207 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MARTH_orf801 on replicon NC_011025
Organism: Mycoplasma arthritidis 158L3-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011025  MARTH_orf801  conserved hypothetical membrane protein LemA  100 
 
 
218 aa  446  1.0000000000000001e-124  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0332  LemA family  39.01 
 
 
219 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3652  LemA family protein  30.65 
 
 
189 aa  84.3  0.000000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0033  LemA family protein  36.76 
 
 
189 aa  81.6  0.000000000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2848  LemA family protein  37.04 
 
 
188 aa  79.7  0.00000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0119025  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0999  LemA family protein  32.5 
 
 
194 aa  77  0.0000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1566  LemA family protein  29.38 
 
 
183 aa  73.6  0.000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3560  hypothetical protein  30.56 
 
 
189 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0276  LemA family protein  31.98 
 
 
187 aa  72.8  0.000000000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1831  LemA family protein  34.44 
 
 
187 aa  72.8  0.000000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00691191  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0157  LemA family protein  28.18 
 
 
189 aa  72.8  0.000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1788  LemA family protein  34.44 
 
 
208 aa  72.4  0.000000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000175947  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0344  hypothetical protein  28.12 
 
 
186 aa  72  0.000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.571878  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4056  LemA family protein  29.03 
 
 
189 aa  72  0.000000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0076  hypothetical protein  33.33 
 
 
185 aa  72  0.000000000007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.071632  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0283  LemA family protein  30.29 
 
 
192 aa  71.2  0.00000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.646513  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2124  LemA family protein  27.07 
 
 
185 aa  70.5  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4662  hypothetical protein  28.34 
 
 
188 aa  68.9  0.00000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1702  LemA protein  26.83 
 
 
187 aa  68.6  0.00000000007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.159811  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0137  LemA family protein  27.47 
 
 
189 aa  68.6  0.00000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12740  hypothetical protein  32.87 
 
 
186 aa  68.2  0.00000000009  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.250221  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4246  LemA family protein  28.34 
 
 
188 aa  68.2  0.00000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4207  LemA family protein  28.34 
 
 
188 aa  68.2  0.00000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4380  LemA family protein  28.34 
 
 
188 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1794  LemA family protein  29.11 
 
 
194 aa  67.4  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0347089 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1210  LemA family protein  27.98 
 
 
187 aa  66.6  0.0000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0634  LemA protein  25.61 
 
 
187 aa  67  0.0000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1371  hypothetical protein  30.86 
 
 
194 aa  66.6  0.0000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000117075  hitchhiker  0.000133503 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3528  LemA-like protein  31.74 
 
 
187 aa  65.9  0.0000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.555314 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3832  LemA family protein  27.27 
 
 
188 aa  65.5  0.0000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.911812 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3925  LemA family protein  27.27 
 
 
188 aa  65.5  0.0000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4041  LemA family protein  27.27 
 
 
188 aa  65.5  0.0000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1477  LemA family protein  32.26 
 
 
194 aa  65.5  0.0000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2258  LemA family protein  26.4 
 
 
181 aa  65.5  0.0000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4336  LemA family protein  26.88 
 
 
193 aa  65.1  0.0000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.54593 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0241  LemA family protein  29.45 
 
 
189 aa  65.1  0.0000000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3454  LemA family protein  33.33 
 
 
197 aa  65.1  0.0000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.23113  normal  0.0915562 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0874  LemA family protein  28.88 
 
 
185 aa  64.3  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0938199  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0089  hypothetical protein  26.2 
 
 
188 aa  63.9  0.000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1739  LemA family protein  27.44 
 
 
187 aa  62.8  0.000000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.572678  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25170  hypothetical protein  28.22 
 
 
197 aa  62.4  0.000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0090  LemA family protein  28.57 
 
 
184 aa  62.4  0.000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0575  LemA family protein  31.49 
 
 
183 aa  62.4  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.736042 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2423  LemA family protein  31.91 
 
 
194 aa  62  0.000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.903049  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0532  LemA family protein  32.07 
 
 
183 aa  62  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.258841 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2260  LemA family protein  25.97 
 
 
180 aa  62  0.000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000506129 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1185  hypothetical protein  28.48 
 
 
185 aa  62  0.000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0911033  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06990  hypothetical protein  33.59 
 
 
202 aa  61.6  0.000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4520  LemA family protein  32.53 
 
 
188 aa  61.6  0.000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.15394  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0640  hypothetical protein  33.59 
 
 
202 aa  61.6  0.000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0955  LemA family protein  25.27 
 
 
202 aa  61.2  0.00000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0548  hypothetical protein  28.18 
 
 
189 aa  61.2  0.00000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  6.49212e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3704  LemA protein  26.06 
 
 
192 aa  60.8  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0429675 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1608  LemA family protein  27.71 
 
 
191 aa  60.5  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0508234  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0552  LemA family protein  24.53 
 
 
194 aa  60.1  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000000777562  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1334  LemA family protein  29.63 
 
 
188 aa  60.5  0.00000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.000000195542  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1289  hypothetical protein  30.95 
 
 
208 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0311306  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3233  hypothetical protein  29.19 
 
 
186 aa  59.7  0.00000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.791063  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0639  hypothetical protein  30.37 
 
 
182 aa  60.1  0.00000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1882  LemA family protein  26.99 
 
 
182 aa  59.7  0.00000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2637  LemA family protein  29.12 
 
 
184 aa  59.3  0.00000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.980645  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0012  LemA family protein  26.8 
 
 
212 aa  59.3  0.00000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.417656  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2032  LemA family protein  30.71 
 
 
194 aa  59.3  0.00000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2286  LemA family protein  27.59 
 
 
185 aa  58.9  0.00000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2447  LemA family protein  30.88 
 
 
189 aa  58.9  0.00000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.977457  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0398  hypothetical protein  29.87 
 
 
180 aa  58.5  0.00000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.43647  normal  0.0383484 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1494  LemA family protein  29.87 
 
 
180 aa  58.5  0.00000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.389059  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1256  LemA family protein  31.2 
 
 
194 aa  58.5  0.00000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0145592  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2465  LemA family protein  30.15 
 
 
191 aa  58.5  0.00000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1382  LemA family protein  29.87 
 
 
180 aa  58.5  0.00000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.617607  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2315  hypothetical protein  28.66 
 
 
185 aa  58.5  0.00000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.176373  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0756  cytoplasmic membrane protein  28.14 
 
 
186 aa  58.2  0.00000009  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0360  hypothetical protein  26.9 
 
 
196 aa  57.8  0.0000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.193957 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1628  hypothetical protein  22.99 
 
 
184 aa  57.4  0.0000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.301554  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2611  hypothetical protein  27.61 
 
 
186 aa  57.8  0.0000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.286576 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0378  LemA family protein  29.5 
 
 
185 aa  57.4  0.0000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000407408  decreased coverage  1.42653e-16 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1779  hypothetical protein  28.49 
 
 
185 aa  57.8  0.0000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0849  LemA family protein  27.45 
 
 
257 aa  57.4  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.133661 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1695  LemA family protein  27.81 
 
 
207 aa  58.2  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.392231  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5307  LemA family protein  27.81 
 
 
207 aa  58.2  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.271744  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0409  LemA family protein  26.9 
 
 
210 aa  57.4  0.0000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00662835 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1721  hypothetical protein  30.82 
 
 
244 aa  57  0.0000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.920503 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0513  LemA family protein  28.95 
 
 
184 aa  57.4  0.0000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4313  hypothetical protein  27.43 
 
 
183 aa  57  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.90869 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47030  Conserved hypothetical protein, LemA family  26.16 
 
 
204 aa  57  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0453  hypothetical protein  26.9 
 
 
210 aa  57  0.0000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0720  LemA family protein  27.84 
 
 
183 aa  57  0.0000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.198372  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1670  LemA family protein  27.11 
 
 
186 aa  57  0.0000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0320592  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3482  LemA family protein  31.94 
 
 
201 aa  56.6  0.0000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.399994 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0464  LemA family protein  29.67 
 
 
182 aa  56.2  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.415614 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4985  LemA family protein  27.33 
 
 
183 aa  56.6  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0070  LemA family protein  27.34 
 
 
181 aa  56.2  0.0000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3645  LemA family protein  26.92 
 
 
249 aa  55.8  0.0000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4208  hypothetical protein  26.74 
 
 
183 aa  55.8  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.735662  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1519  hypothetical protein  23.12 
 
 
201 aa  55.8  0.0000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.268793 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0607  LemA family protein  32.37 
 
 
208 aa  55.5  0.0000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1298  hypothetical protein  32.23 
 
 
202 aa  55.5  0.0000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0324719  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0555  LemA family protein  32.37 
 
 
208 aa  55.5  0.0000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.556411  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04653  LemA family protein  30.37 
 
 
212 aa  55.1  0.0000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0176024  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0658  LemA family protein  30.37 
 
 
206 aa  55.1  0.0000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.14267  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>