More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCAP_0637 on replicon NC_007633
Organism: Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006055  Mfl583  DNA polymerase III alpha subunit  49.2 
 
 		 992 aa  894    Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0637  DNA-directed DNA polymerase III (polc)  100 
 
 		 986 aa  1949    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0459907  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1266  DNA polymerase III, alpha subunit  34.58 
 
 		 1065 aa  546  1e-154  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.502736  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0460  DNA polymerase III DnaE  37.1 
 
 		 969 aa  545  1e-153  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1759  DNA polymerase III, alpha subunit  34.18 
 
 		 1065 aa  533  1e-150  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.463991  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4498  DNA polymerase III DnaE  33.89 
 
 		 1108 aa  533  1e-150  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0750  DNA polymerase III catalytic subunit, DnaE type  32.97 
 
 		 1115 aa  533  1e-150  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1793  DNA polymerase III, alpha subunit  34.18 
 
 		 1065 aa  533  1e-150  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4849  DNA polymerase III DnaE  33.89 
 
 		 1108 aa  533  1e-150  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4719  DNA polymerase III DnaE  33.89 
 
 		 1108 aa  534  1e-150  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4730  DNA polymerase III DnaE  34.19 
 
 		 1108 aa  534  1e-150  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3288  DNA polymerase III DnaE  32.62 
 
 		 1109 aa  532  1e-149  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4735  DNA polymerase III DnaE  33.7 
 
 		 1108 aa  530  1e-149  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4333  DNA polymerase III DnaE  33.89 
 
 		 1108 aa  531  1e-149  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4345  DNA polymerase III DnaE  33.7 
 
 		 1108 aa  530  1e-149  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4714  DNA polymerase III DnaE  33.1 
 
 		 1108 aa  528  1e-148  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4434  DNA polymerase III DnaE  33.3 
 
 		 1110 aa  526  1e-148  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0523  DNA polymerase III DnaE  33.2 
 
 		 1108 aa  527  1e-148  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0880  DNA polymerase III, alpha subunit  33.05 
 
 		 1038 aa  526  1e-148  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.191787  hitchhiker  0.00000000000153929 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0549  DNA polymerase III catalytic subunit, DnaE type  33.05 
 
 		 1134 aa  515  1e-144  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0774  DNA polymerase III catalytic subunit, DnaE type  33.99 
 
 		 1112 aa  512  1e-143  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2068  DNA polymerase III, alpha subunit  32.07 
 
 		 1184 aa  512  1e-143  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00797778  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1391  DNA polymerase III, alpha subunit  33.72 
 
 		 1127 aa  508  9.999999999999999e-143  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0773  DNA polymerase III, alpha subunit  28.81 
 
 		 1092 aa  508  9.999999999999999e-143  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1264  DNA polymerase III DnaE  32.56 
 
 		 1181 aa  509  9.999999999999999e-143  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.756254  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1262  DNA polymerase III DnaE  32.17 
 
 		 1139 aa  508  9.999999999999999e-143  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.842621  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2690  DNA polymerase III, alpha subunit  32.59 
 
 		 1104 aa  500  1e-140  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1225  DNA polymerase III, alpha subunit  30.94 
 
 		 1164 aa  498  1e-139  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.344496  normal  0.610841 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf612  DNA polymerase III subunit alpha  34.85 
 
 		 999 aa  495  9.999999999999999e-139  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.415572  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1401  DNA polymerase III, alpha subunit  31.57 
 
 		 1155 aa  488  1e-136  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.67909  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1233  DNA polymerase III, alpha subunit  30.53 
 
 		 1160 aa  487  1e-136  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2507  DNA polymerase III, alpha subunit  31.1 
 
 		 1157 aa  487  1e-136  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00161108  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0831  DNA polymerase III, alpha subunit  30.73 
 
 		 1132 aa  488  1e-136  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1872  DNA polymerase III DnaE  30.33 
 
 		 1156 aa  483  1e-135  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1459  DNA polymerase III DnaE  32.43 
 
 		 1159 aa  481  1e-134  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00150549  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1169  DNA polymerase III, alpha subunit  30.01 
 
 		 1155 aa  479  1e-134  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.34494e-16 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3092  DNA polymerase III, alpha subunit  29.61 
 
 		 1156 aa  481  1e-134  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00110918  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0434  DNA polymerase III, alpha subunit  30.07 
 
 		 1139 aa  478  1e-133  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2723  DNA polymerase III, alpha subunit  30.98 
 
 		 1179 aa  478  1e-133  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1715  DNA polymerase III, alpha subunit  30.61 
 
 		 1175 aa  477  1e-133  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.49916  normal  0.677237 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1215  DNA polymerase III, alpha subunit  30.38 
 
 		 1155 aa  476  1e-132  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000331804  hitchhiker  0.00000568126 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1192  DNA polymerase III DnaE  31.95 
 
 		 1145 aa  476  1e-132  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1000  DNA polymerase III, alpha subunit  33.77 
 
 		 960 aa  473  1e-132  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2043  DNA polymerase III DnaE  31.11 
 
 		 1130 aa  471  1.0000000000000001e-131  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1396  DNA polymerase III, alpha subunit  30.14 
 
 		 1159 aa  469  9.999999999999999e-131  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.253021  normal  0.727837 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1222  DNA polymerase III, alpha subunit  30.41 
 
 		 1156 aa  466  9.999999999999999e-131  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0096  DNA polymerase III, alpha subunit  30.8 
 
 		 1151 aa  469  9.999999999999999e-131  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.810427  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0130  DNA polymerase III, alpha subunit  30.37 
 
 		 1173 aa  468  9.999999999999999e-131  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.103911 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1050  DNA polymerase III, alpha subunit  28.31 
 
 		 1075 aa  469  9.999999999999999e-131  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.558692  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2319  DNA polymerase III DnaE  30.1 
 
 		 1225 aa  466  1e-129  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.511943  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2196  DNA polymerase III, alpha subunit  29.71 
 
 		 1165 aa  464  1e-129  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0335  DNA polymerase III DnaE  30.49 
 
 		 1186 aa  463  1e-129  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2126  DNA polymerase III subunit alpha  34.05 
 
 		 1257 aa  464  1e-129  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.794686  normal  0.520943 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1161  DNA polymerase III subunit alpha  29.95 
 
 		 1174 aa  464  1e-129  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0775975  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0809  DNA polymerase III DnaE  29.98 
 
 		 1145 aa  463  1e-129  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000123157  decreased coverage  0.00151258 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0632  DNA polymerase III, alpha subunit  31.67 
 
 		 1165 aa  462  9.999999999999999e-129  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1742  DNA polymerase III subunit alpha  29.14 
 
 		 1179 aa  461  9.999999999999999e-129  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.209003  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1606  DNA polymerase III subunit alpha  29.21 
 
 		 1174 aa  458  1e-127  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4171  DNA polymerase III subunit alpha  29.31 
 
 		 1174 aa  459  1e-127  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1096  DNA polymerase III catalytic subunit, DnaE type  27.48 
 
 		 1165 aa  456  1e-127  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.35277  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03140  DNA polymerase III catalytic subunit, DnaE type  32.28 
 
 		 1122 aa  456  1.0000000000000001e-126  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.677635  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1885  DNA polymerase III, alpha subunit  30.12 
 
 		 1182 aa  456  1.0000000000000001e-126  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1747  DNA polymerase III, alpha subunit  31.9 
 
 		 1122 aa  455  1.0000000000000001e-126  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4067  DNA polymerase III subunit alpha  29.21 
 
 		 1174 aa  451  1e-125  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00239215 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0519  DNA polymerase III DnaE  31.24 
 
 		 1070 aa  452  1e-125  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0675  DNA polymerase III, alpha subunit  31.23 
 
 		 1148 aa  446  1.0000000000000001e-124  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0921  DNA polymerase III subunit alpha  34.33 
 
 		 1165 aa  449  1.0000000000000001e-124  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.148077  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1255  DNA polymerase III subunit alpha  35.24 
 
 		 1172 aa  446  1.0000000000000001e-124  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1499  DNA polymerase III subunit alpha  28.65 
 
 		 1185 aa  444  1e-123  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1177  DNA polymerase III, alpha subunit  28.05 
 
 		 1167 aa  446  1e-123  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.906306  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1375  DNA polymerase III subunit alpha  35.21 
 
 		 1165 aa  443  1e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1461  DNA polymerase III, alpha subunit  28.05 
 
 		 1166 aa  446  1e-123  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17260  DNA polymerase III subunit alpha  29.01 
 
 		 1173 aa  445  1e-123  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1165  DNA polymerase III DnaE  31.43 
 
 		 1036 aa  444  1e-123  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1106  DNA polymerase III subunit alpha  30.2 
 
 		 1173 aa  441  9.999999999999999e-123  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1489  DNA polymerase III, alpha subunit  29.28 
 
 		 1143 aa  439  9.999999999999999e-123  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0842  DNA polymerase III, alpha subunit  34.01 
 
 		 1262 aa  442  9.999999999999999e-123  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.888931  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1612  DNA polymerase III, alpha subunit  31.75 
 
 		 1201 aa  442  9.999999999999999e-123  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00506055  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1283  DNA polymerase III subunit alpha  34.74 
 
 		 1165 aa  441  9.999999999999999e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.197401  normal  0.0648697 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1238  DNA polymerase III subunit alpha  31.35 
 
 		 1331 aa  441  9.999999999999999e-123  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0916  DNA polymerase III subunit alpha  29.36 
 
 		 1162 aa  441  9.999999999999999e-123  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0825  DNA polymerase III subunit alpha  34.49 
 
 		 1163 aa  436  1e-121  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38840  DNA polymerase III subunit alpha  28.56 
 
 		 1176 aa  437  1e-121  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0036  DNA polymerase III, alpha subunit  31.13 
 
 		 1240 aa  438  1e-121  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3038  DNA polymerase III subunit alpha  28.38 
 
 		 1176 aa  437  1e-121  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.117325 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06991  DNA polymerase III subunit alpha  30.49 
 
 		 1171 aa  437  1e-121  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.232183 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0578  DNA polymerase III subunit alpha  28.21 
 
 		 1168 aa  439  1e-121  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0632  DNA polymerase III, alpha subunit  29.49 
 
 		 1182 aa  437  1e-121  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.836983  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1426  DNA polymerase III alpha subunit  29.19 
 
 		 1143 aa  439  1e-121  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3593  DNA polymerase III, alpha subunit  28.24 
 
 		 1210 aa  436  1e-120  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1549  DNA polymerase III, alpha subunit  28.52 
 
 		 1173 aa  435  1e-120  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1358  DNA polymerase III subunit alpha  28.58 
 
 		 1173 aa  433  1e-120  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0846  DNA polymerase III, alpha subunit  29.62 
 
 		 1158 aa  436  1e-120  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0819  DNA polymerase III subunit alpha  34.49 
 
 		 1163 aa  436  1e-120  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4061  DNA polymerase III, alpha subunit  28.77 
 
 		 1174 aa  435  1e-120  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.496247  normal  0.0397833 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2402  DNA polymerase III subunit alpha  34.99 
 
 		 1163 aa  436  1e-120  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3525  DNA polymerase III, alpha subunit  28.24 
 
 		 1210 aa  436  1e-120  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0939  DNA polymerase III DnaE  32.43 
 
 		 1034 aa  432  1e-119  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1116  DNA polymerase III subunit alpha  28.76 
 
 		 1173 aa  432  1e-119  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1762  DNA polymerase III subunit alpha  31.2 
 
 		 1156 aa  431  1e-119  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.402462  normal  0.434108 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>