More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_2373 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_2373  lipoyl synthase  100 
 
 
348 aa  720    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1552  lipoyl synthase  77.58 
 
 
368 aa  550  1e-155  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3791  lipoyl synthase  76.99 
 
 
350 aa  545  1e-154  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0810  lipoyl synthase  66.36 
 
 
329 aa  449  1e-125  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0781  lipoyl synthase  66.98 
 
 
329 aa  450  1e-125  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1586  lipoyl synthase  68.94 
 
 
331 aa  448  1e-125  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.426522  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0116  lipoyl synthase  64.63 
 
 
334 aa  427  1e-119  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1771  lipoic acid synthetase  69.18 
 
 
324 aa  409  1e-113  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0949549  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0833  lipoic acid synthetase  66.08 
 
 
335 aa  403  1e-111  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1742  lipoyl synthase  61.79 
 
 
328 aa  383  1e-105  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0397139 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1828  lipoyl synthase  55.79 
 
 
326 aa  327  2.0000000000000001e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1992  lipoyl synthase  56.14 
 
 
294 aa  325  9e-88  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2102  lipoyl synthase  55.44 
 
 
326 aa  324  1e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2032  lipoyl synthase  55.44 
 
 
326 aa  325  1e-87  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86231  Lipoic acid synthetase, mitochondrial precursor (Lip-syn) (Lipoate synthase)  52.43 
 
 
398 aa  313  1.9999999999999998e-84  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31232  predicted protein  54.86 
 
 
324 aa  313  2.9999999999999996e-84  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0267092  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2548  lipoyl synthase  56 
 
 
321 aa  311  1e-83  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0392  lipoyl synthase  51.06 
 
 
287 aa  310  2e-83  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0537  lipoyl synthase  49.3 
 
 
299 aa  310  2e-83  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.587235  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_28652  predicted protein  52.76 
 
 
314 aa  310  2e-83  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.105937  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0490  lipoyl synthase  49.65 
 
 
297 aa  308  9e-83  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0672  lipoyl synthase  53.12 
 
 
308 aa  308  9e-83  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.61797  normal  0.208975 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_09486  lipoic acid synthetase precursor (AFU_orthologue; AFUA_3G06560)  50.34 
 
 
413 aa  306  3e-82  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.588005 
 
 
-
 
NC_006681  CNL04340  conserved hypothetical protein  52.72 
 
 
395 aa  305  6e-82  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1757  lipoyl synthase  52.48 
 
 
308 aa  303  4.0000000000000003e-81  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.43043  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32294  predicted protein  52.43 
 
 
399 aa  302  5.000000000000001e-81  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18029  predicted protein  50.51 
 
 
401 aa  301  1e-80  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.187612  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1406  lipoyl synthase  51.79 
 
 
291 aa  300  3e-80  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0645546 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2906  lipoyl synthase  51.8 
 
 
298 aa  297  2e-79  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3136  lipoyl synthase  50.35 
 
 
321 aa  296  4e-79  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.732613 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3051  lipoyl synthase  51.8 
 
 
298 aa  296  5e-79  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1877  lipoyl synthase  50.71 
 
 
314 aa  295  1e-78  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.329271  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3568  lipoyl synthase  49.47 
 
 
298 aa  294  2e-78  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4149  lipoic acid synthetase  51.06 
 
 
311 aa  293  3e-78  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5116  lipoyl synthase  49.12 
 
 
298 aa  291  1e-77  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00190183  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0554  lipoyl synthase  46.63 
 
 
373 aa  290  2e-77  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.86018  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4796  lipoyl synthase  49.12 
 
 
298 aa  290  2e-77  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000356063  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4840  lipoyl synthase  48.77 
 
 
298 aa  290  2e-77  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000478803  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4682  lipoyl synthase  48.77 
 
 
298 aa  290  2e-77  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000492626  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1184  lipoyl synthase  50.87 
 
 
296 aa  290  2e-77  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0667385  normal  0.0581993 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5205  lipoyl synthase  48.77 
 
 
298 aa  290  2e-77  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.745622  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5076  lipoyl synthase  48.77 
 
 
298 aa  290  2e-77  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1779  lipoyl synthase  48.01 
 
 
299 aa  291  2e-77  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0124  lipoyl synthase  48.77 
 
 
298 aa  290  2e-77  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00208739  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2751  lipoyl synthase  50 
 
 
351 aa  290  2e-77  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.237631  normal  0.0114913 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5109  lipoyl synthase  48.77 
 
 
298 aa  290  3e-77  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4698  lipoyl synthase  48.77 
 
 
298 aa  290  3e-77  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000012904  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5114  lipoyl synthase  48.77 
 
 
298 aa  290  3e-77  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000010765  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1029  lipoyl synthase  53.43 
 
 
314 aa  289  4e-77  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0511  lipoyl synthase  50.53 
 
 
304 aa  289  5.0000000000000004e-77  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2833  lipoic acid synthetase  51.26 
 
 
303 aa  289  6e-77  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0096  lipoic acid synthetase  51.26 
 
 
303 aa  289  6e-77  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2080  lipoyl synthase  50.72 
 
 
298 aa  289  6e-77  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.111304  normal  0.264728 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0513  lipoyl synthase  49.11 
 
 
292 aa  288  8e-77  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.170423  normal  0.0962099 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07861  lipoyl synthase  47.29 
 
 
290 aa  288  9e-77  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2195  lipoic acid synthetase  52.52 
 
 
328 aa  288  1e-76  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0923  lipoyl synthase  49.47 
 
 
305 aa  287  1e-76  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.263103  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0942  lipoyl synthase  49.47 
 
 
305 aa  287  1e-76  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0599  lipoyl synthase  46.32 
 
 
373 aa  287  2e-76  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0992056  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2696  lipoyl synthase  50.53 
 
 
320 aa  287  2e-76  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1921  lipoyl synthase  48.58 
 
 
310 aa  287  2e-76  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0537683  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2099  lipoyl synthase  49.47 
 
 
312 aa  286  5e-76  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.350407  normal  0.100135 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0227  lipoyl synthase  47.29 
 
 
288 aa  285  5.999999999999999e-76  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.336471  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4375  lipoyl synthase  50.18 
 
 
307 aa  285  9e-76  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.492179 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1575  lipoyl synthase  49.1 
 
 
290 aa  285  1.0000000000000001e-75  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00830336  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2629  lipoyl synthase  51.43 
 
 
324 aa  285  1.0000000000000001e-75  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3599  lipoic acid synthetase  49.31 
 
 
320 aa  284  2.0000000000000002e-75  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5917  lipoyl synthase  51.2 
 
 
328 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2226  lipoyl synthase  48.04 
 
 
315 aa  283  4.0000000000000003e-75  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0487133  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2065  lipoyl synthase  49.65 
 
 
321 aa  283  4.0000000000000003e-75  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0165  lipoyl synthase  49.29 
 
 
329 aa  283  4.0000000000000003e-75  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0827434  hitchhiker  0.00380091 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1669  lipoic acid synthetase  48.26 
 
 
321 aa  282  5.000000000000001e-75  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0899  lipoic acid synthetase  51.12 
 
 
285 aa  282  6.000000000000001e-75  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0523  lipoyl synthase  49.29 
 
 
325 aa  282  6.000000000000001e-75  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0346  lipoyl synthase  49.83 
 
 
309 aa  282  6.000000000000001e-75  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2123  lipoyl synthase  50.36 
 
 
323 aa  281  8.000000000000001e-75  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.669561  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1252  lipoyl synthase  47.93 
 
 
328 aa  281  9e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0893  lipoyl synthase  48.19 
 
 
298 aa  281  1e-74  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000403544  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1351  lipoyl synthase  50.36 
 
 
315 aa  281  1e-74  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.264104  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1414  lipoyl synthase  50.36 
 
 
315 aa  281  1e-74  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00276409  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23551  lipoyl synthase  47.72 
 
 
294 aa  281  1e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.225624 
 
 
-
 
NC_002950  PG0504  lipoyl synthase  48.92 
 
 
282 aa  280  2e-74  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.354667 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1092  lipoyl synthase  48.45 
 
 
312 aa  281  2e-74  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00219878  hitchhiker  0.00000000000266656 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01649  lipoyl synthase  47.06 
 
 
320 aa  280  2e-74  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00769873  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1624  lipoyl synthase  49.3 
 
 
322 aa  281  2e-74  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.686327  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04289  lipoyl synthase  48.32 
 
 
327 aa  280  2e-74  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2841  lipoyl synthase  42.9 
 
 
319 aa  280  3e-74  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.176893  hitchhiker  0.000447826 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2501  lipoyl synthase  47.84 
 
 
325 aa  280  3e-74  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.698153  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1966  lipoic acid synthetase  47.67 
 
 
318 aa  280  4e-74  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.523068  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3334  lipoyl synthase  45.69 
 
 
355 aa  280  4e-74  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.117478  hitchhiker  0.00889782 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3442  lipoyl synthase  47.97 
 
 
336 aa  279  6e-74  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.725492  normal  0.582796 
 
 
-
 
NC_004310  BR1124  lipoyl synthase  48.23 
 
 
322 aa  278  7e-74  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0467  lipoyl synthase  47.55 
 
 
321 aa  278  1e-73  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00091244  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0899  lipoyl synthase  46.26 
 
 
347 aa  278  1e-73  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.322339 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1371  lipoyl synthase  47.35 
 
 
330 aa  278  1e-73  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.113855  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2199  lipoic acid synthetase  48.49 
 
 
304 aa  277  2e-73  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.842595  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004228  lipoate synthase  45.45 
 
 
321 aa  277  2e-73  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000803554  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1509  lipoyl synthase  46.85 
 
 
325 aa  277  2e-73  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.499062  normal  0.4257 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1263  lipoic acid synthetase  48.77 
 
 
337 aa  277  2e-73  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.330421  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0322  lipoyl synthase  47.7 
 
 
296 aa  277  2e-73  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>