More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_6949 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_6949  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
254 aa  511  1e-144  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0174826 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7662  alpha/beta hydrolase fold protein  91.73 
 
 
254 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.208122  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0705  alpha/beta hydrolase fold  72.05 
 
 
254 aa  378  1e-104  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.052098 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0445  alpha/beta hydrolase fold  68.87 
 
 
257 aa  363  1e-99  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0377  alpha/beta hydrolase fold  69.38 
 
 
258 aa  344  8.999999999999999e-94  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.303616  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0409  alpha/beta hydrolase fold protein  68.34 
 
 
258 aa  339  2.9999999999999998e-92  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.328487 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0925  alpha/beta hydrolase fold  62.35 
 
 
255 aa  313  9.999999999999999e-85  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.497533  normal  0.160334 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3209  alpha/beta hydrolase fold  60.24 
 
 
250 aa  303  2.0000000000000002e-81  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0074  alpha/beta hydrolase fold protein  57.25 
 
 
255 aa  298  8e-80  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.204649 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5234  putative hydrolase  58.1 
 
 
249 aa  295  6e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.373086  normal  0.217404 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2178  alpha/beta hydrolase fold  57.87 
 
 
250 aa  291  9e-78  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.719184 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2134  alpha/beta hydrolase fold  57.87 
 
 
250 aa  290  1e-77  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.470034  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3146  alpha/beta hydrolase fold  58.66 
 
 
250 aa  288  4e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0833995  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3289  alpha/beta hydrolase fold  57.09 
 
 
250 aa  285  2.9999999999999996e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.931458  normal  0.0266601 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2581  alpha/beta hydrolase fold  59.45 
 
 
250 aa  280  2e-74  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.624662  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3917  alpha/beta hydrolase fold  58.43 
 
 
251 aa  275  7e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.827272  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1112  alpha/beta hydrolase fold  58.63 
 
 
261 aa  273  2.0000000000000002e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.64134 
 
 
-
 
NC_004310  BR1264  alpha/beta fold family hydrolase  57.09 
 
 
256 aa  272  3e-72  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.669274  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1567  alpha/beta hydrolase fold  56.35 
 
 
261 aa  271  7e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.151157 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0832  hydrolase, alpha/beta fold family protein  52.36 
 
 
257 aa  271  8.000000000000001e-72  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.100419  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1226  alpha/beta fold family hydrolase  56.3 
 
 
256 aa  269  2.9999999999999997e-71  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1731  alpha/beta hydrolase fold  55.12 
 
 
251 aa  263  2e-69  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1764  alpha/beta hydrolase fold protein  54.58 
 
 
261 aa  260  2e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.922652 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1925  alpha/beta hydrolase fold  55.34 
 
 
256 aa  255  4e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.167638  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2545  hydrolase  58.89 
 
 
261 aa  255  4e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.735165  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2615  alpha/beta hydrolase fold  46 
 
 
248 aa  207  1e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.989556  normal  0.03074 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2612  alpha/beta hydrolase fold  45.6 
 
 
250 aa  189  2.9999999999999997e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.899373  normal  0.0292589 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07970  lysophospholipase  41.02 
 
 
258 aa  147  1.0000000000000001e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3240  alpha/beta hydrolase fold protein  39.02 
 
 
243 aa  131  7.999999999999999e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0962986  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4138  alpha/beta hydrolase fold  39.6 
 
 
268 aa  122  5e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.511306  normal  0.651356 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4204  alpha/beta hydrolase fold  36.82 
 
 
272 aa  113  3e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.723787  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4204  alpha/beta hydrolase fold protein  40.17 
 
 
262 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3601  alpha/beta hydrolase fold protein  33.05 
 
 
264 aa  100  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.229176 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1411  alpha/beta hydrolase  33.02 
 
 
251 aa  97.4  2e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.731043  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2666  alpha/beta hydrolase fold  34.05 
 
 
257 aa  96.7  3e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1649  hypothetical protein  34.65 
 
 
235 aa  90.9  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.927129  normal  0.10741 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2300  putative hydrolase protein  31.82 
 
 
275 aa  90.1  3e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000890498 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22060  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  34.54 
 
 
262 aa  88.6  1e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00549421  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7519  alpha/beta hydrolase fold protein  30.42 
 
 
246 aa  85.5  8e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.458705  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0455  alpha/beta hydrolase fold  30.16 
 
 
250 aa  84.3  0.000000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5604  alpha/beta hydrolase fold protein  32.66 
 
 
268 aa  84  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.16228  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29750  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  42.98 
 
 
293 aa  83.6  0.000000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2567  putative hydrolase protein  29.59 
 
 
275 aa  83.2  0.000000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.230369  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2084  putative hydrolytic enzyme  29.57 
 
 
333 aa  82.4  0.000000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4478  Alpha/beta hydrolase fold  29.43 
 
 
272 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.785695  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5458  alpha/beta hydrolase fold protein  32.75 
 
 
270 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.306625  normal  0.0166355 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2505  alpha/beta family hydrolase  31.3 
 
 
279 aa  79.3  0.00000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4244  alpha/beta hydrolase fold  27.97 
 
 
331 aa  79.3  0.00000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0679936  hitchhiker  0.00909943 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24610  putative hydrolytic enzyme  28.57 
 
 
333 aa  79  0.00000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4878  alpha/beta hydrolase fold  31.95 
 
 
279 aa  78.2  0.0000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0658691 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4013  alpha/beta hydrolase fold protein  32.35 
 
 
266 aa  77.4  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.367148  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1653  chloride peroxidase  29.39 
 
 
277 aa  76.3  0.0000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2375  alpha/beta hydrolase fold protein  50 
 
 
274 aa  75.9  0.0000000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.153241  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1622  alpha/beta hydrolase fold  30.04 
 
 
284 aa  75.5  0.0000000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5284  alpha/beta hydrolase fold  30.47 
 
 
273 aa  75.1  0.0000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2714  alpha/beta hydrolase fold protein  42.11 
 
 
284 aa  75.1  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.216364  normal  0.0171077 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2126  alpha/beta hydrolase fold protein  45.76 
 
 
263 aa  74.7  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18880  hydrolase, alpha/beta fold family  28.74 
 
 
341 aa  74.7  0.000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.481755  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2482  alpha/beta hydrolase fold protein  31.87 
 
 
264 aa  74.7  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.32419  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0800  alpha/beta hydrolase fold  30.77 
 
 
267 aa  74.3  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.156653 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3257  alpha/beta hydrolase fold protein  40.46 
 
 
250 aa  74.3  0.000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2626  alpha/beta hydrolase fold  32.5 
 
 
330 aa  74.3  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0626174  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1265  alpha/beta hydrolase fold protein  38.17 
 
 
267 aa  73.6  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.463266  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0675  arylesterase  29.06 
 
 
272 aa  73.9  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0581  alpha/beta fold family hydrolase  28.28 
 
 
342 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.346537  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4461  alpha/beta hydrolase fold protein  30.91 
 
 
318 aa  73.9  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.598088  hitchhiker  0.00401352 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2856  alpha/beta fold family hydrolase  28.28 
 
 
441 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0648  alpha/beta hydrolase fold protein  30.53 
 
 
226 aa  73.6  0.000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0281045 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2740  alpha/beta fold family hydrolase  28.28 
 
 
404 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1746  alpha/beta fold family hydrolase  28.28 
 
 
439 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.294927  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1695  alpha/beta hydrolase fold protein  29.25 
 
 
284 aa  73.2  0.000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.194275  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1565  alpha/beta hydrolase fold  30.95 
 
 
363 aa  73.2  0.000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.461626  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2800  alpha/beta fold family hydrolase  28.28 
 
 
404 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4082  alpha/beta hydrolase fold  31.22 
 
 
272 aa  72.8  0.000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3372  alpha/beta hydrolase fold  28.9 
 
 
294 aa  72.8  0.000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.771296 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0351  alpha/beta hydrolase fold  28.81 
 
 
283 aa  72.4  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.825015  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2933  alpha/beta family hydrolase  28.09 
 
 
377 aa  72.8  0.000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.761124 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1269  alpha/beta hydrolase fold  27.85 
 
 
348 aa  72.8  0.000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.331641  normal  0.0800465 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0362  alpha/beta hydrolase fold protein  42.24 
 
 
323 aa  72.4  0.000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.737133 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5863  alpha/beta hydrolase fold  31.51 
 
 
270 aa  72.4  0.000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.648074  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4321  alpha/beta hydrolase fold  29.02 
 
 
280 aa  72  0.000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0798376 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  40.98 
 
 
265 aa  72  0.000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3605  alpha/beta hydrolase fold  27.02 
 
 
284 aa  71.6  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.753861  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3241  putative hydrolase or acyltransferase  27.31 
 
 
296 aa  71.2  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3325  putative hydrolase or acyltransferase  26.91 
 
 
296 aa  71.2  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0252993  normal  0.633189 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4536  alpha/beta hydrolase fold protein  29.74 
 
 
279 aa  71.2  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.821334  normal  0.0123379 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2251  Alpha/beta hydrolase fold-1  29.71 
 
 
284 aa  71.6  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.154511  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4696  alpha/beta hydrolase fold  26.46 
 
 
270 aa  71.2  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0911  alpha/beta hydrolase fold protein  30.04 
 
 
276 aa  71.6  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.139412 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3421  putative hydrolase or acyltransferase  26.69 
 
 
296 aa  71.6  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0121666 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7140  alpha/beta hydrolase fold protein  30.6 
 
 
425 aa  71.2  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2798  alpha/beta hydrolase fold protein  27.35 
 
 
270 aa  71.2  0.00000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3834  alpha/beta hydrolase fold  28.52 
 
 
270 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.441877 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0572  alpha/beta hydrolase fold  42.86 
 
 
266 aa  71.6  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4540  alpha/beta fold family hydrolase  26.69 
 
 
270 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2862  alpha/beta fold family hydrolase  28.19 
 
 
877 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0263  Alpha/beta hydrolase fold  39.5 
 
 
266 aa  70.9  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.191481  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1166  alpha/beta hydrolase fold protein  33.87 
 
 
333 aa  70.9  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.110517 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2263  alpha/beta hydrolase fold  31.4 
 
 
277 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1025  alpha/beta hydrolase fold protein  41.03 
 
 
301 aa  70.9  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>