445554  hitchhiker  0.00820964 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2324  electron transport complex protein RnfB  56.06 
 
 		 192 aa  161  2e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2096  ferredoxin  55.84 
 
 		 291 aa  161  2e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.12693 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1917  electron transport complex protein RnfB  53.16 
 
 		 191 aa  160  4e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0815  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  64.89 
 
 		 186 aa  160  5e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.783937 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0464  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  45.15 
 
 		 228 aa  159  6e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0463817  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1060  electron transport complex protein RnfB  57.94 
 
 		 196 aa  159  1e-37  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1176  ferredoxin  60.15 
 
 		 290 aa  158  2e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1930  ferredoxin  60.15 
 
 		 316 aa  157  3e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1337  ferredoxin  60.15 
 
 		 316 aa  157  3e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1184  ferredoxin  60.15 
 
 		 290 aa  156  6e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.403048  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1162  electron transport complex protein RnfB  59.54 
 
 		 180 aa  156  6e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0306  ferredoxin  60.15 
 
 		 290 aa  156  6e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0842  ferredoxin  60.15 
 
 		 290 aa  156  6e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.736914  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1023  ferredoxin  60.15 
 
 		 290 aa  156  6e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3619  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  53.37 
 
 		 238 aa  156  8e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0111565  normal  0.0672308 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1887  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  48.89 
 
 		 212 aa  155  9e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1820  electron transport complex protein RnfB  55.3 
 
 		 192 aa  155  1e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00173992 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0971  ferredoxin  59.09 
 
 		 282 aa  155  2e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.552455  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2064  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  48.89 
 
 		 217 aa  155  2e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.295108 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2013  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  52.03 
 
 		 192 aa  154  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000144398  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2340  electron transport complex protein RnfB  55.3 
 
 		 192 aa  154  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.297329  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1704  electron transport complex protein RnfB  52.03 
 
 		 192 aa  154  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0578538  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1716  electron transport complex protein RnfB  55.3 
 
 		 192 aa  154  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.270473  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01588  hypothetical protein  52.03 
 
 		 192 aa  154  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00124747  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2001  electron transport complex protein RnfB  52.03 
 
 		 192 aa  154  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.0000498524  normal  0.338717 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>